Геном прокариот/Материалы:NC 008262

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008262            2897393 bp    DNA     circular BCT 14-AUG-2007
   DEFINITION  Clostridium perfringens SM101, complete genome.
   ACCESSION   NC_008262
   VERSION     NC_008262.1  GI:110801439
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Clostridium perfringens SM101
     ORGANISM  Clostridium perfringens SM101
               Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae;
               Clostridium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2897393)
     AUTHORS   Myers,G.S., Rasko,D.A., Cheung,J.K., Ravel,J., Seshadri,R.,
               DeBoy,R.T., Ren,Q., Varga,J., Awad,M.M., Brinkac,L.M.,
               Daugherty,S.C., Haft,D.H., Dodson,R.J., Madupu,R., Nelson,W.C.,
               Rosovitz,M.J., Sullivan,S.A., Khouri,H., Dimitrov,G.I.,
               Watkins,K.L., Mulligan,S., Benton,J., Radune,D., Fisher,D.J.,
               Atkins,H.S., Hiscox,T., Jost,B.H., Billington,S.J., Songer,J.G.,
               McClane,B.A., Titball,R.W., Rood,J.I., Melville,S.B. and
               Paulsen,I.T.
     TITLE     Skewed genomic variability in strains of the toxigenic bacterial
               pathogen, Clostridium perfringens
     JOURNAL   Genome Res. 16 (8), 1031-1040 (2006)
      PUBMED   16825665
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2897393)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-JUL-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2897393)
     AUTHORS   Myers,G.S., Rasko,D.A., Cheung,J.K., Ravel,J., Seshadri,R.,
               DeBoy,R.T., Ren,Q., Varga,J., Awad,M.M., Brinkac,L.M.,
               Daugherty,S.C., Haft,D.H., Dodson,R.J., Madupu,R., Nelson,W.C.,
               Rosovitz,M., Sullivan,S.A., Khouri,H.M., Dimitrov,G., Watkins,K.L.,
               Mulligan,S., Benton,J.L., Fisher,D.J., Atkins,H.S., Hiscox,T.,
               Jost,H., Billington,S.J., Songer,J.G., McClane,B.A., Titball,R.W.,
               Rood,J.I., Melville,S. and Paulsen,I.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-APR-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000312.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
9990	11511	+	1522	110801439	CPR_r01	-	16S ribosomal RNA
11692	14599	+	2908	110801439	CPR_r02	-	23S ribosomal RNA
14691	14818	+	128	110801439	CPR_r03	-	5S ribosomal RNA
14815	14891	+	77	110801439	CPR_0008	-	^{16 Met tRNA}
14898	14973	+	76	110801439	CPR_0009	-	^{02 Ala tRNA}
23343	23433	+	91	110801439	CPR_0016	-	^{08 Ser tRNA}
23467	23557	+	91	110801439	CPR_0017	-	^{08 Ser tRNA}
24189	24279	+	91	110801439	CPR_0019	-	^{08 Ser tRNA}
24285	24375	+	91	110801439	CPR_0020	-	^{08 Ser tRNA}
39655	39731	+	77	110801439	CPR_0031	-	^{11 Arg tRNA}
42904	42978	+	75	110801439	CPR_0035	-	^{11 Arg tRNA}
54005	54094	+	90	110801439	CPR_0047	-	^{08 Ser tRNA}
75565	77086	+	1522	110801439	CPR_r04	-	16S ribosomal RNA
77267	80174	+	2908	110801439	CPR_r05	-	23S ribosomal RNA
80289	80415	+	127	110801439	CPR_r06	-	5S ribosomal RNA
80412	80487	+	76	110801439	CPR_0071	-	^{10 Lys tRNA}
