Геном прокариот/Материалы:NC 003902

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_003902            5076188 bp    DNA     circular BCT 02-DEC-2005
   DEFINITION  Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913, complete
               genome.
   ACCESSION   NC_003902
   VERSION     NC_003902.1  GI:21229478
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913
     ORGANISM  Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xanthomonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 5076188)
     AUTHORS   da Silva,A.C.R., Ferro,J.A., Reinach,F.C., Farah,C.S., Furlan,L.R.,
               Quaggio,R.B., Monteiro-Vitorello,C.B., Van Sluys,M.A., Almeida,N.F.
               Jr., Alves,L.M.C., do Amaral,A.M., Bertolini,M.C., Camargo,L.E.A.,
               Camarotte,G., Cannavan,F., Cardozo,J., Chambergo,F., Ciapina,L.P.,
               Cicarelli,R.M.B., Coutinho,L.L., Cursino-Santos,J.R., El-Dorry,H.,
               Faria,J.B., Ferreira,A.J.S., Ferreira,R.C.C., Ferro,M.I.T.,
               Formighieri,E.F., Franco,M.C., Greggio,C.C., Gruber,A.,
               Katsuyama,A.M., Kishi,L.T., Leite,R.P. Jr., Lemos,E.G.M.,
               Lemos,M.V.F., Locali,E.C., Machado,M.A., Madeira,A.M.B.N.,
               Martinez-Rossi,N.M., Martins,E.C., Meidanis,J., Menck,C.F.M.,
               Miyaki,C.Y., Moon,D.H., Moreira,L.M., Novo,M.T.M., Okura,V.K.,
               Oliveira,M.C., Oliveira,V.R., Pereira,H.A. Jr., Rossi,A.,
               Sena,J.A.D., Silva,C., de Souza,R.F., Spinola,L.A.F., Takita,M.A.,
               Tamura,R.E., Teixeira,E.C., Tezza,R.I.D., Trindade dos Santos,M.,
               Truffi,D., Tsai,S.M., White,F.F., Setubal,J.C. and Kitajima,J.P.
     TITLE     Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with
               differing host specificities
     JOURNAL   Nature 417 (6887), 459-463 (2002)
      PUBMED   12024217
   REFERENCE   2  (bases 1 to 5076188)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 5076188)
     AUTHORS   da Silva,A.C.R., Ferro,J.A., Reinach,F.C., Farah,C.S., Furlan,L.R.,
               Quaggio,R.B., Monteiro-Vitorello,C.B., Van Sluys,M.A., Almeida,N.F.
               Jr., Alves,L.M.C., do Amaral,A.M., Bertolini,M.C., Camargo,L.E.A.,
               Camarotte,G., Cannavan,F., Cardozo,J., Chambergo,F., Ciapina,L.P.,
               Cicarelli,R.M.B., Coutinho,L.L., Cursino-Santos,J.R., El-Dorry,H.,
               Faria,J.B., Ferreira,A.J.S., Ferreira,R.C.C., Ferro,M.I.T.,
               Formighieri,E.F., Franco,M.C., Greggio,C.C., Gruber,A.,
               Katsuyama,A.M., Kishi,L.T., Leite,R.P. Jr., Lemos,E.G.M.,
               Lemos,M.V.F., Locali,E.C., Machado,M.A., Madeira,A.M.B.N.,
               Martinez-Rossi,N.M., Martins,E.C., Meidanis,J., Menck,C.F.M.,
               Miyaki,C.Y., Moon,D.H., Moreira,L.M., Novo,M.T.M., Okura,V.K.,
               Oliveira,M.C., Oliveira,V.R., Pereira,H.A. Jr., Rossi,A.,
               Sena,J.A.D., Silva,C., de Souza,R.F., Spinola,L.A.F., Takita,M.A.,
               Tamura,R.E., Teixeira,E.C., Tezza,R.I.D., Trindade dos Santos,M.,
               Truffi,D., Tsai,S.M., White,F.F., Setubal,J.C. and Kitajima,J.P.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-NOV-2001) Departmento de Bioquimica, Universidade de
               Sao Paulo, Av. Prof. Lineu Prestes 748, Sao Paulo, SP 05508-900,
               Brazil
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE008922.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
