Геном прокариот/Материалы:NC 001263

(перенаправлено с «Материалы:NC 001263»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_001263            2648638 bp    DNA     circular BCT 06-JUN-2007
   DEFINITION  Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1, complete sequence.
   ACCESSION   NC_001263
   VERSION     NC_001263.1  GI:15805042
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Deinococcus radiodurans R1
     ORGANISM  Deinococcus radiodurans R1
               Bacteria; Deinococcus-Thermus; Deinococci; Deinococcales;
               Deinococcaceae; Deinococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2648638)
     AUTHORS   White,O., Eisen,J.A., Heidelberg,J.F., Hickey,E.K., Peterson,J.D.,
               Dodson,R.J., Haft,D.H., Gwinn,M.L., Nelson,W.C., Richardson,D.L.,
               Moffat,K.S., Qin,H., Jiang,L., Pamphile,W., Crosby,M., Shen,M.,
               Vamathevan,J.J., Lam,P., McDonald,L., Utterback,T., Zalewski,C.,
               Makarova,K.S., Aravind,L., Daly,M.J., Minton,K.W.,
               Fleischmann,R.D., Ketchum,K.A., Nelson,K.E., Salzberg,S.,
               Smith,H.O., Venter,J.C. and Fraser,C.M.
     TITLE     Genome sequence of the radioresistant bacterium Deinococcus
               radiodurans R1
     JOURNAL   Science 286 (5444), 1571-1577 (1999)
      PUBMED   10567266
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2648638)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-SEP-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2648638)
     AUTHORS   White,O., Eisen,J.A., Heidelberg,J.F., Hickey,E.K., Peterson,J.D.,
               Dodson,R.J., Haft,D.H., Gwinn,M.L., Nelson,W.C., Richardson,D.L.,
               Moffat,K.S., Qin,H., Jiang,L., Pamphile,W., Crosby,M., Shen,M.,
               Vamathevan,J.J., Lam,P., McDonald,L., Utterback,T., Zalewski,C.,
               Makarova,K.S., Aravind,L., Daly,M.J., Minton,K.W.,
               Fleischmann,R.D., Ketchum,K.A., Nelson,K.E., Salzberg,S.,
               Smith,H.O., Venter,J.C. and Fraser,C.M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-NOV-1999) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE000513.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК править

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
21938 22010 - 73 15805042 DR_t01 - 17 Phe tRNA
22035 22107 - 73 15805042 DR_t02 - 06 Asp tRNA
41882 41954 + 73 15805042 DR_t03 - 10 Lys tRNA
57084 57154 - 71 15805042 DR_t04 - 05 Gln tRNA
68827 68906 + 80 15805042 DR_t05 - 11 Arg tRNA
84836 86337 + 1502 15805042 DR_r01 - 16S ribosomal RNA
146086 146159 + 74 15805042 DR_t06 - 11 Arg tRNA
249750 249822 - 73 15805042 DR_t0253 - 06 Asp tRNA
254392 254515 + 124 15805042 DR_r03 - 5S ribosomal RNA
254523 254595 + 73 15805042 DR_t07 - 01 Gly tRNA
294646 294718 - 73 15805042 DR_t08 - 02 Ala tRNA
339245 339324 - 80 15805042 DR_t09 - 15 Leu tRNA
498343 498414 - 72 15805042 DR_t10 - 13 Val tRNA
498435 498507 - 73 15805042 DR_t11 - 16 Met tRNA
518331 518404 + 74 15805042 DR_t12 - 11 Arg tRNA
564388 564459 + 72 15805042 DR_t13 - 02 Ala tRNA
564574 564645 - 72 15805042 DR_t14 - 13 Val tRNA
576883 576953 + 71 15805042 DR_t15 - 19 Cys tRNA
576983 577054 + 72 15805042 DR_t16 - 13 Val tRNA
607622 607708 + 87 15805042 DR_t0595 - 08 Ser tRNA
652637 652707 - 71 15805042 DR_t17 - 01 Gly tRNA
652728 652801 - 74 15805042 DR_t18 - 03 Pro tRNA
863725 863806 + 82 15805042 DR_t0852 - 15 Leu tRNA
886348 886421 + 74 15805042 DR_t19 - 14 Ile tRNA
936753 936835 - 83 15805042 DR_t20 - 15 Leu tRNA
936888 936961 - 74 15805042 DR_t21 - 09 His tRNA
1127817 1127890 - 74 15805042 DR_t22 - 03 Pro tRNA
1271535 1271616 - 82 15805042 DR_t1264 - 18 Tyr tRNA
1272041 1272112 - 72 15805042 DR_t23 - 06 Asp tRNA
1317108 1317187 + 80 15805042 DR_t24 - 15 Leu tRNA
1485608 1485679 - 72 15805042 DR_t25 - 12 Thr tRNA
1655398 1655471 - 74 15805042 DR_t26 - 16 Met tRNA
1781166 1781244 - 79 15805042 DR_t27 - 02 Ala tRNA
2005410 2005480 - 71 15805042 DR_t28 - 05 Gln tRNA
2037771 2037842 - 72 15805042 DR_t29 - 10 Lys tRNA
2045580 2045666 + 87 15805042 DR_t30 - 08 Ser tRNA
2063549 2063620 - 72 15805042 DR_t31 - 12 Thr tRNA
2063627 2063699 - 73 15805042 DR_t32 - 01 Gly tRNA
2063707 2063789 - 83 15805042 DR_t33 - 18 Tyr tRNA
2063839 2063911 - 73 15805042 DR_t34 - 12 Thr tRNA
2070898 2070969 + 72 15805042 DR_t35 - 07 Asn tRNA
2118380 2118461 - 82 15805042 DR_t36 - 15 Leu tRNA
2181630 2181714 + 85 15805042 DR_t37 - 08 Ser tRNA
2181747 2181836 + 90 15805042 DR_t38 - 08 Ser tRNA
2181867 2181940 + 74 15805042 DR_t39 - 11 Arg tRNA
2186731 2186804 + 74 15805042 DR_t40 - 03 Pro tRNA
2245003 2245082 - 80 15805042 DR_t41 - 01 Gly tRNA
2245090 2245213 - 124 15805042 DR_r04 - 5S ribosomal RNA
2245319 2248200 - 2882 15805042 DR_r05 - 23S ribosomal RNA
2285518 2287019 - 1502 15805042 DR_r06 - 16S ribosomal RNA
2406652 2406724 - 73 15805042 DR_t42 - 20 Trp tRNA
2467934 2469435 - 1502 15805042 DR_r07 - 16S ribosomal RNA
2530438 2530509 + 72 15805042 DR_t43 - 04 Glu tRNA
2584748 2584820 - 73 15805042 DR_t44 - 01 Gly tRNA
2584828 2584951 - 124 15805042 DR_r08 - 5S ribosomal RNA
2585058 2587938 - 2881 15805042 DR_r09 - 23S ribosomal RNA