Геном прокариот/Материалы:NC 005042

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_005042            1751080 bp    DNA     circular BCT 24-JUL-2006
   DEFINITION  Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375, complete
               genome.
   ACCESSION   NC_005042
   VERSION     NC_005042.1  GI:33239452
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375
               (Prochlorococcus marinus SS120)
     ORGANISM  Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375
               Bacteria; Cyanobacteria; Prochlorales; Prochlorococcaceae;
               Prochlorococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1751080)
     AUTHORS   Dufresne,A., Salanoubat,M., Partensky,F., Artiguenave,F.,
               Axmann,I.M., Barbe,V., Duprat,S., Galperin,M.Y., Koonin,E.V., Le
               Gall,F., Makarova,K.S., Ostrowski,M., Oztas,S., Robert,C.,
               Rogozin,I.B., Scanlan,D.J., Tandeau de Marsac,N., Weissenbach,J.,
               Wincker,P., Wolf,Y.I. and Hess,W.R.
     TITLE     Genome sequence of the cyanobacterium Prochlorococcus marinus
               SS120, a nearly minimal oxyphototrophic genome
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (17), 10020-10025 (2003)
      PUBMED   12917486
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1751080)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (25-JUL-2003) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1751080)
     AUTHORS   Dufresne,A., Salanoubat,M., Partensky,F., Artiguenave,F.,
               Axmann,I.M., Barbe,V., Duprat,S., Galperin,M.Y., Koonin,E.V., Le
               Gall,F., Makarova,K.S., Ostrowski,M., Oztas,S., Robert,C.,
               Rogozin,I.B., Scanlan,D.J., Tandeau de Marsac,N., Weissenbach,J.,
               Wincker,P., Wolf,Y.I. and Hess,W.R.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-MAY-2003) UMR 7127 CNRS et Universite Pierre et Marie
               Curie, Station Biologique de Roscoff, Place Georges Tessier BP74,
               Roscoff 29682, France
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE017126.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
75321	75579	-	259	33239452	Pros01	-	tmRNA, 10Sa RNA, SsrA (precursor permuted)
84970	85051	-	82	33239452	Prot01	-	^{15 Leu tRNA}
146967	147038	+	72	33239452	Prot02	-	^{07 Asn tRNA}
262281	262362	-	82	33239452	Prot03	-	^{15 Leu tRNA}
282704	282777	-	74	33239452	Prot04	-	^{11 Arg tRNA}
298481	298553	-	73	33239452	Prot05	-	^{16 Met tRNA}
334895	334970	-	76	33239452	Prot06	-	^{17 Phe tRNA}
345079	345150	-	72	33239452	Prot07	-	^{12 Thr tRNA}
353331	354795	+	1465	33239452	Pror01	-	16S ribosomal RNA
354973	355046	+	74	33239452	Prot08	-	^{14 Ile tRNA}
355056	355128	+	73	33239452	Prot09	-	^{02 Ala tRNA}
355462	358334	+	2873	33239452	Pror02	-	23S ribosomal RNA
358430	358543	+	114	33239452	Pror03	-	5S ribosomal RNA
366467	366539	-	73	33239452	Prot10	-	Xaa tRNA
370507	370578	-	72	33239452	Prot11	-	^{12 Thr tRNA}
370586	370670	-	85	33239452	Prot12	-	^{18 Tyr tRNA}
451916	451989	-	74	33239452	Prot13	-	^{06 Asp tRNA}
452382	452454	-	73	33239452	Prot14	-	^{20 Trp tRNA}
544514	544599	+	86	33239452	Prot15	-	^{15 Leu tRNA}
554563	554634	+	72	33239452	Prot16	-	^{10 Lys tRNA}
562384	562460	+	77	33239452	Prot17	-	^{03 Pro tRNA}
651118	651189	+	72	33239452	Prot18	-	^{01 Gly tRNA}
670781	670854	-	74	33239452	Prot19	-	^{03 Pro tRNA}
736098	736184	-	87	33239452	Prot20	-	^{08 Ser tRNA}
811207	811269	-	63	33239452	Prot21	-	^{16 Met tRNA}
852209	852295	+	87	33239452	Prot22	-	^{08 Ser tRNA}
896720	896793	+	74	33239452	Prot23	-	^{16 Met tRNA}
1049322	1049394	+	73	33239452	Prot24	-	^{04 Glu tRNA}
1173899	1173985	+	87	33239452	Prot25	-	^{08 Ser tRNA}
1212078	1212151	+	74	33239452	Prot26	-	^{11 Arg tRNA}
1237213	1237285	-	73	33239452	Prot27	-	^{02 Ala tRNA}
1275825	1275907	-	83	33239452	Prot28	-	^{15 Leu tRNA}
1277487	1277568	+	82	33239452	Prot29	-	^{15 Leu tRNA}
1282673	1282745	+	73	33239452	Prot30	-	^{09 His tRNA}
1287889	1287985	-	97	33239452	Pros02	-	signal recognition particle RNA (4.5 S RNA)
1304181	1304251	-	71	33239452	Prot31	-	^{01 Gly tRNA}
1337241	1337312	+	72	33239452	Prot32	-	^{13 Val tRNA}
1510408	1510479	+	72	33239452	Prot33	-	^{12 Thr tRNA}
1546424	1546512	-	89	33239452	Prot34	-	^{08 Ser tRNA}
1566956	1567027	+	72	33239452	Prot35	-	^{05 Gln tRNA}
1580265	1580338	+	74	33239452	Prot36	-	^{11 Arg tRNA}
1595707	1595777	+	71	33239452	Prot37	-	^{19 Cys tRNA}
1616670	1616743	-	74	33239452	Prot38	-	^{11 Arg tRNA}
1616782	1617168	+	387	33239452	Pros03	-	bacterial ribonuclease P RNA component of ribozyme
1656288	1656359	-	72	33239452	Prot39	-	^{01 Gly tRNA}
1704853	1704924	-	72	33239452	Prot40	-	^{13 Val tRNA}