Материалы:NC 000117

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_000117            1042519 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX, complete genome.
   ACCESSION   NC_000117
   VERSION     NC_000117.1  GI:15604717
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX
     ORGANISM  Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX
               Bacteria; Chlamydiae; Chlamydiales; Chlamydiaceae; Chlamydia.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1042519)
     AUTHORS   Stephens,R.S., Kalman,S., Lammel,C.J., Fan,J., Marathe,R.,
               Aravind,L., Mitchell,W.P., Olinger,L., Tatusov,R.L., Zhao,Q.,
               Koonin,E.V. and Davis,R.W.
     TITLE     Genome sequence of an obligate intracellular pathogen of humans:
               Chlamydia trachomatis
     JOURNAL   Science 282 (5389), 754-759 (1998)
      PUBMED   9784136
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1042519)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-SEP-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1042519)
     AUTHORS   Stephens,R.S., Kalman,S., Lammel,C.J., Fan,J., Marathe,R.,
               Aravind,L., Mitchell,W.P., Olinger,L., Tatusov,R.L., Zhao,Q.,
               Koonin,E.V. and Davis,R.W.
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (20-MAY-1998) Program in Infectious Diseases, University
               of California, 235 Warren Hall, Berkeley, CA 94720-7360, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE001273.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
20663	21082	-	420	15604717	CTs01	-	10Sa RNA
42730	42801	-	72	15604717	CTt01	-	^{07 Asn tRNA}
68921	68995	-	75	15604717	CTt02	-	^{03 Pro tRNA}
158662	158734	+	73	15604717	CTt03	-	^{12 Thr tRNA}
158744	158826	+	83	15604717	CTt04	-	^{18 Tyr tRNA}
202341	202414	-	74	15604717	CTt05	-	^{14 Ile tRNA}
202420	202492	-	73	15604717	CTt06	-	^{02 Ala tRNA}
234283	234356	-	74	15604717	CTt07	-	^{16 Met tRNA}
234375	234448	-	74	15604717	CTt08	-	^{16 Met tRNA}
250289	250362	-	74	15604717	CTt09	-	^{06 Asp tRNA}
250370	250442	-	73	15604717	CTt10	-	^{13 Val tRNA}
361867	361939	-	73	15604717	CTt11	-	^{20 Trp tRNA}
363210	363281	-	72	15604717	CTt12	-	^{12 Thr tRNA}
368396	368468	+	73	15604717	CTt13	-	^{16 Met tRNA}
409238	409321	+	84	15604717	CTt14	-	^{08 Ser tRNA}
457055	457368	+	314	15604717	CT398.1	-	Ribonuclease P RNA
485247	485330	-	84	15604717	CTt15	-	^{08 Ser tRNA}
489983	490055	-	73	15604717	CTt16	-	^{17 Phe tRNA}
541063	541145	+	83	15604717	CTt17	-	^{15 Leu tRNA}
543862	543935	+	74	15604717	CTt18	-	^{11 Arg tRNA}
545989	546070	-	82	15604717	CTt19	-	^{15 Leu tRNA}
574902	574985	-	84	15604717	CTt20	-	^{08 Ser tRNA}
581987	582069	-	83	15604717	CTt21	-	^{15 Leu tRNA}
605752	605835	+	84	15604717	CTt22	-	^{15 Leu tRNA}
682214	682286	-	73	15604717	CTt23	-	^{11 Arg tRNA}
718303	718376	+	74	15604717	CTt24	-	^{03 Pro tRNA}
725436	725508	-	73	15604717	CTt25	-	^{02 Ala tRNA}
752671	752743	+	73	15604717	CTt26	-	^{11 Arg tRNA}
773399	773471	+	73	15604717	CTt27	-	^{12 Thr tRNA}
775264	775336	-	73	15604717	CTt28	-	^{10 Lys tRNA}
775353	775427	-	75	15604717	CTt29	-	^{04 Glu tRNA}
778591	778662	-	72	15604717	CTt30	-	^{01 Gly tRNA}
814540	814611	-	72	15604717	CTt31	-	^{01 Gly tRNA}
853555	853628	-	74	15604717	CTt32	-	^{09 His tRNA}
854128	855677	+	1550	15604717	CTr01	-	16S ribosomal RNA
855993	858862	+	2870	15604717	CTr02	-	23S ribosomal RNA
858982	859098	+	117	15604717	CTr03	-	5S ribosomal RNA
876174	877723	+	1550	15604717	CTr04	-	16S ribosomal RNA
878039	880902	+	2864	15604717	CTr05	-	23S ribosomal RNA
881027	881143	+	117	15604717	CTr06	-	5S ribosomal RNA
887936	888006	-	71	15604717	CTt33	-	^{19 Cys tRNA}
937062	937133	+	72	15604717	CTt34	-	^{05 Gln tRNA}
979521	979594	-	74	15604717	CTt35	-	^{13 Val tRNA}
984330	984413	+	84	15604717	CTt36	-	^{08 Ser tRNA}
1018111	1018192	+	82	15604717	CTt37	-	^{15 Leu tRNA}