Геном прокариот/Материалы:NC 003030

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_003030            3940880 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Clostridium acetobutylicum ATCC 824, complete genome.
   ACCESSION   NC_003030
   VERSION     NC_003030.1  GI:15893298
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Clostridium acetobutylicum ATCC 824
     ORGANISM  Clostridium acetobutylicum ATCC 824
               Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae;
               Clostridium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3940880)
     AUTHORS   Nolling,J., Breton,G., Omelchenko,M.V., Markarova,K.S., Zeng,Q.,
               Gibson,R., Lee,H.M., Dubois,J., Qiu,D., Hitti,J., Wolf,Y.I.,
               Tatusov,R.L., Sabathe,F., Doucette-Stamm,L., Soucaille,P.,
               Daly,M.J., Bennett,G.N., Koonin,E.V. and Smith,D.R.
     TITLE     Genome sequence and comparative analysis of the solvent-producing
               bacterium Clostridium acetobutylicum
     JOURNAL   J. Bacteriol. 183 (16), 4823-4838 (2001)
      PUBMED   11466286
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3940880)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-OCT-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3940880)
     AUTHORS   Childress,D., Zeng,Q. and Smith,D.R.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (24-JUL-2001) GTC Sequencing Center Production,
               Finishing, and Bioinformatics teams, Genome Therapeutics Corp., 100
               Beaver Street, Waltham, MA 02453-8443, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE001437.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
9710	11219	+	1510	15893298	CACr001	-	16Sa ribosomal RNA
11398	14303	+	2906	15893298	CACr002	-	23Sa ribosomal RNA
14377	14493	+	117	15893298	CACr003	-	5Sa ribosomal RNA
14497	14570	+	74	15893298	CACt001	-	^{16 Met tRNA}
14575	14647	+	73	15893298	CACt002	-	^{02 Ala tRNA}
34251	34338	+	88	15893298	CACt003	-	^{08 Ser tRNA}
34374	34461	+	88	15893298	CACt004	-	^{08 Ser tRNA}
35984	36057	+	74	15893298	CACt005	-	^{11 Arg tRNA}
45857	45930	+	74	15893298	CACt006	-	^{11 Arg tRNA}
134685	134773	+	89	15893298	CACt007	-	^{08 Ser tRNA}
135926	136012	+	87	15893298	CACt008	-	^{08 Ser tRNA}
136023	136223	+	201	15893298	CACs001	-	scrRNA
158336	159845	+	1510	15893298	CACr004	-	16Sb ribosomal RNA
160024	162929	+	2906	15893298	CACr005	-	23Sb ribosomal RNA
163004	163120	+	117	15893298	CACr006	-	5Sb ribosomal RNA
163474	164983	+	1510	15893298	CACr007	-	16Sc ribosomal RNA
165162	168067	+	2906	15893298	CACr008	-	23Sc ribosomal RNA
168142	168259	+	118	15893298	CACr009	-	5Sc ribosomal RNA
168613	170132	+	1520	15893298	CACr010	-	16Sd ribosomal RNA
170310	173215	+	2906	15893298	CACr011	-	23Sd ribosomal RNA
173290	173406	+	117	15893298	CACr012	-	5Sd ribosomal RNA
173412	173484	+	73	15893298	CACt009	-	^{10 Lys tRNA}
254689	256198	+	1510	15893298	CACr013	-	16Se ribosomal RNA
256377	259282	+	2906	15893298	CACr014	-	23Se ribosomal RNA
259356	259472	+	117	15893298	CACr015	-	5Se ribosomal RNA
259480	259552	+	73	15893298	CACt010	-	^{17 Phe tRNA}
310892	312401	+	1510	15893298	CACr016	-	16Sf ribosomal RNA
312580	315485	+	2906	15893298	CACr017	-	23Sf ribosomal RNA
315559	315675	+	117	15893298	CACr018	-	5Sf ribosomal RNA
315681	315753	+	73	15893298	CACt011	-	^{10 Lys tRNA}
331043	332552	+	1510	15893298	CACr019	-	16Sg ribosomal RNA
332731	335636	+	2906	15893298	CACr020	-	23Sg ribosomal RNA
335711	335827	+	117	15893298	CACr021	-	5Sg ribosomal RNA
336181	337690	+	1510	15893298	CACr022	-	16Sh ribosomal RNA
337869	340774	+	2906	15893298	CACr023	-	23Sh ribosomal RNA
340849	340966	+	118	15893298	CACr024	-	5Sh ribosomal RNA
341320	342829	+	1510	15893298	CACr025	-	16Si ribosomal RNA
343007	345912	+	2906	15893298	CACr026	-	23Si ribosomal RNA