465184	465260	+	77	21229478	XCC0391	-	^{11 Arg tRNA}
578524	578598	-	75	21229478	XCC0478	-	^{05 Gln tRNA}
578653	578729	-	77	21229478	XCC0479	-	^{16 Met tRNA}
857932	858273	+	342	21229478	XCC0713	-	RNA subunit of RNase P
1032341	1032417	+	77	21229478	XCC0872	-	^{05 Gln tRNA}
1036251	1036336	+	86	21229478	XCC0877	-	^{18 Tyr tRNA}
1036366	1036439	+	74	21229478	XCC0878	-	^{01 Gly tRNA}
1036473	1036548	+	76	21229478	XCC0879	-	^{12 Thr tRNA}
1037892	1037967	+	76	21229478	XCC0881	-	^{20 Trp tRNA}
1127932	1128008	+	77	21229478	XCC0969	-	^{03 Pro tRNA}
1128052	1128128	+	77	21229478	XCC0970	-	^{11 Arg tRNA}
1128160	1128236	+	77	21229478	XCC0971	-	^{09 His tRNA}
1128320	1128395	+	76	21229478	XCC0972	-	^{10 Lys tRNA}
1128473	1128557	+	85	21229478	XCC0973	-	^{15 Leu tRNA}
1135299	1135373	+	75	21229478	XCC0979	-	^{13 Val tRNA}
1135403	1135479	+	77	21229478	XCC0980	-	^{06 Asp tRNA}
1135576	1135652	+	77	21229478	XCC0981	-	^{06 Asp tRNA}
1144017	1144107	+	91	21229478	XCC0990	-	^{08 Ser tRNA}
1150246	1150338	+	93	21229478	XCC1000	-	^{08 Ser tRNA}
1174192	1174266	+	75	21229478	XCC1025	-	^{13 Val tRNA}
1348086	1348161	+	76	21229478	XCC1158	-	^{12 Thr tRNA}
1634901	1634987	-	87	21229478	XCC1403	-	^{15 Leu tRNA}
1710901	1711297	-	397	21229478	XCC1464	-	tmRNA
1774607	1774693	-	87	21229478	XCC1516	-	^{15 Leu tRNA}
1865175	1865264	+	90	21229478	XCC1596	-	^{08 Ser tRNA}
2004902	2004994	+	93	21229478	XCC1726	-	^{08 Ser tRNA}
2011766	2011842	-	77	21229478	XCC1732	-	^{11 Arg tRNA}
2011939	2012015	-	77	21229478	XCC1733	-	^{11 Arg tRNA}
2052260	2052334	-	75	21229478	XCC1765	-	^{04 Glu tRNA}
2081567	2081643	+	77	21229478	XCC1792	-	^{11 Arg tRNA}
2463969	2464052	+	84	21229478	XCC2091	-	^{15 Leu tRNA}
2496862	2496937	-	76	21229478	XCC2111	-	^{01 Gly tRNA}
2497018	2497091	-	74	21229478	XCC2112	-	^{19 Cys tRNA}
2497161	2497236	-	76	21229478	XCC2113	-	^{01 Gly tRNA}
2536273	2536348	+	76	21229478	XCC2146	-	^{02 Ala tRNA}
2536396	2536471	+	76	21229478	XCC2147	-	^{04 Glu tRNA}
2537225	2537300	+	76	21229478	XCC2148	-	^{02 Ala tRNA}
2537354	2537429	+	76	21229478	XCC2149	-	^{04 Glu tRNA}
2538171	2538257	-	87	21229478	XCC2151	-	^{15 Leu tRNA}
2632817	2632893	+	77	21229478	XCC2235	-	^{03 Pro tRNA}
2716155	2716230	+	76	21229478	XCC2310	-	^{02 Ala tRNA}
2888681	2888756	-	76	21229478	XCC2429	-	^{17 Phe tRNA}
2917971	2918047	-	77	21229478	XCC2455	-	^{03 Pro tRNA}
2954810	2954884	-	75	21229478	XCC2484	-	^{13 Val tRNA}
2957737	2957813	-	77	21229478	XCC2487	-	^{07 Asn tRNA}
2988109	2988185	-	77	21229478	XCC2514	-	^{16 Met tRNA}
3003340	3003424	-	85	21229478	XCC2529	-	^{15 Leu tRNA}
3560344	3560419	-	76	21229478	XCC3013	-	^{10 Lys tRNA}
3728582	3728655	-	74	21229478	XCC3147	-	^{01 Gly tRNA}
4441155	4441230	-	76	21229478	XCC3734	-	^{16 Met tRNA}
4557675	4557793	-	119	21229478	XCC3836	-	SSU 5S ribosomal RNA
4557919	4560801	-	2883	21229478	XCC3837	-	SSU 23S ribosomal RNA
4561029	4561105	-	77	21229478	XCC3838	-	^{14 Ile tRNA}
4561125	4561200	-	76	21229478	XCC3839	-	^{02 Ala tRNA}
4561295	4562841	-	1547	21229478	XCC3840	-	SSU 16S ribosomal RNA
4663776	4663851	-	76	21229478	XCC3935	-	^{12 Thr tRNA}
4945543	4945661	-	119	21229478	XCC4148	-	SSU 5S ribosomal RNA
4945787	4948669	-	2883	21229478	XCC4149	-	SSU 23S ribosomal RNA
4948897	4948973	-	77	21229478	XCC4150	-	^{14 Ile tRNA}
4948993	4949068	-	76	21229478	XCC4151	-	^{02 Ala tRNA}
4949163	4950709	-	1547	21229478	XCC4152	-	SSU 16S ribosomal RNA