Геном прокариот/Материалы:NC 008277

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008277             905394 bp    DNA     linear   BCT 09-AUG-2007
   DEFINITION  Borrelia afzelii PKo, complete genome.
   ACCESSION   NC_008277
   VERSION     NC_008277.1  GI:111114823
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Borrelia afzelii PKo
     ORGANISM  Borrelia afzelii PKo
               Bacteria; Spirochaetes; Spirochaetales; Spirochaetaceae; Borrelia;
               Borrelia burgdorferi group.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 905394)
     AUTHORS   Gloeckner,G., Schulte-Spechtel,U., Schilhabel,M.B., Felder,M.,
               Suehnel,J., Wilske,B. and Platzer,M.
     TITLE     Comparative genome analysis: Selection pressure on the Borrelia vls
               cassettes is essential for infectivity
     JOURNAL   Unpublished
   REFERENCE   2  (bases 1 to 905394)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (02-AUG-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 905394)
     AUTHORS   Gloeckner,G., Schulte-Spechtel,U., Schilhabel,M.B., Felder,M.,
               Suehnel,J., Wilske,B. and Platzer,M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-JUN-2006) Genome Analysis, Fritz Lipmann Institute,
               Beutenbergstr. 11, Jena 07745, Germany
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000395.
               Chromosome lacks telomere sequences.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
46313	46384	+	72	111114823	BAPKO_0048	-	^{01 Gly tRNA}
202115	202187	+	73	111114823	BAPKO_0205	-	^{19 Cys tRNA}
205737	205809	+	73	111114823	BAPKO_0210	-	^{17 Phe tRNA}
205829	205901	+	73	111114823	BAPKO_0211	-	^{17 Phe tRNA}
217430	217503	+	74	111114823	BAPKO_0220	-	^{16 Met tRNA}
255201	255285	+	85	111114823	BAPKO_0260	-	^{15 Leu tRNA}
410325	410397	-	73	111114823	BAPKO_0411	-	^{20 Trp tRNA}
410613	410685	-	73	111114823	BAPKO_0413	-	^{12 Thr tRNA}
437392	437512	-	121	111114823	BAPKO_0437	-	5S ribosomal RNA
437533	440466	-	2934	111114823	BAPKO_0438	-	23S ribosomal RNA
440637	440748	-	112	111114823	BAPKO_0439	-	5S ribosomal RNA
440770	443703	-	2934	111114823	BAPKO_0440	-	23S ribosomal RNA
446076	446149	+	74	111114823	BAPKO_0444	-	^{14 Ile tRNA}
446520	448035	-	1516	111114823	BAPKO_r01	-	16S ribosomal RNA
448182	448255	-	74	111114823	BAPKO_0446	-	^{02 Ala tRNA}
448432	449968	-	1537	111114823	BAPKO_0447	-	16S ribosomal RNA
485038	485127	+	90	111114823	BAPKO_0484	-	^{08 Ser tRNA}
485184	485270	+	87	111114823	BAPKO_0485	-	^{08 Ser tRNA}
486081	486154	+	74	111114823	BAPKO_0487	-	^{11 Arg tRNA}
486170	486256	+	87	111114823	BAPKO_0488	-	^{08 Ser tRNA}
551368	551439	-	72	111114823	BAPKO_0562	-	Xaa tRNA
551445	551517	-	73	111114823	BAPKO_0563	-	^{10 Lys tRNA}
551625	551697	-	73	111114823	BAPKO_0564	-	^{10 Lys tRNA}
587867	587950	-	84	111114823	BAPKO_0601	-	^{15 Leu tRNA}
639907	639979	+	73	111114823	BAPKO_0642	-	^{09 His tRNA}
640003	640076	+	74	111114823	BAPKO_0643	-	^{11 Arg tRNA}
640156	640236	+	81	111114823	BAPKO_0644	-	^{15 Leu tRNA}
640242	640313	+	72	111114823	BAPKO_0645	-	^{01 Gly tRNA}
646916	646988	-	73	111114823	BAPKO_0653	-	^{16 Met tRNA}
652244	652317	+	74	111114823	BAPKO_0659	-	^{16 Met tRNA}
660719	660790	+	72	111114823	BAPKO_0666	-	^{07 Asn tRNA}
666826	666899	-	74	111114823	BAPKO_0674	-	^{06 Asp tRNA}
734317	734390	-	74	111114823	BAPKO_0733	-	^{13 Val tRNA}
748734	748807	+	74	111114823	BAPKO_0752	-	^{12 Thr tRNA}
748812	748893	+	82	111114823	BAPKO_0753	-	^{18 Tyr tRNA}
792680	792752	-	73	111114823	BAPKO_0789	-	^{03 Pro tRNA}
792760	792833	-	74	111114823	BAPKO_0790	-	^{11 Arg tRNA}
805331	805414	+	84	111114823	BAPKO_0806	-	^{15 Leu tRNA}
826673	826744	+	72	111114823	BAPKO_0837	-	^{05 Gln tRNA}