Геном прокариот/Материалы:NC 002929

(перенаправлено с «Материалы:NC 002929»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_002929            4086189 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Bordetella pertussis Tohama I, complete genome.
   ACCESSION   NC_002929
   VERSION     NC_002929.2  GI:33591275
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Bordetella pertussis Tohama I
     ORGANISM  Bordetella pertussis Tohama I
               Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales;
               Alcaligenaceae; Bordetella.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4086189)
     AUTHORS   Parkhill,J., Sebaihia,M., Preston,A., Murphy,L.D., Thomson,N.,
               Harris,D.E., Holden,M.T., Churcher,C.M., Bentley,S.D.,
               Mungall,K.L., Cerdeno-Tarraga,A.M., Temple,L., James,K., Harris,B.,
               Quail,M.A., Achtman,M., Atkin,R., Baker,S., Basham,D., Bason,N.,
               Cherevach,I., Chillingworth,T., Collins,M., Cronin,A., Davis,P.,
               Doggett,J., Feltwell,T., Goble,A., Hamlin,N., Hauser,H.,
               Holroyd,S., Jagels,K., Leather,S., Moule,S., Norberczak,H.,
               O'Neil,S., Ormond,D., Price,C., Rabbinowitsch,E., Rutter,S.,
               Sanders,M., Saunders,D., Seeger,K., Sharp,S., Simmonds,M.,
               Skelton,J., Squares,R., Squares,S., Stevens,K., Unwin,L.,
               Whitehead,S., Barrell,B.G. and Maskell,D.J.
     TITLE     Comparative analysis of the genome sequences of Bordetella
               pertussis, Bordetella parapertussis and Bordetella bronchiseptica
     JOURNAL   Nat. Genet. 35 (1), 32-40 (2003)
      PUBMED   12910271
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4086189)
     AUTHORS   Sebaihia,M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-AUG-2003) Submitted on behalf of the Pathogen
               Sequencing Unit, Sanger Institute, Wellcome Trust Genome Campus,
               Hinxton, Cambridge CB10 1SA, E-mail: ms5@sanger.ac.uk
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4086189)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-APR-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BX470248.
               On Aug 12, 2003 this sequence version replaced gi:20070454.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК править

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
6236 6322 + 87 33591275 BPt01 - 18 Tyr tRNA
6511 6584 + 74 33591275 BPt02 - 01 Gly tRNA
6591 6665 + 75 33591275 BPt03 - 12 Thr tRNA
8023 8098 + 76 33591275 BPt04 - 20 Trp tRNA
71391 71475 - 85 33591275 BPt05 - 15 Leu tRNA
279202 279277 - 76 33591275 BPt06 - 12 Thr tRNA
405640 405714 - 75 33591275 BPt07 - 13 Val tRNA
692825 692900 - 76 33591275 BPt08 - 17 Phe tRNA
764870 764946 + 77 33591275 BPt09 - 03 Pro tRNA
822623 822707 - 85 33591275 BPt10 - 15 Leu tRNA
825583 825667 + 85 33591275 BPt11 - 15 Leu tRNA
916416 916492 + 77 33591275 BPt12 - 11 Arg tRNA
976380 976765 - 386 33591275 BPs01 - tmRNA
1077941 1078017 - 77 33591275 BPt13 - 06 Asp tRNA
1078053 1078128 - 76 33591275 BPt14 - 04 Glu tRNA
1078160 1078235 - 76 33591275 BPt15 - 02 Ala tRNA
1114417 1114493 - 77 33591275 BPt16 - 03 Pro tRNA
1301002 1301077 - 76 33591275 BPt17 - 12 Thr tRNA
1301250 1301325 + 76 33591275 BPt18 - 07 Asn tRNA
1305454 1305530 - 77 33591275 BPt19 - 16 Met tRNA
1569314 1569390 + 77 33591275 BPt20 - 13 Val tRNA
1618827 1618901 - 75 33591275 BPt21 - 11 Arg tRNA
1857742 1857828 + 87 33591275 BPt22 - 15 Leu tRNA
2017236 2017328 + 93 33591275 BPt23 - 08 Ser tRNA
2033259 2033335 + 77 33591275 BPt24 - 11 Arg tRNA
2048459 2048535 + 77 33591275 BPt25 - 11 Arg tRNA
2149043 2150574 + 1532 33591275 BPr01 - 16S ribosomal RNA
2150672 2150748 + 77 33591275 BPt26 - 14 Ile tRNA
2150769 2150844 + 76 33591275 BPt27 - 02 Ala tRNA
2151159 2154040 + 2882 33591275 BPr02 - 23S ribosomal RNA
2154215 2154329 + 115 33591275 BPr03 - 5S ribosomal RNA
2235156 2235231 + 76 33591275 BPt28 - 02 Ala tRNA
2302366 2302444 - 79 33591275 BPt29 - 16 Met tRNA
2351070 2351145 - 76 33591275 BPt30 - 09 His tRNA
2441918 2442032 - 115 33591275 BPr04 - 5S ribosomal RNA
2442207 2445088 - 2882 33591275 BPr05 -
2445403 2445478 - 76 33591275 BPt31 - 02 Ala tRNA
2445499 2445575 - 77 33591275 BPt32 - 14 Ile tRNA
2445673 2447204 - 1532 33591275 BPr06 - 16S ribosomal RNA
2597285 2597374 + 90 33591275 BPt33 - 08 Ser tRNA
2659402 2659477 + 76 33591275 BPt34 - 01 Gly tRNA
2719331 2719407 - 77 33591275 BPt35 - 16 Met tRNA
2723384 2723460 - 77 33591275 BPt36 - 03 Pro tRNA
2996473 2996548 + 76 33591275 BPt37 - 10 Lys tRNA
3018642 3018717 + 76 33591275 BPt38 - 10 Lys tRNA
3227120 3227533 - 414 33591275 BPs02 -
3233470 3233584 - 115 33591275 BPr07 - 5S ribosomal RNA
3233759 3236640 - 2882 33591275 BPr08 - 23S ribosomal RNA
3236955 3237030 - 76 33591275 BPt39 - 02 Ala tRNA
3237051 3237127 - 77 33591275 BPt40 - 14 Ile tRNA
3237225 3238756 - 1532 33591275 BPr09 - 16S ribosomal RNA
3330517 3330593 - 77 33591275 BPt41 - 05 Gln tRNA
3386646 3386736 - 91 33591275 BPt42 - 08 Ser tRNA
3531905 3531979 + 75 33591275 BPt43 - 11 Arg tRNA
3659461 3659534 - 74 33591275 BPt44 - 19 Cys tRNA
3659595 3659670 - 76 33591275 BPt45 - 01 Gly tRNA
3723442 3723518 - 77 33591275 BPt46 - 16 Met tRNA
3735096 3735180 - 85 33591275 BPt47 - 15 Leu tRNA
3736041 3736125 - 85 33591275 BPt48 - 15 Leu tRNA
3742518 3742593 + 76 33591275 BPt49 - 13 Val tRNA
3905567 3905640 + 74 33591275 BPt50 - 01 Gly tRNA
3999800 3999875 + 76 33591275 BPt51 - 07 Asn tRNA