Материалы:NC 003062

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_003062            2841581 bp    DNA     circular BCT 06-AUG-2007
   DEFINITION  Agrobacterium tumefaciens str. C58 chromosome circular, complete
               sequence.
   ACCESSION   NC_003062
   VERSION     NC_003062.1  GI:15887359
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Agrobacterium tumefaciens str. C58
     ORGANISM  Agrobacterium tumefaciens str. C58
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales;
               Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Agrobacterium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2841581)
     AUTHORS   Goodner,B., Hinkle,G., Gattung,S., Miller,N., Blanchard,M.,
               Qurollo,B., Goldman,B.S., Cao,Y., Askenazi,M., Halling,C.,
               Mullin,L., Houmiel,K., Gordon,J., Vaudin,M., Iartchouk,O., Epp,A.,
               Liu,F., Wollam,C., Allinger,M., Doughty,D., Scott,C., Lappas,C.,
               Markelz,B., Flanagan,C., Crowell,C., Gurson,J., Lomo,C., Sear,C.,
               Strub,G., Cielo,C. and Slater,S.
     TITLE     Genome sequence of the plant pathogen and biotechnology agent
               Agrobacterium tumefaciens C58
     JOURNAL   Science 294 (5550), 2323-2328 (2001)
      PUBMED   11743194
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2841581)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-OCT-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2841581)
     AUTHORS   Hinkle,G., Slater,S.C. and Goodner,B.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (14-AUG-2001) Cereon Genomics, 45 Sidney Street,
               Cambridge, MA 02139, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE007869.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
56567	58003	+	1437	15887359	AGR_C_r01	-	16S ribosomal RNA
58352	58428	+	77	15887359	AGR_C_t01	-	^{14 Ile tRNA}
58487	58562	+	76	15887359	AGR_C_t02	-	^{02 Ala tRNA}
59323	62147	+	2825	15887359	AGR_C_r03	-	23S ribosomal RNA
62405	62532	+	128	15887359	AGR_C_r04	-	5S ribosomal RNA
62763	62839	+	77	15887359	AGR_C_t03	-	^{16 Met tRNA}
128212	128301	-	90	15887359	AGR_C_t04	-	^{08 Ser tRNA}
230631	230717	-	87	15887359	AGR_C_t05	-	^{15 Leu tRNA}
382506	382582	+	77	15887359	AGR_C_t06	-	^{11 Arg tRNA}
410875	410950	-	76	15887359	AGR_C_t07	-	^{12 Thr tRNA}
430476	430549	+	74	15887359	AGR_C_t08	-	^{01 Gly tRNA}
496113	496188	+	76	15887359	AGR_C_892.1	-	^{17 Phe tRNA}
531472	531546	+	75	15887359	AGR_C_t09	-	^{12 Thr tRNA}
809286	809360	+	75	15887359	AGR_C_t10	-	^{05 Gln tRNA}
812939	813015	+	77	15887359	AGR_C_t11	-	^{03 Pro tRNA}
1010810	1010900	+	91	15887359	AGR_C_1875.1	-	^{08 Ser tRNA}
1184544	1184627	-	84	15887359	AGR_C_t12	-	^{15 Leu tRNA}
1216919	1216993	-	75	15887359	AGR_C_t13	-	^{07 Asn tRNA}
1220916	1220992	-	77	15887359	AGR_C_t14	-	^{03 Pro tRNA}
1254866	1254941	-	76	15887359	AGR_C_t32	-	^{13 Val tRNA}
1255387	1255463	+	77	15887359	AGR_C_t15	-	^{06 Asp tRNA}
1255505	1255581	+	77	15887359	AGR_C_t16	-	^{06 Asp tRNA}
1491632	1491721	-	90	15887359	AGR_C_2766.1	-	^{08 Ser tRNA}
1543165	1543249	-	85	15887359	AGR_C_2864.1	-	^{15 Leu tRNA}
1567059	1567133	+	75	15887359	AGR_C_t17	-	^{04 Glu tRNA}
1567586	1567660	+	75	15887359	AGR_C_t18	-	^{04 Glu tRNA}
1623408	1623483	+	76	15887359	AGR_C_t19	-	^{10 Lys tRNA}
1652218	1652300	-	83	15887359	AGR_C_t20	-	^{15 Leu tRNA}
1710877	1710950	-	74	15887359	AGR_C_t21	-	^{19 Cys tRNA}
1784098	1784173	+	76	15887359	AGR_C_t22	-	^{10 Lys tRNA}
1791512	1791588	-	77	15887359	AGR_C_t23	-	^{03 Pro tRNA}
1792206	1792282	+	77	15887359	AGR_C_t24	-	^{11 Arg tRNA}
1934940	1935015	-	76	15887359	AGR_C_t25	-	^{20 Trp tRNA}
1956571	1956644	-	74	15887359	AGR_C_3621.1	-	^{01 Gly tRNA}
1956670	1956754	-	85	15887359	AGR_C_3621.2	-	^{18 Tyr tRNA}
1969915	1969990	-	76	15887359	AGR_C_3647.1	-	^{12 Thr tRNA}
2128287	2128362	-	76	15887359	AGR_C_t26	-	^{16 Met tRNA}
2329932	2330008	+	77	15887359	AGR_C_t27	-	^{11 Arg tRNA}
2446363	2446437	+	75	15887359	AGR_C_t28	-	^{01 Gly tRNA}
2512127	2512203	-	77	15887359	AGR_C_t29	-	^{16 Met tRNA}
2512434	2512561	-	128	15887359	AGR_C_r05	-	5S ribosomal RNA
2512819	2515643	-	2825	15887359	AGR_C_r06	-	23S ribosomal RNA
2516404	2516479	-	76	15887359	AGR_C_t30	-	^{02 Ala tRNA}
2516538	2516614	-	77	15887359	AGR_C_t31	-	^{14 Ile tRNA}
2516962	2518398	-	1437	15887359	AGR_C_r02	-	16S ribosomal RNA