Викиверситет

Геном прокариот/Материалы:NC 008769

< Геном прокариот
 Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»
   LOCUS       NC_008769            4374522 bp    DNA     circular BCT 03-APR-2007
   DEFINITION  Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2, complete genome.
   ACCESSION   NC_008769
   VERSION     NC_008769.1  GI:121635883
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2
     ORGANISM  Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2
               Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales;
               Corynebacterineae; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium
               tuberculosis complex.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4374522)
     AUTHORS   Brosch,R., Gordon,S.V., Garnier,T., Eiglmeier,K., Frigui,W.,
               Valenti,P., Dos Santos,S., Duthoy,S., Lacroix,C., Garcia-Pelayo,C.,
               Inwald,J.K., Golby,P., Garcia,J.N., Hewinson,R.G., Behr,M.A.,
               Quail,M.A., Churcher,C., Barrell,B.G., Parkhill,J. and Cole,S.T.
     TITLE     Genome plasticity of BCG and impact on vaccine efficacy
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104 (13), 5596-5601 (2007)
      PUBMED   17372194
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4374522)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-JAN-2007) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4374522)
     AUTHORS   Garnier,T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (23-OCT-2006) Garnier T., Unite Genetique Moleculaire
               Bacterienne, Institut Pasteur, 28,rue du Dr ROUX, PARIS, 75015,
               FRANCE. Garnier T., submitted on behalf of the Mycobacterium bovis
               sequencing teams, TB Research Group, Veterinary Laboratories Agency
               Weybridge, Woodham Lane, New Haw,Addlestone, Surrey KT15 3NB, UK.
               Sanger Centre, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton,Cambridge CB10
               1SA, UK. PT4 Annotation, Genopole, Institut Pasteur, 28 Rue du
               Docteur Roux, 75724 Paris Cedex 15, France. Unite de Genetique
               Moleculaire Bacterienne, Institut Pasteur, 28 rue du Docteur Roux,
               75724 Paris Cedex 15, France
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AM408590.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

править
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
10887 10960 + 74 121635883 ileT_1 - Anticodon: GAT
11112 11184 + 73 121635883 alaT_1 - Anticodon: TGC
40554 40627 + 74 121635883 ileT_2 - Anticodon: GAT
40779 40851 + 73 121635883 alaT_2 - Anticodon: TGC
55292 55374 + 83 121635883 leuT - Anticodon: CAG
417131 417201 - 71 121635883 glyU - Anticodon: CCC
689000 689080 + 81 121635883 tyrT - Anticodon: GTA
762370 762442 + 73 121635883 thrT - Anticodon: GGT
762479 762552 + 74 121635883 metT - Anticodon: CAT
764400 764472 + 73 121635883 trpT - Anticodon: CCA
882425 882496 - 72 121635883 thrV - Anticodon: TGT
954224 954296 - 73 121635883 lysT - Anticodon: TTT
954420 954493 + 74 121635883 gluT - Anticodon: TTC
954531 954604 + 74 121635883 aspT - Anticodon: GTC
954634 954707 + 74 121635883 pheU - Anticodon: GAA
1055796 1055868 - 73 121635883 argT - Anticodon: CCT
1144000 1144072 + 73 121635883 alaV - Anticodon: CGC
1168561 1168632 - 72 121635883 glnT - Anticodon: TTG
1207882 1207955 + 74 121635883 leuX - Anticodon: TAA
1472720 1472792 - 73 121635883 argV - Anticodon: CCG
1498360 1499896 + 1537 121635883 rrs - 16S ribosomal RNA
1500172 1503309 + 3138 121635883 rrl - 23S ribosomal RNA
1503413 1503527 + 115 121635883 rrf - 5S ribosomal RNA
1539242 1539325 + 84 121635883 leuW - Anticodon: TAG
1833262 1833335 - 74 121635883 leuV - Anticodon: CAA
1951829 1951902 + 74 121635883 proT - Anticodon: GGG
2381997 2382082 + 86 121635883 leuU - Anticodon: GAG
2479089 2479395 - 307 121635883 rnpB - ribonuclease P RNA
2489243 2489314 - 72 121635883 valV - Anticodon: TAC
2558859 2558932 - 74 121635883 metV - Anticodon: CAT
2596504 2596576 - 73 121635883 asnT - Anticodon: GTT
2730501 2730574 - 74 121635883 proU - Anticodon: TGG
2730711 2730781 + 71 121635883 glyV - Anticodon: TCC
2757985 2758058 + 74 121635883 argW - Anticodon: TCT
2791650 2791722 + 73 121635883 hisT - Anticodon: GTG
2799290 2799362 + 73 121635883 lysU - Anticodon: CTT
2934007 2934078 - 72 121635883 valT - Anticodon: CAC
2934263 2934335 + 73 121635883 glyT - Anticodon: GCC
2934365 2934435 + 71 121635883 cysU - Anticodon: GCA
2934452 2934523 + 72 121635883 valU - Anticodon: GAC
3303034 3303106 - 73 121635883 gluU - Anticodon: CTC
3303146 3303217 - 72 121635883 glnU - Anticodon: CTG
3386326 3386398 - 73 121635883 alaU - Anticodon: GGC
3422299 3422905 - 607 121635883 ssr - 10Sa RNA
3511842 3511915 - 74 121635883 metU - Anticodon: CAT
4054386 4054458 - 73 121635883 thrU - Anticodon: CGT
4099654 4099727 + 74 121635883 proY - Anticodon: CGG
4141913 4141998 + 86 121635883 serV - Anticodon: GGA
4171533 4171619 - 87 121635883 serX - Anticodon: CGA
4189267 4189339 - 73 121635883 argU - Anticodon: ACG
4189370 4189458 - 89 121635883 serT - Anticodon: GCT
4194984 4195070 - 87 121635883 serU - Anticodon: TGA
Источник — https://ru.wikiversity.org/w/index.php?title=Геном_прокариот/Материалы:NC_008769&oldid=156860