Геном прокариот/Материалы:NC 003030

(перенаправлено с «Материалы:NC 003030»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_003030            3940880 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Clostridium acetobutylicum ATCC 824, complete genome.
   ACCESSION   NC_003030
   VERSION     NC_003030.1  GI:15893298
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Clostridium acetobutylicum ATCC 824
     ORGANISM  Clostridium acetobutylicum ATCC 824
               Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae;
               Clostridium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3940880)
     AUTHORS   Nolling,J., Breton,G., Omelchenko,M.V., Markarova,K.S., Zeng,Q.,
               Gibson,R., Lee,H.M., Dubois,J., Qiu,D., Hitti,J., Wolf,Y.I.,
               Tatusov,R.L., Sabathe,F., Doucette-Stamm,L., Soucaille,P.,
               Daly,M.J., Bennett,G.N., Koonin,E.V. and Smith,D.R.
     TITLE     Genome sequence and comparative analysis of the solvent-producing
               bacterium Clostridium acetobutylicum
     JOURNAL   J. Bacteriol. 183 (16), 4823-4838 (2001)
      PUBMED   11466286
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3940880)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-OCT-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3940880)
     AUTHORS   Childress,D., Zeng,Q. and Smith,D.R.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (24-JUL-2001) GTC Sequencing Center Production,
               Finishing, and Bioinformatics teams, Genome Therapeutics Corp., 100
               Beaver Street, Waltham, MA 02453-8443, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE001437.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК править

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
9710 11219 + 1510 15893298 CACr001 - 16Sa ribosomal RNA
11398 14303 + 2906 15893298 CACr002 - 23Sa ribosomal RNA
14377 14493 + 117 15893298 CACr003 - 5Sa ribosomal RNA
14497 14570 + 74 15893298 CACt001 - 16 Met tRNA
14575 14647 + 73 15893298 CACt002 - 02 Ala tRNA
34251 34338 + 88 15893298 CACt003 - 08 Ser tRNA
34374 34461 + 88 15893298 CACt004 - 08 Ser tRNA
35984 36057 + 74 15893298 CACt005 - 11 Arg tRNA
45857 45930 + 74 15893298 CACt006 - 11 Arg tRNA
134685 134773 + 89 15893298 CACt007 - 08 Ser tRNA
135926 136012 + 87 15893298 CACt008 - 08 Ser tRNA
136023 136223 + 201 15893298 CACs001 - scrRNA
158336 159845 + 1510 15893298 CACr004 - 16Sb ribosomal RNA
160024 162929 + 2906 15893298 CACr005 - 23Sb ribosomal RNA
163004 163120 + 117 15893298 CACr006 - 5Sb ribosomal RNA
163474 164983 + 1510 15893298 CACr007 - 16Sc ribosomal RNA
165162 168067 + 2906 15893298 CACr008 - 23Sc ribosomal RNA
168142 168259 + 118 15893298 CACr009 - 5Sc ribosomal RNA
168613 170132 + 1520 15893298 CACr010 - 16Sd ribosomal RNA
170310 173215 + 2906 15893298 CACr011 - 23Sd ribosomal RNA
173290 173406 + 117 15893298 CACr012 - 5Sd ribosomal RNA
173412 173484 + 73 15893298 CACt009 - 10 Lys tRNA
254689 256198 + 1510 15893298 CACr013 - 16Se ribosomal RNA
256377 259282 + 2906 15893298 CACr014 - 23Se ribosomal RNA
259356 259472 + 117 15893298 CACr015 - 5Se ribosomal RNA
259480 259552 + 73 15893298 CACt010 - 17 Phe tRNA
310892 312401 + 1510 15893298 CACr016 - 16Sf ribosomal RNA
312580 315485 + 2906 15893298 CACr017 - 23Sf ribosomal RNA
315559 315675 + 117 15893298 CACr018 - 5Sf ribosomal RNA
315681 315753 + 73 15893298 CACt011 - 10 Lys tRNA
331043 332552 + 1510 15893298 CACr019 - 16Sg ribosomal RNA
332731 335636 + 2906 15893298 CACr020 - 23Sg ribosomal RNA
335711 335827 + 117 15893298 CACr021 - 5Sg ribosomal RNA
336181 337690 + 1510 15893298 CACr022 - 16Sh ribosomal RNA
337869 340774 + 2906 15893298 CACr023 - 23Sh ribosomal RNA
340849 340966 + 118 15893298 CACr024 - 5Sh ribosomal RNA
