Геном прокариот/Материалы:NC 002488

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_002488            2679306 bp    DNA     circular BCT 02-DEC-2005
   DEFINITION  Xylella fastidiosa 9a5c, complete genome.
   ACCESSION   NC_002488
   VERSION     NC_002488.3  GI:57014152
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xylella fastidiosa 9a5c
     ORGANISM  Xylella fastidiosa 9a5c
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xylella.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2679306)
     AUTHORS   Simpson,A.J.G., Reinach,F.C., Arruda,P., Abreu,F.A., Acencio,M.,
               Alvarenga,R., Alves,L.M.C., Araya,J.E., Baia,G.S., Baptista,C.S.,
               Barros,M.H., Bonaccorsi,E.D., Bordin,S., Bove,J.M., Briones,M.R.S.,
               Bueno,M.R.P., Camargo,A.A., Camargo,L.E.A., Carraro,D.M.,
               Carrer,H., Colauto,N.B., Colombo,C., Costa,F.F., Costa,M.C.R.,
               Costa-Neto,C.M., Coutinho,L.L., Cristofani,M., Dias-Neto,E.,
               Docena,C., El-Dorry,H., Facincani,A.P., Ferreira,A.J.S.,
               Ferreira,V.C.A., Ferro,J.A., Fraga,J.S., Franca,S.C., Franco,M.C.,
               Frohme,M., Furlan,L.R., Garnier,M., Goldman,G.H., Goldman,M.H.S.,
               Gomes,S.L., Gruber,A., Ho,P.L., Hoheisel,J.D., Junqueira,M.L.,
               Kemper,E.L., Kitajima,J.P., Krieger,J.E., Kuramae,E.E., Laigret,F.,
               Lambais,M.R., Leite,L.C.C., Lemos,E.G.M., Lemos,M.V.F., Lopes,S.A.,
               Lopes,C.R., Machado,J.A., Machado,M.A., Madeira,A.M.B.N.,
               Madeira,H.M.F., Marino,C.L., Marques,M.V., Martins,E.A.L.,
               Martins,E.M.F., Matsukuma,A.Y., Menck,C.F.M., Miracca,E.C.,
               Miyaki,C.Y., Monteiro-Vitorello,C.B., Moon,D.H., Nagai,M.A.,
               Nascimento,A.L.T.O., Netto,L.E.S., Nhani,A. Jr., Nobrega,F.G.,
               Nunes,L.R., Oliveira,M.A., de Oliveira,M.C., de Oliveira,R.C.,
               Palmieri,D.A., Paris,A., Peixoto,B.R., Pereira,G.A.G., Pereira,H.A.
               Jr., Pesquero,J.B., Quaggio,R.B., Roberto,P.G., Rodrigues,V., de M.
               Rosa,A.J., de Rosa,V.E. Jr., de Sa,R.G., Santelli,R.V.,
               Sawasaki,H.E., da Silva,A.C.R., da Silva,F.R., da Silva,A.M.,
               Silva,W.A. Jr., da Silveira,J.F., Silvestri,M.L.Z., Siqueira,W.J.,
               de Souza,A.A., de Souza,A.P., Terenzi,M.F., Truffi,D., Tsai,S.M.,
               Tsuhako,M.H., Vallada,H., Van Sluys,M.A., Verjovski-Almeida,S.,
               Vettore,A.L., Zago,M.A., Zatz,M., Meidanis,J. and Setubal,J.C.