85852	87373	+	1522	110801439	CPR_r07	-	16S ribosomal RNA
87554	90461	+	2908	110801439	CPR_r08	-	23S ribosomal RNA
90552	90679	+	128	110801439	CPR_r09	-	5S ribosomal RNA
90676	90752	+	77	110801439	CPR_0077	-	^{16 Met tRNA}
90758	90833	+	76	110801439	CPR_0078	-	^{02 Ala tRNA}
107888	109409	+	1522	110801439	CPR_r10	-	16S ribosomal RNA
109590	112497	+	2908	110801439	CPR_r11	-	23S ribosomal RNA
112546	112672	+	127	110801439	CPR_r12	-	5S ribosomal RNA
112669	112744	+	76	110801439	CPR_0090	-	^{10 Lys tRNA}
117671	119192	+	1522	110801439	CPR_r13	-	16S ribosomal RNA
119373	122280	+	2908	110801439	CPR_r14	-	23S ribosomal RNA
122330	122456	+	127	110801439	CPR_r15	-	5S ribosomal RNA
122457	122531	+	75	110801439	CPR_0095	-	^{07 Asn tRNA}
233318	234839	+	1522	110801439	CPR_r16	-	16S ribosomal RNA
235020	237927	+	2908	110801439	CPR_r17	-	23S ribosomal RNA
238042	238168	+	127	110801439	CPR_r18	-	5S ribosomal RNA
238171	238246	+	76	110801439	CPR_0191	-	^{17 Phe tRNA}
282349	282424	-	76	110801439	CPR_0228	-	^{16 Met tRNA}
304835	306356	+	1522	110801439	CPR_r19	-	16S ribosomal RNA
306537	309444	+	2908	110801439	CPR_r20	-	23S ribosomal RNA
309494	309620	+	127	110801439	CPR_r21	-	5S ribosomal RNA
309623	309698	+	76	110801439	CPR_0250	-	^{17 Phe tRNA}
323069	323144	-	76	110801439	CPR_0263	-	^{03 Pro tRNA}
562274	562349	+	76	110801439	CPR_0473	-	^{16 Met tRNA}
661048	662569	+	1522	110801439	CPR_r22	-	16S ribosomal RNA
662750	665657	+	2908	110801439	CPR_r23	-	23S ribosomal RNA
665772	665898	+	127	110801439	CPR_r24	-	5S ribosomal RNA
665896	665970	+	75	110801439	CPR_0559	-	^{04 Glu tRNA}
799831	799919	-	89	110801439	CPR_0677	-	^{15 Leu tRNA}
1544138	1544224	-	87	110801439	CPR_1372	-	^{15 Leu tRNA}
2025512	2025602	+	91	110801439	CPR_1834	-	Sec tRNA
2063530	2063604	-	75	110801439	CPR_1864	-	^{19 Cys tRNA}
2063610	2063683	-	74	110801439	CPR_1865	-	^{01 Gly tRNA}
2063687	2063761	-	75	110801439	CPR_1866	-	^{01 Gly tRNA}
2063767	2063842	-	76	110801439	CPR_1867	-	^{17 Phe tRNA}
2163759	2163844	-	86	110801439	CPR_1958	-	^{15 Leu tRNA}
2360915	2360990	-	76	110801439	CPR_2129	-	^{20 Trp tRNA}
2361019	2361094	-	76	110801439	CPR_2130	-	^{20 Trp tRNA}
2380748	2380833	-	86	110801439	CPR_2146	-	^{18 Tyr tRNA}
2380839	2380914	-	76	110801439	CPR_2147	-	^{12 Thr tRNA}
2380940	2381025	-	86	110801439	CPR_2148	-	^{18 Tyr tRNA}
2381031	2381106	-	76	110801439	CPR_2149	-	^{12 Thr tRNA}
2381125	2381200	-	76	110801439	CPR_2150	-	^{13 Val tRNA}
2381205	2381290	-	86	110801439	CPR_2151	-	^{18 Tyr tRNA}
2381296	2381371	-	76	110801439	CPR_2152	-	^{12 Thr tRNA}
2441882	2441956	-	75	110801439	CPR_2211	-	^{07 Asn tRNA}
2442008	2444914	-	2907	110801439	CPR_r25	-	23S ribosomal RNA
2445015	2445091	-	77	110801439	CPR_2212	-	^{14 Ile tRNA}
2445097	2445172	-	76	110801439	CPR_2213	-	^{02 Ala tRNA}
2445329	2446850	-	1522	110801439	CPR_r26	-	16S ribosomal RNA
2450271	2450347	-	77	110801439	CPR_2217	-	^{11 Arg tRNA}
2450396	2450469	-	74	110801439	CPR_2218	-	^{01 Gly tRNA}
2450473	2450547	-	75	110801439	CPR_2219	-	^{01 Gly tRNA}
2450571	2450654	-	84	110801439	CPR_2220	-	^{15 Leu tRNA}