345987	346103	+	117	15893298	CACr027	-	5Si ribosomal RNA
346111	346183	+	73	15893298	CACt012	-	^{17 Phe tRNA}
346199	346269	+	71	15893298	CACt013	-	^{19 Cys tRNA}
754087	754160	-	74	15893298	CACt014	-	^{05 Gln tRNA}
798430	798509	+	80	15893298	CACt015	-	^{15 Leu tRNA}
1105438	1106947	+	1510	15893298	CACr028	-	16Sj ribosomal RNA
1107126	1110031	+	2906	15893298	CACr029	-	23Sj ribosomal RNA
1110106	1110222	+	117	15893298	CACr030	-	5Sj ribosomal RNA
1110233	1110304	+	72	15893298	CACt016	-	^{07 Asn tRNA}
1211446	1211517	+	72	15893298	CAC1056	-	^{04 Glu tRNA}
1270430	1270510	+	81	15893298	CACt017	-	^{15 Leu tRNA}
2480104	2480174	-	71	15893298	CACt018	-	^{19 Cys tRNA}
2480186	2480257	-	72	15893298	CACt019	-	^{01 Gly tRNA}
2480273	2480345	-	73	15893298	CACt020	-	^{17 Phe tRNA}
2480353	2480426	-	74	15893298	CACt021	-	^{06 Asp tRNA}
2480454	2480526	-	73	15893298	CACt022	-	^{13 Val tRNA}
2699301	2699384	+	84	15893298	CACt023	-	^{15 Leu tRNA}
2779034	2779107	-	74	15893298	CACt024	-	^{11 Arg tRNA}
2779130	2779202	-	73	15893298	CACt025	-	Xaa tRNA
2779216	2779288	-	73	15893298	CACt026	-	^{03 Pro tRNA}
2779310	2779382	-	73	15893298	CACt027	-	^{10 Lys tRNA}
2779409	2779482	-	74	15893298	CACt028	-	^{11 Arg tRNA}
2779491	2779561	-	71	15893298	CACt029	-	^{01 Gly tRNA}
2779570	2779641	-	72	15893298	CACt030	-	^{01 Gly tRNA}
2779660	2779740	-	81	15893298	CACt031	-	^{15 Leu tRNA}
2779747	2779819	-	73	15893298	CACt032	-	^{10 Lys tRNA}
2779845	2779917	-	73	15893298	CACt033	-	^{05 Gln tRNA}
2779925	2779997	-	73	15893298	CACt034	-	^{09 His tRNA}
2780015	2780087	-	73	15893298	CACt035	-	^{10 Lys tRNA}
2780097	2780167	-	71	15893298	CACt036	-	^{01 Gly tRNA}
2780178	2780251	-	74	15893298	CACt037	-	^{11 Arg tRNA}
2780260	2780330	-	71	15893298	CACt038	-	^{01 Gly tRNA}
2780339	2780410	-	72	15893298	CACt039	-	^{01 Gly tRNA}
2780429	2780509	-	81	15893298	CACt040	-	^{15 Leu tRNA}
2780516	2780588	-	73	15893298	CACt041	-	^{10 Lys tRNA}
2780614	2780686	-	73	15893298	CACt042	-	^{05 Gln tRNA}
2780694	2780766	-	73	15893298	CACt043	-	^{09 His tRNA}
2780783	2780856	-	74	15893298	CACt044	-	^{11 Arg tRNA}
2780866	2780936	-	71	15893298	CACt045	-	^{01 Gly tRNA}
2780946	2781018	-	73	15893298	CACt046	-	^{03 Pro tRNA}
2942909	2942981	-	73	15893298	CACt047	-	^{20 Trp tRNA}
2991502	2991583	-	82	15893298	CACt048	-	^{18 Tyr tRNA}
2991592	2991664	-	73	15893298	CACt049	-	^{12 Thr tRNA}
2991683	2991755	-	73	15893298	CACt050	-	^{13 Val tRNA}
2991772	2991853	-	82	15893298	CACt051	-	^{18 Tyr tRNA}
3287916	3287988	-	73	15893298	CACt052	-	^{12 Thr tRNA}
3288000	3288071	-	72	15893298	CACt053	-	^{01 Gly tRNA}
3332592	3332663	-	72	15893298	CACt054	-	^{07 Asn tRNA}
3332674	3332790	-	117	15893298	CACr031	-	5Sk ribosomal RNA
3332865	3335770	-	2906	15893298	CACr032	-	23Sk ribosomal RNA
3335949	3337458	-	1510	15893298	CACr033	-	16Sk ribosomal RNA
3337964	3338036	-	73	15893298	CACt055	-	^{02 Ala tRNA}
3338041	3338114	-	74	15893298	CACt056	-	^{16 Met tRNA}
3341657	3341728	-	72	15893298	CACt057	-	^{07 Asn tRNA}
3354366	3354439	-	74	15893298	CACt058	-	^{16 Met tRNA}
3354449	3354521	-	73	15893298	CACt059	-	^{16 Met tRNA}
3354535	3354621	-	87	15893298	CACt060	-	^{15 Leu tRNA}
3376400	3376472	+	73	15893298	CACt071	-	^{03 Pro tRNA}
3376518	3376589	+	72	15893298	CACt072	-	^{03 Pro tRNA}
3506220	3506291	+	72	15893298	CACt061	-	^{07 Asn tRNA}
3789142	3789214	-	73	15893298	CACt062	-	^{12 Thr tRNA}
3789227	3789300	-	74	15893298	CACt063	-	^{06 Asp tRNA}
3789312	3789384	-	73	15893298	CACt064	-	^{13 Val tRNA}
3789404	3789475	-	72	15893298	CACt065	-	^{04 Glu tRNA}
3789491	3789563	-	73	15893298	CACt066	-	^{12 Thr tRNA}
3789578	3789651	-	74	15893298	CACt067	-	^{06 Asp tRNA}
3789663	3789735	-	73	15893298	CACt068	-	^{13 Val tRNA}
3789755	3789826	-	72	15893298	CACt069	-	^{04 Glu tRNA}
3919047	3919119	-	73	15893298	CACt070	-	^{12 Thr tRNA}