     TITLE     The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa. The
               Xylella fastidiosa Consortium of the Organization for Nucleotide
               Sequencing and Analysis
     JOURNAL   Nature 406 (6792), 151-157 (2000)
      PUBMED   10910347
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2679306)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (02-OCT-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2679306)
     AUTHORS   Simpson,A.J.G., Reinach,F.C., Arruda,P., Abreu,F.A., Acencio,M.,
               Alvarenga,R., Alves,L.M.C., Araya,J.E., Baia,G.S., Baptista,C.S.,
               Barros,M.H., Bonaccorsi,E.D., Bordin,S., Bove,J.M., Briones,M.R.S.,
               Bueno,M.R.P., Camargo,A.A., Camargo,L.E.A., Carraro,D.M.,
               Carrer,H., Colauto,N.B., Colombo,C., Costa,F.F., Costa,M.C.R.,
               Costa-Neto,C.M., Coutinho,L.L., Cristofani,M., Dias-Neto,E.,
               Docena,C., El-Dorry,H., Facincani,A.P., Ferreira,A.J.S.,
               Ferreira,V.C.A., Ferro,J.A., Fraga,J.S., Franca,S.C., Franco,M.C.,
               Frohme,M., Furlan,L.R., Garnier,M., Goldman,G.H., Goldman,M.H.S.,
               Gomes,S.L., Gruber,A., Ho,P.L., Hoheisel,J.D., Junqueira,M.L.,
               Kemper,E.L., Kitajima,J.P., Krieger,J.E., Kuramae,E.E., Laigret,F.,
               Lambais,M.R., Leite,L.C.C., Lemos,E.G.M., Lemos,M.V.F., Lopes,S.A.,
               Lopes,C.R., Machado,J.A., Machado,M.A., Madeira,A.M.B.N.,
               Madeira,H.M.F., Marino,C.L., Marques,M.V., Martins,E.A.L.,
               Martins,E.M.F., Matsukuma,A.Y., Menck,C.F.M., Miracca,E.C.,
               Miyaki,C.Y., Monteiro-Vitorello,C.B., Moon,D.H., Nagai,M.A.,
               Nascimento,A.L.T.O., Netto,L.E.S., Nhani,A. Jr., Nobrega,F.G.,
               Nunes,L.R., Oliveira,M.A., de Oliveira,M.C., de Oliveira,R.C.,
               Palmieri,D.A., Paris,A., Peixoto,B.R., Pereira,G.A.G., Pereira,H.A.
               Jr., Pesquero,J.B., Quaggio,R.B., Roberto,P.G., Rodrigues,V., de M.
               Rosa,A.J., de Rosa,V.E. Jr., de Sa,R.G., Santelli,R.V.,
               Sawasaki,H.E., da Silva,A.C.R., da Silva,F.R., da Silva,A.M.,
               Silva,W.A. Jr., da Silveira,J.F., Silvestri,M.L.Z., Siqueira,W.J.,
               de Souza,A.A., de Souza,A.P., Terenzi,M.F., Truffi,D., Tsai,S.M.,
               Tsuhako,M.H., Vallada,H., Van Sluys,M.A., Verjovski-Almeida,S.,
               Vettore,A.L., Zago,M.A., Zatz,M., Meidanis,J. and Setubal,J.C.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (02-JUN-2000) Organization for Nucleotide Sequencing and
               Analysis, Bioinformatics Lab - IC/Unicamp, C.P. 6176, Campinas, SP
               13083-970, Brazil
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE003849.