2450665	2450740	-	76	110801439	CPR_2221	-	^{10 Lys tRNA}
2450748	2450822	-	75	110801439	CPR_2222	-	^{05 Gln tRNA}
2450828	2450903	-	76	110801439	CPR_2223	-	^{09 His tRNA}
2450908	2450984	-	77	110801439	CPR_2224	-	^{11 Arg tRNA}
2451020	2451093	-	74	110801439	CPR_2225	-	^{01 Gly tRNA}
2451098	2451173	-	76	110801439	CPR_2226	-	^{03 Pro tRNA}
2451179	2451255	-	77	110801439	CPR_2227	-	^{11 Arg tRNA}
2451331	2451404	-	74	110801439	CPR_2228	-	^{01 Gly tRNA}
2451409	2451483	-	75	110801439	CPR_2229	-	^{01 Gly tRNA}
2451507	2451590	-	84	110801439	CPR_2230	-	^{15 Leu tRNA}
2451601	2451676	-	76	110801439	CPR_2231	-	^{10 Lys tRNA}
2451696	2451771	-	76	110801439	CPR_2232	-	^{10 Lys tRNA}
2451778	2451852	-	75	110801439	CPR_2233	-	^{05 Gln tRNA}
2451856	2451931	-	76	110801439	CPR_2234	-	^{09 His tRNA}
2451936	2452012	-	77	110801439	CPR_2235	-	^{11 Arg tRNA}
2452092	2452166	-	75	110801439	CPR_2236	-	^{01 Gly tRNA}
2452171	2452245	-	75	110801439	CPR_2237	-	^{03 Pro tRNA}
2532078	2532153	-	76	110801439	CPR_2305	-	^{10 Lys tRNA}
2532198	2532271	-	74	110801439	CPR_2306	-	^{01 Gly tRNA}
2532336	2532410	-	75	110801439	CPR_2307	-	^{05 Gln tRNA}
2532414	2532490	-	77	110801439	CPR_2308	-	^{11 Arg tRNA}
2534954	2535029	-	76	110801439	CPR_2312	-	^{10 Lys tRNA}
2535048	2535121	-	74	110801439	CPR_2313	-	^{01 Gly tRNA}
2535127	2535201	-	75	110801439	CPR_2314	-	^{01 Gly tRNA}
2535219	2535292	-	74	110801439	CPR_2315	-	^{01 Gly tRNA}
2535298	2535381	-	84	110801439	CPR_2316	-	^{15 Leu tRNA}
2636785	2636860	-	76	110801439	CPR_2417	-	^{12 Thr tRNA}
2669636	2669710	-	75	110801439	CPR_2454	-	^{19 Cys tRNA}
2669715	2669790	-	76	110801439	CPR_2455	-	^{17 Phe tRNA}
2672081	2672202	-	122	110801439	CPR_r27	-	5S ribosomal RNA
2672204	2672278	-	75	110801439	CPR_2458	-	^{07 Asn tRNA}
2672277	2672403	-	127	110801439	CPR_r28	-	5S ribosomal RNA
2672450	2675356	-	2907	110801439	CPR_r29	-	23S ribosomal RNA
2675457	2675533	-	77	110801439	CPR_2459	-	^{14 Ile tRNA}
2675539	2675614	-	76	110801439	CPR_2460	-	^{02 Ala tRNA}
2675775	2677291	-	1517	110801439	CPR_r30	-	16S ribosomal RNA
2685021	2685095	-	75	110801439	CPR_2466	-	^{07 Asn tRNA}
2698146	2698234	-	89	110801439	CPR_2476	-	^{15 Leu tRNA}
2698251	2698327	-	77	110801439	CPR_2477	-	^{16 Met tRNA}
2698331	2698406	-	76	110801439	CPR_2478	-	^{16 Met tRNA}
2698414	2698502	-	89	110801439	CPR_2479	-	^{15 Leu tRNA}
2698519	2698595	-	77	110801439	CPR_2480	-	^{16 Met tRNA}
2698599	2698674	-	76	110801439	CPR_2481	-	^{16 Met tRNA}
2698681	2698769	-	89	110801439	CPR_2482	-	^{15 Leu tRNA}
2858655	2858730	-	76	110801439	CPR_2624	-	^{12 Thr tRNA}
2858734	2858810	-	77	110801439	CPR_2625	-	^{06 Asp tRNA}
2858822	2858897	-	76	110801439	CPR_2626	-	^{13 Val tRNA}
2858905	2858979	-	75	110801439	CPR_2627	-	^{04 Glu tRNA}
2858985	2859061	-	77	110801439	CPR_2628	-	^{06 Asp tRNA}
2859076	2859151	-	76	110801439	CPR_2629	-	^{13 Val tRNA}
2859158	2859232	-	75	110801439	CPR_2630	-	^{04 Glu tRNA}
2859240	2859316	-	77	110801439	CPR_2631	-	^{06 Asp tRNA}
2859330	2859405	-	76	110801439	CPR_2632	-	^{13 Val tRNA}
2859410	2859484	-	75	110801439	CPR_2633	-	^{04 Glu tRNA}