Геном прокариот/Материалы:NC 001263

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_001263            2648638 bp    DNA     circular BCT 06-JUN-2007
   DEFINITION  Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1, complete sequence.
   ACCESSION   NC_001263
   VERSION     NC_001263.1  GI:15805042
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Deinococcus radiodurans R1
     ORGANISM  Deinococcus radiodurans R1
               Bacteria; Deinococcus-Thermus; Deinococci; Deinococcales;
               Deinococcaceae; Deinococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2648638)
     AUTHORS   White,O., Eisen,J.A., Heidelberg,J.F., Hickey,E.K., Peterson,J.D.,
               Dodson,R.J., Haft,D.H., Gwinn,M.L., Nelson,W.C., Richardson,D.L.,
               Moffat,K.S., Qin,H., Jiang,L., Pamphile,W., Crosby,M., Shen,M.,
               Vamathevan,J.J., Lam,P., McDonald,L., Utterback,T., Zalewski,C.,
               Makarova,K.S., Aravind,L., Daly,M.J., Minton,K.W.,
               Fleischmann,R.D., Ketchum,K.A., Nelson,K.E., Salzberg,S.,
               Smith,H.O., Venter,J.C. and Fraser,C.M.
     TITLE     Genome sequence of the radioresistant bacterium Deinococcus
               radiodurans R1
     JOURNAL   Science 286 (5444), 1571-1577 (1999)
      PUBMED   10567266
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2648638)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-SEP-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2648638)
     AUTHORS   White,O., Eisen,J.A., Heidelberg,J.F., Hickey,E.K., Peterson,J.D.,
               Dodson,R.J., Haft,D.H., Gwinn,M.L., Nelson,W.C., Richardson,D.L.,
               Moffat,K.S., Qin,H., Jiang,L., Pamphile,W., Crosby,M., Shen,M.,
               Vamathevan,J.J., Lam,P., McDonald,L., Utterback,T., Zalewski,C.,
               Makarova,K.S., Aravind,L., Daly,M.J., Minton,K.W.,
               Fleischmann,R.D., Ketchum,K.A., Nelson,K.E., Salzberg,S.,
               Smith,H.O., Venter,J.C. and Fraser,C.M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-NOV-1999) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE000513.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
21938	22010	-	73	15805042	DR_t01	-	^{17 Phe tRNA}
22035	22107	-	73	15805042	DR_t02	-	^{06 Asp tRNA}
41882	41954	+	73	15805042	DR_t03	-	^{10 Lys tRNA}
57084	57154	-	71	15805042	DR_t04	-	^{05 Gln tRNA}
68827	68906	+	80	15805042	DR_t05	-	^{11 Arg tRNA}
84836	86337	+	1502	15805042	DR_r01	-	16S ribosomal RNA
146086	146159	+	74	15805042	DR_t06	-	^{11 Arg tRNA}
249750	249822	-	73	15805042	DR_t0253	-	^{06 Asp tRNA}
254392	254515	+	124	15805042	DR_r03	-	5S ribosomal RNA
254523	254595	+	73	15805042	DR_t07	-	^{01 Gly tRNA}
294646	294718	-	73	15805042	DR_t08	-	^{02 Ala tRNA}
339245	339324	-	80	15805042	DR_t09	-	^{15 Leu tRNA}
498343	498414	-	72	15805042	DR_t10	-	^{13 Val tRNA}
498435	498507	-	73	15805042	DR_t11	-	^{16 Met tRNA}
518331	518404	+	74	15805042	DR_t12	-	^{11 Arg tRNA}
564388	564459	+	72	15805042	DR_t13	-	^{02 Ala tRNA}
564574	564645	-	72	15805042	DR_t14	-	^{13 Val tRNA}
576883	576953	+	71	15805042	DR_t15	-	^{19 Cys tRNA}
576983	577054	+	72	15805042	DR_t16	-	^{13 Val tRNA}
607622	607708	+	87	15805042	DR_t0595	-	^{08 Ser tRNA}
652637	652707	-	71	15805042	DR_t17	-	^{01 Gly tRNA}
652728	652801	-	74	15805042	DR_t18	-	^{03 Pro tRNA}
863725	863806	+	82	15805042	DR_t0852	-	^{15 Leu tRNA}
886348	886421	+	74	15805042	DR_t19	-	^{14 Ile tRNA}
936753	936835	-	83	15805042	DR_t20	-	^{15 Leu tRNA}
936888	936961	-	74	15805042	DR_t21	-	^{09 His tRNA}
1127817	1127890	-	74	15805042	DR_t22	-	^{03 Pro tRNA}
1271535	1271616	-	82	15805042	DR_t1264	-	^{18 Tyr tRNA}
1272041	1272112	-	72	15805042	DR_t23	-	^{06 Asp tRNA}
1317108	1317187	+	80	15805042	DR_t24	-	^{15 Leu tRNA}
1485608	1485679	-	72	15805042	DR_t25	-	^{12 Thr tRNA}
1655398	1655471	-	74	15805042	DR_t26	-	^{16 Met tRNA}
1781166	1781244	-	79	15805042	DR_t27	-	^{02 Ala tRNA}
2005410	2005480	-	71	15805042	DR_t28	-	^{05 Gln tRNA}
2037771	2037842	-	72	15805042	DR_t29	-	^{10 Lys tRNA}
2045580	2045666	+	87	15805042	DR_t30	-	^{08 Ser tRNA}
2063549	2063620	-	72	15805042	DR_t31	-	^{12 Thr tRNA}
2063627	2063699	-	73	15805042	DR_t32	-	^{01 Gly tRNA}
2063707	2063789	-	83	15805042	DR_t33	-	^{18 Tyr tRNA}
2063839	2063911	-	73	15805042	DR_t34	-	^{12 Thr tRNA}
2070898	2070969	+	72	15805042	DR_t35	-	^{07 Asn tRNA}
2118380	2118461	-	82	15805042	DR_t36	-	^{15 Leu tRNA}
2181630	2181714	+	85	15805042	DR_t37	-	^{08 Ser tRNA}
2181747	2181836	+	90	15805042	DR_t38	-	^{08 Ser tRNA}
2181867	2181940	+	74	15805042	DR_t39	-	^{11 Arg tRNA}
2186731	2186804	+	74	15805042	DR_t40	-	^{03 Pro tRNA}
2245003	2245082	-	80	15805042	DR_t41	-	^{01 Gly tRNA}
2245090	2245213	-	124	15805042	DR_r04	-	5S ribosomal RNA
2245319	2248200	-	2882	15805042	DR_r05	-	23S ribosomal RNA
2285518	2287019	-	1502	15805042	DR_r06	-	16S ribosomal RNA
2406652	2406724	-	73	15805042	DR_t42	-	^{20 Trp tRNA}
2467934	2469435	-	1502	15805042	DR_r07	-	16S ribosomal RNA
2530438	2530509	+	72	15805042	DR_t43	-	^{04 Glu tRNA}
2584748	2584820	-	73	15805042	DR_t44	-	^{01 Gly tRNA}
2584828	2584951	-	124	15805042	DR_r08	-	5S ribosomal RNA
2585058	2587938	-	2881	15805042	DR_r09	-	23S ribosomal RNA