               On Jan 4, 2005 this sequence version replaced gi:55294525.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
20869	20945	-	77	57014152	XFt01	-	^{16 Met tRNA}
62407	62483	+	77	57014152	XFt02	-	^{11 Arg tRNA}
66558	68102	+	1545	57014152	XFr01	-	16S ribosomal RNA
68209	68284	+	76	57014152	XFt03	-	^{02 Ala tRNA}
68298	68374	+	77	57014152	XFt04	-	^{14 Ile tRNA}
68568	71449	+	2882	57014152	XFr02	-	23S ribosomal RNA
71586	71703	+	118	57014152	XFr03	-	5S ribosomal RNA
123996	124088	+	93	57014152	XFt05	-	^{08 Ser tRNA}
172274	173818	+	1545	57014152	XFr04	-	16S ribosomal RNA
173925	174000	+	76	57014152	XFt06	-	^{02 Ala tRNA}
174014	174090	+	77	57014152	XFt07	-	^{14 Ile tRNA}
174284	177165	+	2882	57014152	XFr05	-	23S ribosomal RNA
177302	177419	+	118	57014152	XFr06	-	5S ribosomal RNA
224438	224513	-	76	57014152	XFt08	-	^{02 Ala tRNA}
236040	236114	-	75	57014152	XFt09	-	^{04 Glu tRNA}
242842	242918	+	77	57014152	XFt10	-	^{16 Met tRNA}
308643	308718	+	76	57014152	XFt11	-	^{17 Phe tRNA}
319058	319142	+	85	57014152	XFt12	-	^{15 Leu tRNA}
405760	405834	-	75	57014152	XFt13	-	^{05 Gln tRNA}
405880	405956	-	77	57014152	XFt14	-	^{16 Met tRNA}
486925	487001	+	77	57014152	XFt15	-	^{07 Asn tRNA}
615886	615973	-	88	57014152	XFt16	-	^{08 Ser tRNA}
649104	649178	+	75	57014152	XFt17	-	^{13 Val tRNA}
699322	699398	+	77	57014152	XFt18	-	^{03 Pro tRNA}
732074	732147	-	74	57014152	XFt19	-	^{01 Gly tRNA}
816524	816600	-	77	57014152	XFt20	-	^{03 Pro tRNA}
926649	926723	+	75	57014152	XFt21	-	^{13 Val tRNA}
1017853	1017939	-	87	57014152	XFt22	-	^{15 Leu tRNA}
1018069	1018144	-	76	57014152	XFt23	-	^{04 Glu tRNA}
1018198	1018273	-	76	57014152	XFt24	-	^{02 Ala tRNA}
1078829	1078913	-	85	57014152	XFt25	-	^{15 Leu tRNA}
1131233	1131319	-	87	57014152	XFt26	-	^{15 Leu tRNA}
1135741	1135824	-	84	57014152	XFt27	-	^{15 Leu tRNA}
1142842	1142916	+	75	57014152	XFt28	-	^{13 Val tRNA}
1142947	1143023	+	77	57014152	XFt29	-	^{06 Asp tRNA}
1191242	1191317	-	76	57014152	XFt30	-	^{10 Lys tRNA}
1631333	1631409	+	77	57014152	XFt31	-	^{11 Arg tRNA}
1638644	1638719	+	76	57014152	XFt32	-	^{01 Gly tRNA}
1707512	1707587	-	76	57014152	XFt33	-	^{12 Thr tRNA}
1720231	1720323	-	93	57014152	XFt34	-	^{08 Ser tRNA}
1776435	1776510	+	76	57014152	XFt35	-	^{10 Lys tRNA}
2004768	2004841	+	74	57014152	XFt36	-	^{19 Cys tRNA}
2047010	2047100	-	91	57014152	XFt37	-	^{08 Ser tRNA}
2193930	2194005	-	76	57014152	XFt38	-	^{01 Gly tRNA}
2295154	2295229	-	76	57014152	XFt39	-	^{12 Thr tRNA}
2459885	2459962	+	78	57014152	XFt40	-	^{11 Arg tRNA}
2524115	2524190	-	76	57014152	XFt41	-	^{20 Trp tRNA}
2525541	2525616	-	76	57014152	XFt42	-	^{12 Thr tRNA}
2525659	2525732	-	74	57014152	XFt43	-	^{01 Gly tRNA}
2525766	2525851	-	86	57014152	XFt44	-	^{18 Tyr tRNA}
2529603	2529679	-	77	57014152	XFt45	-	^{05 Gln tRNA}
2602997	2603351	+	355	57014152	XFs01	-	tmRNA
2652606	2652682	+	77	57014152	XFt46	-	^{03 Pro tRNA}
2652744	2652822	+	79	57014152	XFt47	-	^{11 Arg tRNA}
2652862	2652938	+	77	57014152	XFt48	-	^{09 His tRNA}
2653049	2653124	+	76	57014152	XFt49	-	^{10 Lys tRNA}