Геном прокариот/Материалы:NC 004567

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_004567            3308274 bp    DNA     circular BCT 21-JUN-2007
   DEFINITION  Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome.
   ACCESSION   NC_004567
   VERSION     NC_004567.1  GI:28376974
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Lactobacillus plantarum WCFS1
     ORGANISM  Lactobacillus plantarum WCFS1
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Lactobacillaceae;
               Lactobacillus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3308274)
     AUTHORS   Kleerebezem,M., Boekhorst,J., van Kranenburg,R., Molenaar,D.,
               Kuipers,O.P., Leer,R., Tarchini,R., Peters,S.A., Sandbrink,H.M.,
               Fiers,M.W., Stiekema,W., Lankhorst,R.M., Bron,P.A., Hoffer,S.M.,
               Groot,M.N., Kerkhoven,R., de Vries,M., Ursing,B., de Vos,W.M. and
               Siezen,R.J.
     TITLE     Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum WCFS1
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (4), 1990-1995 (2004)
      PUBMED   12566566
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3308274)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3308274)
     CONSRTM   NCBI Microbial Genomes Annotation Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (25-JUN-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AL935263.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
37371	37446	-	76	28376974	lp_tRNA01	-	^{10 Lys tRNA}
502863	504433	+	1571	28376974	lp_rRNA01	-	16S ribosomal RNA
504518	504592	+	75	28376974	lp_tRNA02	-	^{14 Ile tRNA}
504634	504706	+	73	28376974	lp_tRNA03	-	^{02 Ala tRNA}
504868	507787	+	2920	28376974	lp_rRNA02	-	23S ribosomal RNA
507858	507976	+	119	28376974	lp_rRNA03	-	5S ribosomal RNA
507981	508053	+	73	28376974	lp_tRNA04	-	^{07 Asn tRNA}
508099	508171	+	73	28376974	lp_tRNA05	-	^{12 Thr tRNA}
511258	511340	+	83	28376974	lp_tRNA06	-	^{18 Tyr tRNA}
511350	511421	+	72	28376974	lp_tRNA07	-	^{05 Gln tRNA}
531682	531769	+	88	28376974	lp_tRNA08	-	^{15 Leu tRNA}
591410	591480	-	71	28376974	lp_tRNA09	-	^{01 Gly tRNA}
593365	593450	-	86	28376974	lp_tRNA10	-	^{14 Ile tRNA}
606324	606396	+	73	28376974	lp_tRNA11	-	^{07 Asn tRNA}
722170	722244	-	75	28376974	lp_tRNA12	-	^{11 Arg tRNA}
774992	775063	+	72	28376974	lp_tRNA13	-	^{07 Asn tRNA}
934819	934900	+	82	28376974	lp_tRNA14	-	^{15 Leu tRNA}
934904	934976	+	73	28376974	lp_tRNA15	-	^{12 Thr tRNA}
935001	935072	+	72	28376974	lp_tRNA16	-	^{01 Gly tRNA}
935081	935166	+	86	28376974	lp_tRNA17	-	^{15 Leu tRNA}
935177	935250	+	74	28376974	lp_tRNA18	-	^{11 Arg tRNA}
935258	935331	+	74	28376974	lp_tRNA19	-	^{03 Pro tRNA}
935382	935455	+	74	28376974	lp_tRNA20	-	^{03 Pro tRNA}
1061664	1061736	+	73	28376974	lp_tRNA21	-	^{11 Arg tRNA}
1169165	1170735	+	1571	28376974	lp_rRNA04	-	16S ribosomal RNA
1170820	1170894	+	75	28376974	lp_tRNA22	-	^{14 Ile tRNA}
1170936	1171008	+	73	28376974	lp_tRNA23	-	^{02 Ala tRNA}
1171170	1174089	+	2920	28376974	lp_rRNA05	-	23S ribosomal RNA
1174160	1174278	+	119	28376974	lp_rRNA06	-	5S ribosomal RNA
1174283	1174355	+	73	28376974	lp_tRNA24	-	^{07 Asn tRNA}
1174374	1174463	+	90	28376974	lp_tRNA25	-	^{08 Ser tRNA}
