Геном прокариот/Материалы:NC 006270

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_006270            4222334 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Bacillus licheniformis ATCC 14580, complete genome.
   ACCESSION   NC_006270
   VERSION     NC_006270.2  GI:56182545
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Bacillus licheniformis ATCC 14580 (DSM 13)
     ORGANISM  Bacillus licheniformis ATCC 14580
               Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4222334)
     AUTHORS   Rey,M.W., Ramaiya,P., Nelson,B.A., Brody-Karpin,S.D.,
               Zaretsky,E.J., Tang,M., de Leon,A.L., Xiang,H., Gusti,V.,
               Clausen,I.G., Olsen,P.B., Rasmussen,M.D., Andersen,J.T.,
               Jorgensen,P.L., Larsen,T.S., Sorokin,A., Bolotin,A., Lapidus,A.,
               Galleron,N., Ehrlich,S.D. and Berka,R.M.
     TITLE     Complete genome sequence of the industrial bacterium Bacillus
               licheniformis and comparisons with closely related Bacillus species
     JOURNAL   Genome Biol. 5 (10), R77 (2004)
      PUBMED   15461803
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4222334)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (15-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4222334)
     AUTHORS   Berka,R.M., Rey,M.W. and Ramaiya,P.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (14-JUL-2004) Novozymes Biotech Inc, 1445 Drew Ave,
               Davis, CA 95616, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000002.
               On Dec 2, 2004 this sequence version replaced gi:52078491.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
9908	11452	+	1545	56182545	BL_rrna_0001	-	16S ribosomal RNA
11553	11629	+	77	56182545	BL_trna_0001	-	^{14 Ile tRNA}
11641	11716	+	76	56182545	BL_trna_0002	-	^{02 Ala tRNA}
11787	14719	+	2933	56182545	BL_rrna_0002	-	23S ribosomal RNA
14851	14966	+	116	56182545	BL_rrna_0003	-	5S ribosomal RNA
26549	26641	+	93	56182545	BL_trna_0003	-	^{08 Ser tRNA}
34611	36155	+	1545	56182545	BL_rrna_0004	-	16S ribosomal RNA
36256	36332	+	77	56182545	BL_trna_0004	-	^{14 Ile tRNA}
36344	36419	+	76	56182545	BL_trna_0005	-	^{02 Ala tRNA}
36490	39420	+	2931	56182545	BL_rrna_0005	-	23S ribosomal RNA
39553	39668	+	116	56182545	BL_rrna_0006	-	5S ribosomal RNA
74949	75022	+	74	56182545	BL_trna_0006	-	^{16 Met tRNA}
75033	75104	+	72	56182545	BL_trna_0007	-	^{04 Glu tRNA}
95347	96892	+	1546	56182545	BL_rrna_0007	-	16S ribosomal RNA
97065	99995	+	2931	56182545	BL_rrna_0008	-	23S ribosomal RNA
100128	100243	+	116	56182545	BL_rrna_0009	-	5S ribosomal RNA
158300	159845	+	1546	56182545	BL_rrna_0010	-	16S ribosomal RNA
160018	162951	+	2934	56182545	BL_rrna_0011	-	23S ribosomal RNA
163084	163119	+	36	56182545	BL_rrna_0012	-	5S ribosomal RNA
163242	163315	+	74	56182545	BL_trna_0008	-
163318	163390	+	73	56182545	BL_trna_0009	-	^{12 Thr tRNA}
176445	176518	+	74	56182545	BL_trna_0010	-	^{04 Glu tRNA}
176669	176744	+	76	56182545	BL_trna_0011	-	^{13 Val tRNA}
176803	176875	+	73	56182545	BL_trna_0012	-	^{12 Thr tRNA}
176884	176968	+	85	56182545	BL_trna_0013	-	^{18 Tyr tRNA}
176973	177044	+	72	56182545	BL_trna_0014	-	^{05 Gln tRNA}
572258	572332	+	75	56182545	BL_trna_0015	-	^{07 Asn tRNA}
572335	572425	+	91	56182545	BL_trna_0016	-	^{08 Ser tRNA}
572454	572525	+	72	56182545	BL_trna_0017	-	^{04 Glu tRNA}
572538	572612	+	75	56182545	BL_trna_0018	-	^{05 Gln tRNA}
572621	572696	+	76	56182545	BL_trna_0019	-	^{10 Lys tRNA}
572709	572791	+	83	56182545	BL_trna_0020	-	^{15 Leu tRNA}
572812	572895	+	84	56182545	BL_trna_0021	-	^{15 Leu tRNA}
