Геном прокариот/Материалы:NC 006361

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_006361            6021225 bp    DNA     circular BCT 03-DEC-2005
   DEFINITION  Nocardia farcinica IFM 10152, complete genome.
   ACCESSION   NC_006361
   VERSION     NC_006361.1  GI:54021964
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Nocardia farcinica IFM 10152
     ORGANISM  Nocardia farcinica IFM 10152
               Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales;
               Corynebacterineae; Nocardiaceae; Nocardia.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 6021225)
     AUTHORS   Ishikawa,J., Yamashita,A., Mikami,Y., Hoshino,Y., Kurita,H.,
               Hotta,K., Shiba,T. and Hattori,M.
     TITLE     The complete genomic sequence of Nocardia farcinica IFM 10152
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101, 14925-14930 (2004)
      PUBMED   15466710
   REFERENCE   2  (bases 1 to 6021225)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (11-OCT-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 6021225)
     AUTHORS   Hattori,M., Ishikawa,J. and Yamashita,A.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (26-SEP-2003) Kitasato Institute for Life Sciences,
               Kitasato University, Kitasato 1-15-1, Sagamihara, Kanagawa
               228-8555, Japan
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AP006618.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
13594	13670	+	77	54021964	nfa80010	-	^{14 Ile tRNA}
13821	13896	+	76	54021964	nfa80020	-	^{02 Ala tRNA}
71317	71402	+	86	54021964	nfa80030	-	^{15 Leu tRNA}
139692	139770	+	79	54021964	nfa80040	-	^{01 Gly tRNA}
236369	236456	+	88	54021964	nfa80050	-	^{08 Ser tRNA}
239471	239546	-	76	54021964	nfa80060	-	^{11 Arg tRNA}
239578	239670	-	93	54021964	nfa80070	-	^{08 Ser tRNA}
248250	248343	+	94	54021964	nfa80080	-	^{08 Ser tRNA}
281943	282033	-	91	54021964	nfa80090	-	^{08 Ser tRNA}
282143	282231	+	89	54021964	nfa70200	-	putative scRNA
346909	346985	-	77	54021964	nfa80100	-	^{03 Pro tRNA}
384086	384164	+	79	54021964	nfa80110	-	^{12 Thr tRNA}
567211	567285	+	75	54021964	nfa80120	-	^{12 Thr tRNA}
629894	629972	-	79	54021964	nfa80130	-	^{10 Lys tRNA}
631589	631664	+	76	54021964	nfa80140	-	^{04 Glu tRNA}
631691	631770	+	80	54021964	nfa80150	-	^{06 Asp tRNA}
631839	631918	+	80	54021964	nfa80160	-	^{17 Phe tRNA}
725468	725536	-	69	54021964	nfa80170	-	^{11 Arg tRNA}
735227	735302	-	76	54021964	nfa80180	-	^{11 Arg tRNA}
1088005	1088084	-	80	54021964	nfa80190	-	^{16 Met tRNA}
1152291	1152368	+	78	54021964	nfa80200	-	^{19 Cys tRNA}
1152899	1152974	-	76	54021964	nfa80210	-	^{11 Arg tRNA}
1179552	1181078	+	1527	54021964	nfa70010	-	putative 16S ribosomal RNA
1181419	1184550	+	3132	54021964	nfa70020	-	putative 23S ribosomal RNA
1184664	1184786	+	123	54021964	nfa70030	-	putative 5S ribosomal RNA
1400943	1401027	-	85	54021964	nfa80220	-	^{15 Leu tRNA}
1435973	1436051	-	79	54021964	nfa80230	-	^{10 Lys tRNA}
1439537	1439612	-	76	54021964	nfa80240	-	^{09 His tRNA}
1454715	1454794	+	80	54021964	nfa80250	-	^{11 Arg tRNA}
1487118	1487194	+	77	54021964	nfa80260	-	^{01 Gly tRNA}
1487236	1487315	+	80	54021964	nfa80270	-	^{03 Pro tRNA}
1653601	1653676	+	76	54021964	nfa80280	-	^{07 Asn tRNA}
1727879	1727958	+	80	54021964	nfa80290	-	^{16 Met tRNA}
1761049	1761123	-	75	54021964	nfa80300	-	^{13 Val tRNA}
1988304	1989830	+	1527	54021964	nfa70040	-	putative 16S ribosomal RNA
1990144	1993276	+	3133	54021964	nfa70050	-	putative 23S ribosomal RNA
1993394	1993516	+	123	54021964	nfa70060	-	putative 5S ribosomal RNA
2040328	2040417	-	90	54021964	nfa80310	-	^{15 Leu tRNA}
2163714	2165239	+	1526	54021964	nfa70070	-	putative 16S ribosomal RNA
2165546	2168676	+	3131	54021964	nfa70080	-	putative 23S ribosomal RNA
2168793	2168915	+	123	54021964	nfa70090	-	putative 5S ribosomal RNA
2235105	2235181	+	77	54021964	nfa80320	-	^{03 Pro tRNA}
2932962	2933048	-	87	54021964	nfa80330	-	^{15 Leu tRNA}
3072515	3072602	-	88	54021964	nfa80340	-	^{15 Leu tRNA}
3932810	3932887	-	78	54021964	nfa80350	-	^{13 Val tRNA}
3933261	3933339	+	79	54021964	nfa80360	-	^{01 Gly tRNA}
3933377	3933450	+	74	54021964	nfa80370	-	^{19 Cys tRNA}
3933449	3933526	+	78	54021964	nfa80380	-	^{13 Val tRNA}
4129952	4130030	-	79	54021964	nfa80390	-	^{05 Gln tRNA}
4143151	4143226	-	76	54021964	nfa80400	-	^{03 Pro tRNA}
4143224	4143302	-	79	54021964	nfa80410	-	^{20 Trp tRNA}
4365370	4365445	-	76	54021964	nfa80420	-	^{04 Glu tRNA}
4365594	4365668	-	75	54021964	nfa80430	-	^{05 Gln tRNA}
4619501	4619579	-	79	54021964	nfa80440	-	^{02 Ala tRNA}
4642337	4642707	-	371	54021964	nfa70100	-	putative tmRNA
4690316	4690395	-	80	54021964	nfa80450	-	^{16 Met tRNA}
5062593	5062669	-	77	54021964	nfa80460	-	^{15 Leu tRNA}
5092333	5092406	+	74	54021964	nfa80470	-	^{05 Gln tRNA}
5167803	5167881	-	79	54021964	nfa80480	-	^{02 Ala tRNA}
5419201	5419279	-	79	54021964	nfa80490	-	^{20 Trp tRNA}
5420937	5421015	-	79	54021964	nfa80500	-	^{16 Met tRNA}
5421082	5421157	-	76	54021964	nfa80510	-	^{12 Thr tRNA}
5421431	5421519	-	89	54021964	nfa80520	-	^{18 Tyr tRNA}
5750532	5750608	+	77	54021964	nfa80530	-	^{01 Gly tRNA}