1174485	1174557	+	73	28376974	lp_tRNA26	-	^{04 Glu tRNA}
1174562	1174634	+	73	28376974	lp_tRNA27	-	^{13 Val tRNA}
1174690	1174762	+	73	28376974	lp_tRNA28	-	^{17 Phe tRNA}
1174768	1174850	+	83	28376974	lp_tRNA29	-	^{18 Tyr tRNA}
1174859	1174932	+	74	28376974	lp_tRNA30	-	^{20 Trp tRNA}
1174938	1175010	+	73	28376974	lp_tRNA31	-	^{09 His tRNA}
1175018	1175089	+	72	28376974	lp_tRNA32	-	^{05 Gln tRNA}
1175112	1175182	+	71	28376974	lp_tRNA33	-	^{19 Cys tRNA}
1175238	1175325	+	88	28376974	lp_tRNA34	-	^{15 Leu tRNA}
1252319	1252391	-	73	28376974	lp_tRNA35	-	^{09 His tRNA}
1252780	1252863	-	84	28376974	lp_tRNA36	-	^{15 Leu tRNA}
1271644	1271714	+	71	28376974	lp_tRNA37	-	^{01 Gly tRNA}
1271771	1271848	+	78	28376974	lp_tRNA38	-	^{06 Asp tRNA}
1448543	1448616	-	74	28376974	lp_tRNA39	-	^{11 Arg tRNA}
1876412	1876499	+	88	28376974	lp_tRNA40	-	^{08 Ser tRNA}
2013685	2013762	-	78	28376974	lp_tRNA41	-	^{06 Asp tRNA}
2013765	2013838	-	74	28376974	lp_tRNA42	-	^{16 Met tRNA}
2013848	2013920	-	73	28376974	lp_tRNA43	-	^{04 Glu tRNA}
2013940	2014027	-	88	28376974	lp_tRNA44	-	^{08 Ser tRNA}
2014032	2014106	-	75	28376974	lp_tRNA45	-	^{14 Ile tRNA}
2014113	2014183	-	71	28376974	lp_tRNA46	-	^{01 Gly tRNA}
2014196	2014268	-	73	28376974	lp_tRNA47	-	^{17 Phe tRNA}
2014298	2014372	-	75	28376974	lp_tRNA48	-	^{06 Asp tRNA}
2014376	2014449	-	74	28376974	lp_tRNA49	-	^{16 Met tRNA}
2014456	2014545	-	90	28376974	lp_tRNA50	-	^{08 Ser tRNA}
2014585	2014658	-	74	28376974	lp_tRNA51	-	^{16 Met tRNA}
2014674	2014747	-	74	28376974	lp_tRNA52	-	^{16 Met tRNA}
2014779	2014852	-	74	28376974	lp_tRNA53	-	^{03 Pro tRNA}
2014858	2014931	-	74	28376974	lp_tRNA54	-	^{11 Arg tRNA}
2014942	2015027	-	86	28376974	lp_tRNA55	-	^{15 Leu tRNA}
2015043	2015114	-	72	28376974	lp_tRNA56	-	^{01 Gly tRNA}
2015131	2015203	-	73	28376974	lp_tRNA57	-	^{12 Thr tRNA}
2015298	2015370	-	73	28376974	lp_tRNA58	-	^{10 Lys tRNA}
2015372	2015447	-	76	28376974	lp_tRNA59	-	^{13 Val tRNA}
2015452	2015570	-	119	28376974	lp_rRNA16	-	5S ribosomal RNA
2015625	2015697	-	73	28376974	lp_tRNA60	-	^{10 Lys tRNA}
2015699	2015774	-	76	28376974	lp_tRNA61	-	^{13 Val tRNA}
2015779	2015897	-	119	28376974	lp_rRNA07	-	5S ribosomal RNA
2015968	2018887	-	2920	28376974	lp_rRNA08	-	23S ribosomal RNA
2019093	2020663	-	1571	28376974	lp_rRNA09	-	16S ribosomal RNA
2186916	2186987	-	72	28376974	lp_tRNA62	-	^{20 Trp tRNA}
2187057	2187129	-	73	28376974	lp_tRNA63	-	^{07 Asn tRNA}
2199001	2199086	+	86	28376974	lp_tRNA64	-	^{14 Ile tRNA}
2199699	2199772	+	74	28376974	lp_tRNA65	-	^{16 Met tRNA}
2199778	2199848	+	71	28376974	lp_tRNA66	-	^{01 Gly tRNA}
2204049	2204121	-	73	28376974	lp_tRNA67	-	^{04 Glu tRNA}
2204512	2204584	+	73	28376974	lp_tRNA68	-	^{05 Gln tRNA}
2498504	2498576	-	73	28376974	lp_tRNA69	-	^{12 Thr tRNA}
2498679	2498797	-	119	28376974	lp_rRNA10	-	5S ribosomal RNA
2498868	2501787	-	2920	28376974	lp_rRNA11	-	23S ribosomal RNA
2501993	2503563	-	1571	28376974	lp_rRNA12	-	16S ribosomal RNA
2941615	2941733	-	119	28376974	lp_rRNA13	-	5S ribosomal RNA
2941804	2944723	-	2920	28376974	lp_rRNA14	-	23S ribosomal RNA
2944929	2946499	-	1571	28376974	lp_rRNA15	-	16S ribosomal RNA
3039279	3039351	+	73	28376974	lp_tRNA70	-	^{02 Ala tRNA}