611686	611762	+	77	56182545	BL_trna_0022	-	^{11 Arg tRNA}
611775	611848	+	74	56182545	BL_trna_0023	-	^{01 Gly tRNA}
612013	613557	+	1545	56182545	BL_rrna_0013	-	16S ribosomal RNA
613730	616662	+	2933	56182545	BL_rrna_0014	-	23S ribosomal RNA
616795	616910	+	116	56182545	BL_rrna_0015	-	5S ribosomal RNA
616923	616999	+	77	56182545	BL_trna_0024	-	^{16 Met tRNA}
617041	617117	+	77	56182545	BL_trna_0025	-	^{06 Asp tRNA}
920492	922037	+	1546	56182545	BL_rrna_0016	-	16S ribosomal RNA
922210	925140	+	2931	56182545	BL_rrna_0017	-	23S ribosomal RNA
925324	925416	+	93	56182545	BL_rrna_0018	-	5S ribosomal RNA
925436	925510	+	75	56182545	BL_trna_0026	-	^{07 Asn tRNA}
925517	925608	+	92	56182545	BL_trna_0027	-	^{08 Ser tRNA}
925623	925697	+	75	56182545	BL_trna_0028	-	^{04 Glu tRNA}
925815	925890	+	76	56182545	BL_trna_0029	-	^{13 Val tRNA}
925912	925988	+	77	56182545	BL_trna_0030	-	^{16 Met tRNA}
926003	926079	+	77	56182545	BL_trna_0031	-	^{06 Asp tRNA}
926090	926165	+	76	56182545	BL_trna_0032	-	^{17 Phe tRNA}
926169	926241	+	73	56182545	BL_trna_0033	-	^{12 Thr tRNA}
926249	926333	+	85	56182545	BL_trna_0034	-	^{18 Tyr tRNA}
926341	926414	+	74	56182545	BL_trna_0035	-	^{20 Trp tRNA}
926435	926507	+	73	56182545	BL_trna_0036	-	^{09 His tRNA}
926516	926587	+	72	56182545	BL_trna_0037	-	^{05 Gln tRNA}
926641	926715	+	75	56182545	BL_trna_0038	-	^{01 Gly tRNA}
926729	926799	+	71	56182545	BL_trna_0039	-	^{19 Cys tRNA}
926810	926898	+	89	56182545	BL_trna_0040	-	^{15 Leu tRNA}
926913	926997	+	85	56182545	BL_trna_0041	-	^{15 Leu tRNA}
953171	953244	+	74	56182545	BL_trna_0042	-	^{01 Gly tRNA}
1299727	1299799	-	73	56182545	BL_trna_0043	-	^{13 Val tRNA}
2175934	2176007	+	74	56182545	BL_trna_0044	-	^{11 Arg tRNA}
2558249	2558323	+	75	56182545	BL_trna_0045	-	^{05 Gln tRNA}
2865300	2865376	-	77	56182545	BL_trna_0046	-	^{11 Arg tRNA}
3115485	3115559	-	75	56182545	BL_trna_0047	-	^{04 Glu tRNA}
3115572	3115662	-	91	56182545	BL_trna_0048	-	^{08 Ser tRNA}
3115664	3115738	-	75	56182545	BL_trna_0049	-	^{07 Asn tRNA}
3115745	3115821	-	77	56182545	BL_trna_0050	-	^{14 Ile tRNA}
3115834	3115907	-	74	56182545	BL_trna_0051	-	^{01 Gly tRNA}
3115916	3115991	-	76	56182545	BL_trna_0052	-	^{09 His tRNA}
3116014	3116089	-	76	56182545	BL_trna_0053	-	^{17 Phe tRNA}
3116100	3116176	-	77	56182545	BL_trna_0054	-	^{06 Asp tRNA}
3116222	3116298	-	77	56182545	BL_trna_0055	-	^{16 Met tRNA}
3116323	3116415	-	93	56182545	BL_trna_0056	-	^{08 Ser tRNA}
3116423	3116499	-	77	56182545	BL_trna_0057	-	^{16 Met tRNA}
3116505	3116578	-	74	56182545	BL_trna_0058	-	^{16 Met tRNA}
3116604	3116676	-	73	56182545	BL_trna_0059	-	^{02 Ala tRNA}
3116683	3116759	-	77	56182545	BL_trna_0060	-	^{03 Pro tRNA}
3116768	3116844	-	77	56182545	BL_trna_0061	-	^{11 Arg tRNA}
3116855	3116926	-	72	56182545	BL_trna_0062	-	^{01 Gly tRNA}
3116942	3117026	-	85	56182545	BL_trna_0063	-	^{15 Leu tRNA}
3117033	3117108	-	76	56182545	BL_trna_0064	-	^{10 Lys tRNA}
3117190	3117265	-	76	56182545	BL_trna_0065	-	^{12 Thr tRNA}
3117281	3117356	-	76	56182545	BL_trna_0066	-	^{13 Val tRNA}
3118082	3118197	-	116	56182545	BL_rrna_0019	-	5S ribosomal RNA
3118329	3121262	-	2934	56182545	BL_rrna_0020	-	23S ribosomal RNA
3121432	3122977	-	1546	56182545	BL_rrna_0021	-	16S ribosomal RNA
3143412	3143484	-	73	56182545	BL_trna_0067	-	^{02 Ala tRNA}
3538113	3538188	-	76	56182545	BL_trna_0068	-	^{11 Arg tRNA}
4187076	4187148	-	73	56182545	BL_trna_0069	-	^{17 Phe tRNA}
4187175	4187251	-	77	56182545	BL_trna_0070	-	^{06 Asp tRNA}
4187340	4187411	-	72	56182545	BL_trna_0071	-	^{04 Glu tRNA}
4187419	4187494	-	76	56182545	BL_trna_0072	-	^{10 Lys tRNA}