341320 342829 + 1510 15893298 CACr025 - 16Si ribosomal RNA
343007 345912 + 2906 15893298 CACr026 - 23Si ribosomal RNA
345987 346103 + 117 15893298 CACr027 - 5Si ribosomal RNA
346111 346183 + 73 15893298 CACt012 - 17 Phe tRNA
346199 346269 + 71 15893298 CACt013 - 19 Cys tRNA
754087 754160 - 74 15893298 CACt014 - 05 Gln tRNA
798430 798509 + 80 15893298 CACt015 - 15 Leu tRNA
1105438 1106947 + 1510 15893298 CACr028 - 16Sj ribosomal RNA
1107126 1110031 + 2906 15893298 CACr029 - 23Sj ribosomal RNA
1110106 1110222 + 117 15893298 CACr030 - 5Sj ribosomal RNA
1110233 1110304 + 72 15893298 CACt016 - 07 Asn tRNA
1211446 1211517 + 72 15893298 CAC1056 - 04 Glu tRNA
1270430 1270510 + 81 15893298 CACt017 - 15 Leu tRNA
2480104 2480174 - 71 15893298 CACt018 - 19 Cys tRNA
2480186 2480257 - 72 15893298 CACt019 - 01 Gly tRNA
2480273 2480345 - 73 15893298 CACt020 - 17 Phe tRNA
2480353 2480426 - 74 15893298 CACt021 - 06 Asp tRNA
2480454 2480526 - 73 15893298 CACt022 - 13 Val tRNA
2699301 2699384 + 84 15893298 CACt023 - 15 Leu tRNA
2779034 2779107 - 74 15893298 CACt024 - 11 Arg tRNA
2779130 2779202 - 73 15893298 CACt025 - Xaa tRNA
2779216 2779288 - 73 15893298 CACt026 - 03 Pro tRNA
2779310 2779382 - 73 15893298 CACt027 - 10 Lys tRNA
2779409 2779482 - 74 15893298 CACt028 - 11 Arg tRNA
2779491 2779561 - 71 15893298 CACt029 - 01 Gly tRNA
2779570 2779641 - 72 15893298 CACt030 - 01 Gly tRNA
2779660 2779740 - 81 15893298 CACt031 - 15 Leu tRNA
2779747 2779819 - 73 15893298 CACt032 - 10 Lys tRNA
2779845 2779917 - 73 15893298 CACt033 - 05 Gln tRNA
2779925 2779997 - 73 15893298 CACt034 - 09 His tRNA
2780015 2780087 - 73 15893298 CACt035 - 10 Lys tRNA
2780097 2780167 - 71 15893298 CACt036 - 01 Gly tRNA
2780178 2780251 - 74 15893298 CACt037 - 11 Arg tRNA
2780260 2780330 - 71 15893298 CACt038 - 01 Gly tRNA
2780339 2780410 - 72 15893298 CACt039 - 01 Gly tRNA
2780429 2780509 - 81 15893298 CACt040 - 15 Leu tRNA
2780516 2780588 - 73 15893298 CACt041 - 10 Lys tRNA
2780614 2780686 - 73 15893298 CACt042 - 05 Gln tRNA
2780694 2780766 - 73 15893298 CACt043 - 09 His tRNA
2780783 2780856 - 74 15893298 CACt044 - 11 Arg tRNA
2780866 2780936 - 71 15893298 CACt045 - 01 Gly tRNA
2780946 2781018 - 73 15893298 CACt046 - 03 Pro tRNA
2942909 2942981 - 73 15893298 CACt047 - 20 Trp tRNA
2991502 2991583 - 82 15893298 CACt048 - 18 Tyr tRNA
2991592 2991664 - 73 15893298 CACt049 - 12 Thr tRNA
2991683 2991755 - 73 15893298 CACt050 - 13 Val tRNA
2991772 2991853 - 82 15893298 CACt051 - 18 Tyr tRNA
3287916 3287988 - 73 15893298 CACt052 - 12 Thr tRNA
3288000 3288071 - 72 15893298 CACt053 - 01 Gly tRNA
3332592 3332663 - 72 15893298 CACt054 - 07 Asn tRNA
3332674 3332790 - 117 15893298 CACr031 - 5Sk ribosomal RNA
3332865 3335770 - 2906 15893298 CACr032 - 23Sk ribosomal RNA
3335949 3337458 - 1510 15893298 CACr033 - 16Sk ribosomal RNA
3337964 3338036 - 73 15893298 CACt055 - 02 Ala tRNA
3338041 3338114 - 74 15893298 CACt056 - 16 Met tRNA
3341657 3341728 - 72 15893298 CACt057 - 07 Asn tRNA
3354366 3354439 - 74 15893298 CACt058 - 16 Met tRNA
3354449 3354521 - 73 15893298 CACt059 - 16 Met tRNA
3354535 3354621 - 87 15893298 CACt060 - 15 Leu tRNA
3376400 3376472 + 73 15893298 CACt071 - 03 Pro tRNA
3376518 3376589 + 72 15893298 CACt072 - 03 Pro tRNA
3506220 3506291 + 72 15893298 CACt061 - 07 Asn tRNA
3789142 3789214 - 73 15893298 CACt062 - 12 Thr tRNA
3789227 3789300 - 74 15893298 CACt063 - 06 Asp tRNA
3789312 3789384 - 73 15893298 CACt064 - 13 Val tRNA
3789404 3789475 - 72 15893298 CACt065 - 04 Glu tRNA
3789491 3789563 - 73 15893298 CACt066 - 12 Thr tRNA
3789578 3789651 - 74 15893298 CACt067 - 06 Asp tRNA
3789663 3789735 - 73 15893298 CACt068 - 13 Val tRNA
3789755 3789826 - 72 15893298 CACt069 - 04 Glu tRNA
3919047 3919119 - 73 15893298 CACt070 - 12 Thr tRNA