Геном прокариот/Материалы:NC 004307

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_004307            2256640 bp    DNA     circular BCT 17-JAN-2006
   DEFINITION  Bifidobacterium longum NCC2705, complete genome.
   ACCESSION   NC_004307
   VERSION     NC_004307.2  GI:58036264
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Bifidobacterium longum NCC2705
     ORGANISM  Bifidobacterium longum NCC2705
               Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Bifidobacteriales;
               Bifidobacteriaceae; Bifidobacterium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2256640)
     AUTHORS   Schell,M.A., Karmirantzou,M., Snel,B., Vilanova,D., Berger,B.,
               Pessi,G., Zwahlen,M.C., Desiere,F., Bork,P., Delley,M.,
               Pridmore,R.D. and Arigoni,F.
     TITLE     The genome sequence of Bifidobacterium longum reflects its
               adaptation to the human gastrointestinal tract
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (22), 14422-14427 (2002)
      PUBMED   12381787
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2256640)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (02-OCT-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2256640)
     AUTHORS   Schell,M.A., Karmirantzou,M., Snel,B., Vilanova,D., Berger,B.,
               Pessi,G., Zwahlen,M.-C., Desiere,F., Bork,P., Delley,M.,
               Pridmore,D. and Arigoni,F.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (27-AUG-2002) Bioscience, Nestle Research Center, P.O.
               Box 44, Lausanne 26 1000, Switzerland
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE014295.
               On Jan 21, 2005 this sequence version replaced gi:23464628.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
115187	115260	+	74	58036264	BLt01	-	^{13 Val tRNA}
159243	160772	+	1530	58036264	BLr01	-	16S ribosomal RNA
161203	164268	+	3066	58036264	BLr07	-	23S ribosomal RNA
164437	164556	+	120	58036264	BLr10	-	5S ribosomal RNA
206545	206916	+	372	58036264	BLs01	-	tmRNA
207382	207457	-	76	58036264	BLt02	-	^{20 Trp tRNA}
382849	382924	-	76	58036264	BLt03	-	^{07 Asn tRNA}
382968	383040	-	73	58036264	BLt04	-	^{07 Asn tRNA}
440078	440150	-	73	58036264	BLt05	-	^{07 Asn tRNA}
503549	503624	+	76	58036264	BLt06	-	^{01 Gly tRNA}
503649	503719	+	71	58036264	BLt07	-	^{19 Cys tRNA}
503761	503835	+	75	58036264	BLt08	-	^{13 Val tRNA}
503881	503953	+	73	58036264	BLt09	-	^{13 Val tRNA}
503985	504060	+	76	58036264	BLt10	-	^{01 Gly tRNA}
521008	521084	+	77	58036264	BLt11	-	^{03 Pro tRNA}
648764	648851	+	88	58036264	BLt12	-	^{15 Leu tRNA}
747296	747369	-	74	58036264	BLt13	-	^{11 Arg tRNA}
747399	747472	-	74	58036264	BLt14	-	^{11 Arg tRNA}
775646	775716	+	71	58036264	BLt15	-	^{05 Gln tRNA}
778709	778784	+	76	58036264	BLt16	-	^{02 Ala tRNA}
778871	778946	+	76	58036264	BLt17	-	^{02 Ala tRNA}
793729	793805	+	77	58036264	BLt18	-	^{03 Pro tRNA}
804390	804463	-	74	58036264	BLt19	-	^{15 Leu tRNA}
841055	841136	-	82	58036264	BLt20	-	^{15 Leu tRNA}
937056	937131	+	76	58036264	BLt21	-	^{09 His tRNA}
981177	981253	-	77	58036264	BLt22	-	^{11 Arg tRNA}
1202433	1202505	+	73	58036264	BLt23	-	^{12 Thr tRNA}
1202593	1202676	+	84	58036264	BLt24	-	^{15 Leu tRNA}
1208139	1208211	+	73	58036264	BLt25	-	^{12 Thr tRNA}
1264390	1264465	-	76	58036264	BLt26	-	^{13 Val tRNA}
1264514	1264585	-	72	58036264	BLt27	-	^{13 Val tRNA}
1264632	1264704	-	73	58036264	BLt28	-	^{01 Gly tRNA}
1280591	1280666	-	76	58036264	BLt29	-	^{11 Arg tRNA}
1295466	1295542	+	77	58036264	BLt30	-	^{16 Met tRNA}
1350001	1350074	-	74	58036264	BLt31	-	^{10 Lys tRNA}
1388875	1388950	-	76	58036264	BLt32	-	^{10 Lys tRNA}
1410594	1410681	+	88	58036264	BLt33	-	^{08 Ser tRNA}
1414391	1414464	+	74	58036264	BLt34	-
1424793	1424867	-	75	58036264	BLt35	-	^{05 Gln tRNA}
1424904	1424979	-	76	58036264	BLt36	-	^{04 Glu tRNA}
1524142	1524215	-	74	58036264	BLt37	-	^{01 Gly tRNA}
1534802	1534887	+	86	58036264	BLt38	-	^{15 Leu tRNA}
1606163	1606236	+	74	58036264	BLt39	-	^{14 Ile tRNA}
1606279	1606351	+	73	58036264	BLt40	-	^{02 Ala tRNA}
1646835	1646911	-	77	58036264	BLt41	-	^{12 Thr tRNA}
1705902	1707431	+	1530	58036264	BLr03	-	16S ribosomal RNA
1707861	1710926	+	3066	58036264	BLr06	-	23S ribosomal RNA
1711095	1711215	+	121	58036264	BLr12	-	5S ribosomal RNA
1712083	1713614	+	1532	58036264	BLr04	-	16S ribosomal RNA
1714037	1717102	+	3066	58036264	BLr05	-	23S ribosomal RNA
1717271	1717390	+	120	58036264	BLr11	-	5S ribosomal RNA
1769952	1770027	+	76	58036264	BLt42	-	^{02 Ala tRNA}
1905665	1905740	+	76	58036264	BLt43	-	^{20 Trp tRNA}
1908902	1910431	+	1530	58036264	BLr02	-	16S ribosomal RNA
1910860	1913926	+	3067	58036264	BLr08	-	23S ribosomal RNA
1914095	1914214	+	120	58036264	BLr09	-	5S ribosomal RNA
1936132	1936205	+	74	58036264	BLt44	-	^{01 Gly tRNA}
1971396	1971477	+	82	58036264	BLt45	-	^{18 Tyr tRNA}
1971479	1971550	+	72	58036264	BLt46	-	^{12 Thr tRNA}
1971555	1971631	+	77	58036264	BLt47	-	^{16 Met tRNA}
1979312	1979401	+	90	58036264	BLt48	-	^{08 Ser tRNA}
2016025	2016112	+	88	58036264	BLt49	-	^{08 Ser tRNA}
2047072	2047159	+	88	58036264	BLt50	-	^{08 Ser tRNA}
2068637	2068713	-	77	58036264	BLt51	-	^{03 Pro tRNA}
2085402	2085473	-	72	58036264	BLt52	-	^{04 Glu tRNA}
2087969	2088042	+	74	58036264	BLt53	-	^{06 Asp tRNA}
2088090	2088165	+	76	58036264	BLt54	-	^{17 Phe tRNA}
2110850	2110926	+	77	58036264	BLt55	-	^{06 Asp tRNA}
2130626	2130699	+	74	58036264	BLt56	-	^{16 Met tRNA}
2171440	2171512	+	73	58036264	BLt57	-	^{11 Arg tRNA}