Геном прокариот/Материалы:NC 002929

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_002929            4086189 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Bordetella pertussis Tohama I, complete genome.
   ACCESSION   NC_002929
   VERSION     NC_002929.2  GI:33591275
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Bordetella pertussis Tohama I
     ORGANISM  Bordetella pertussis Tohama I
               Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales;
               Alcaligenaceae; Bordetella.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4086189)
     AUTHORS   Parkhill,J., Sebaihia,M., Preston,A., Murphy,L.D., Thomson,N.,
               Harris,D.E., Holden,M.T., Churcher,C.M., Bentley,S.D.,
               Mungall,K.L., Cerdeno-Tarraga,A.M., Temple,L., James,K., Harris,B.,
               Quail,M.A., Achtman,M., Atkin,R., Baker,S., Basham,D., Bason,N.,
               Cherevach,I., Chillingworth,T., Collins,M., Cronin,A., Davis,P.,
               Doggett,J., Feltwell,T., Goble,A., Hamlin,N., Hauser,H.,
               Holroyd,S., Jagels,K., Leather,S., Moule,S., Norberczak,H.,
               O'Neil,S., Ormond,D., Price,C., Rabbinowitsch,E., Rutter,S.,
               Sanders,M., Saunders,D., Seeger,K., Sharp,S., Simmonds,M.,
               Skelton,J., Squares,R., Squares,S., Stevens,K., Unwin,L.,
               Whitehead,S., Barrell,B.G. and Maskell,D.J.
     TITLE     Comparative analysis of the genome sequences of Bordetella
               pertussis, Bordetella parapertussis and Bordetella bronchiseptica
     JOURNAL   Nat. Genet. 35 (1), 32-40 (2003)
      PUBMED   12910271
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4086189)
     AUTHORS   Sebaihia,M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-AUG-2003) Submitted on behalf of the Pathogen
               Sequencing Unit, Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus,
               Hinxton, Cambridge CB10 1SA, E-mail: ms5@sanger.ac.uk
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4086189)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-APR-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BX470248.
               On Aug 12, 2003 this sequence version replaced gi:20070454.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
6236	6322	+	87	33591275	BPt01	-	^{18 Tyr tRNA}
6511	6584	+	74	33591275	BPt02	-	^{01 Gly tRNA}
6591	6665	+	75	33591275	BPt03	-	^{12 Thr tRNA}
8023	8098	+	76	33591275	BPt04	-	^{20 Trp tRNA}
71391	71475	-	85	33591275	BPt05	-	^{15 Leu tRNA}
279202	279277	-	76	33591275	BPt06	-	^{12 Thr tRNA}
405640	405714	-	75	33591275	BPt07	-	^{13 Val tRNA}
692825	692900	-	76	33591275	BPt08	-	^{17 Phe tRNA}
764870	764946	+	77	33591275	BPt09	-	^{03 Pro tRNA}
822623	822707	-	85	33591275	BPt10	-	^{15 Leu tRNA}
825583	825667	+	85	33591275	BPt11	-	^{15 Leu tRNA}
916416	916492	+	77	33591275	BPt12	-	^{11 Arg tRNA}
976380	976765	-	386	33591275	BPs01	-	tmRNA
1077941	1078017	-	77	33591275	BPt13	-	^{06 Asp tRNA}
1078053	1078128	-	76	33591275	BPt14	-	^{04 Glu tRNA}
1078160	1078235	-	76	33591275	BPt15	-	^{02 Ala tRNA}
1114417	1114493	-	77	33591275	BPt16	-	^{03 Pro tRNA}
1301002	1301077	-	76	33591275	BPt17	-	^{12 Thr tRNA}
1301250	1301325	+	76	33591275	BPt18	-	^{07 Asn tRNA}
1305454	1305530	-	77	33591275	BPt19	-	^{16 Met tRNA}
1569314	1569390	+	77	33591275	BPt20	-	^{13 Val tRNA}
1618827	1618901	-	75	33591275	BPt21	-	^{11 Arg tRNA}
1857742	1857828	+	87	33591275	BPt22	-	^{15 Leu tRNA}
2017236	2017328	+	93	33591275	BPt23	-	^{08 Ser tRNA}
2033259	2033335	+	77	33591275	BPt24	-	^{11 Arg tRNA}
2048459	2048535	+	77	33591275	BPt25	-	^{11 Arg tRNA}
2149043	2150574	+	1532	33591275	BPr01	-	16S ribosomal RNA
2150672	2150748	+	77	33591275	BPt26	-	^{14 Ile tRNA}
2150769	2150844	+	76	33591275	BPt27	-	^{02 Ala tRNA}
2151159	2154040	+	2882	33591275	BPr02	-	23S ribosomal RNA
2154215	2154329	+	115	33591275	BPr03	-	5S ribosomal RNA
2235156	2235231	+	76	33591275	BPt28	-	^{02 Ala tRNA}
2302366	2302444	-	79	33591275	BPt29	-	^{16 Met tRNA}
2351070	2351145	-	76	33591275	BPt30	-	^{09 His tRNA}
2441918	2442032	-	115	33591275	BPr04	-	5S ribosomal RNA
2442207	2445088	-	2882	33591275	BPr05	-
2445403	2445478	-	76	33591275	BPt31	-	^{02 Ala tRNA}
2445499	2445575	-	77	33591275	BPt32	-	^{14 Ile tRNA}
2445673	2447204	-	1532	33591275	BPr06	-	16S ribosomal RNA
2597285	2597374	+	90	33591275	BPt33	-	^{08 Ser tRNA}
2659402	2659477	+	76	33591275	BPt34	-	^{01 Gly tRNA}
2719331	2719407	-	77	33591275	BPt35	-	^{16 Met tRNA}
2723384	2723460	-	77	33591275	BPt36	-	^{03 Pro tRNA}
2996473	2996548	+	76	33591275	BPt37	-	^{10 Lys tRNA}
3018642	3018717	+	76	33591275	BPt38	-	^{10 Lys tRNA}
3227120	3227533	-	414	33591275	BPs02	-
3233470	3233584	-	115	33591275	BPr07	-	5S ribosomal RNA
3233759	3236640	-	2882	33591275	BPr08	-	23S ribosomal RNA
3236955	3237030	-	76	33591275	BPt39	-	^{02 Ala tRNA}
3237051	3237127	-	77	33591275	BPt40	-	^{14 Ile tRNA}
3237225	3238756	-	1532	33591275	BPr09	-	16S ribosomal RNA
3330517	3330593	-	77	33591275	BPt41	-	^{05 Gln tRNA}
3386646	3386736	-	91	33591275	BPt42	-	^{08 Ser tRNA}
3531905	3531979	+	75	33591275	BPt43	-	^{11 Arg tRNA}
3659461	3659534	-	74	33591275	BPt44	-	^{19 Cys tRNA}
3659595	3659670	-	76	33591275	BPt45	-	^{01 Gly tRNA}
3723442	3723518	-	77	33591275	BPt46	-	^{16 Met tRNA}
3735096	3735180	-	85	33591275	BPt47	-	^{15 Leu tRNA}
3736041	3736125	-	85	33591275	BPt48	-	^{15 Leu tRNA}
3742518	3742593	+	76	33591275	BPt49	-	^{13 Val tRNA}
3905567	3905640	+	74	33591275	BPt50	-	^{01 Gly tRNA}
3999800	3999875	+	76	33591275	BPt51	-	^{07 Asn tRNA}