Викиверситет

Геном прокариот/Материалы:NC 003911

< Геном прокариот
(перенаправлено с «Материалы:NC 003911»)
 Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»
   LOCUS       NC_003911            4109442 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Silicibacter pomeroyi DSS-3, complete genome.
   ACCESSION   NC_003911
   VERSION     NC_003911.11  GI:56694928
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Silicibacter pomeroyi DSS-3
     ORGANISM  Silicibacter pomeroyi DSS-3
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales;
               Rhodobacteraceae; Silicibacter.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4109442)
     AUTHORS   Moran,M.A., Buchan,A., Gonzalez,J.M., Heidelberg,J.F.,
               Whitman,W.B., Kiene,R.P., Henriksen,J.R., King,G.M., Belas,R.,
               Fuqua,C., Brinkac,L., Lewis,M., Johri,S., Weaver,B., Pai,G.,
               Eisen,J.A., Rahe,E., Sheldon,W.M., Ye,W., Miller,T.R., Carlton,J.,
               Rasko,D.A., Paulsen,I.T., Ren,Q., Daugherty,S.C., Deboy,R.T.,
               Dodson,R.J., Durkin,A.S., Madupu,R., Nelson,W.C., Sullivan,S.A.,
               Rosovitz,M.J., Haft,D.H., Selengut,J. and Ward,N.
     TITLE     Genome sequence of Silicibacter pomeroyi reveals adaptations to the
               marine environment
     JOURNAL   Nature 432 (7019), 910-913 (2004)
      PUBMED   15602564
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4109442)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (17-DEC-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4109442)
     AUTHORS   Moran,M.A., Buchan,A., Gonzalez,J.M., Heidelberg,J.F.,
               Whitman,W.B., Kiene,R.P., Henriksen,J.R., King,G.M., Belas,R.,
               Fuqua,C., Brinkac,L., Lewis,M., Johri,S., Weaver,B., Pai,G.,
               Eisen,J.A., Rahe,E., Sheldon,W.M., Ye,W., Miller,T.R., Carlton,J.,
               Rasko,D.A., Paulsen,I.T., Ren,Q., Daugherty,S.C., DeBoy,R.T.,
               Dodson,R.J., Durkin,A.S., Madupu,R., Nelson,W.C., Sullivan,S.A.,
               Rosovitz,M., Haft,D.H., Selengut,J. and Ward,N.L.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (21-OCT-2004) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000031.
               On Dec 17, 2004 this sequence version replaced gi:51904980.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

править
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
176231 176306 + 76 56694928 SPO_tRNA-Gln-1 - 05 Gln tRNA
176312 176389 + 78 56694928 SPO_tRNA-Pro-2 - 03 Pro tRNA
228692 228768 - 77 56694928 SPO_tRNA-Pro-3 - 03 Pro tRNA
261910 263364 + 1455 56694928 SPO_Sp16SA - 16S ribosomal RNA
263580 263656 + 77 56694928 SPO_tRNA-Ile-1 - 14 Ile tRNA
263730 263805 + 76 56694928 SPO_tRNA-Ala-1 - 02 Ala tRNA
264255 267149 + 2895 56694928 SPO_Sp23SA - 23S ribosomal RNA
267353 267470 + 118 56694928 SPO_Sp5SD - 5S ribosomal RNA
294934 295009 + 76 56694928 SPO_tRNA-Lys-2 - 10 Lys tRNA
485387 485463 - 77 56694928 SPO_tRNA-Arg-2 - 11 Arg tRNA
537350 537426 + 77 56694928 SPO_tRNA-Arg-3 - 11 Arg tRNA
636094 636168 + 75 56694928 SPO_tRNA-Gln-2 - 05 Gln tRNA
726006 726081 - 76 56694928 SPO_tRNA-Val-2 - 13 Val tRNA
758890 758965 + 76 56694928 SPO_tRNA-Trp-2 - 20 Trp tRNA
1082915 1082990 + 76 56694928 SPO_tRNA-Thr-2 - 12 Thr tRNA
1205683 1205766 - 84 56694928 SPO_tRNA-Pseudo-2 -
1217181 1217255 - 75 56694928 SPO_tRNA-Gly-2 - 01 Gly tRNA
1217973 1218047 - 75 56694928 SPO_tRNA-Gly-3 - 01 Gly tRNA
1218081 1218155 - 75 56694928 SPO_tRNA-Gly-4 - 01 Gly tRNA
1307509 1307582 - 74 56694928 SPO_tRNA-Cys-2 - 19 Cys tRNA
1458077 1458163 + 87 56694928 SPO_tRNA-Leu-2 - 15 Leu tRNA
1849403 1849477 - 75 56694928 SPO_tRNA-Glu-2 - 04 Glu tRNA
1849667 1849741 - 75 56694928 SPO_tRNA-Glu-3 - 04 Glu tRNA
1886364 1886440 + 77 56694928 SPO_tRNA-His-1 - 09 His tRNA
2032300 2032611 - 312 56694928 SPO_SptmRNA1 - sRNA
2046619 2046708 + 90 56694928 SPO_tRNA-Ser-2 - 08 Ser tRNA
2119397 2119486 + 90 56694928 SPO_tRNA-Ser-3 - 08 Ser tRNA
2140232 2140307 - 76 56694928 SPO_tRNA-Thr-3 - 12 Thr tRNA
2140752 2140828 - 77 56694928 SPO_tRNA-Arg-4 - 11 Arg tRNA
2173838 2173911 + 74 56694928 SPO_tRNA-Gly-5 - 01 Gly tRNA
2251315 2251389 + 75 56694928 SPO_tRNA-Asn-1 - 07 Asn tRNA
2251642 2251727 - 86 56694928 SPO_tRNA-Leu-3 - 15 Leu tRNA
2274996 2275072 - 77 56694928 SPO_tRNA-Pro-4 - 03 Pro tRNA
2308217 2308292 + 76 56694928 SPO_tRNA-Met-2 - 16 Met tRNA
2310677 2310751 + 75 56694928 SPO_tRNA-Asn-2 - 07 Asn tRNA
2429430 2429513 - 84 56694928 SPO_tRNA-Leu-4 - 15 Leu tRNA
2645397 2645473 + 77 56694928 SPO_tRNA-Pro-5 - 03 Pro tRNA
2755575 2755651 - 77 56694928 SPO_tRNA-Asp-1 - 06 Asp tRNA
2755704 2755780 - 77 56694928 SPO_tRNA-Asp-2 - 06 Asp tRNA
2766850 2766924 - 75 56694928 SPO_tRNA-Val-3 - 13 Val tRNA
2929931 2930020 - 90 56694928 SPO_tRNA-Ser-4 - 08 Ser tRNA
3163914 3164254 - 341 56694928 SPO_SprnpB1 - sRNA
3206889 3206963 - 75 56694928 SPO_tRNA-Gly-6 - 01 Gly tRNA
3207063 3207149 - 87 56694928 SPO_tRNA-Leu-5 - 15 Leu tRNA
3461953 3462029 - 77 56694928 SPO_tRNA-Met-3 - 16 Met tRNA
3462072 3462189 - 118 56694928 SPO_Sp5SE - 5S ribosomal RNA
3462393 3465287 - 2895 56694928 SPO_Sp23SB - 23S ribosomal RNA
3465737 3465812 - 76 56694928 SPO_tRNA-Ala-2 - 02 Ala tRNA
3465886 3465962 - 77 56694928 SPO_tRNA-Ile-2 - 14 Ile tRNA
3466178 3467632 - 1455 56694928 SPO_Sp16SB - 16S ribosomal RNA
3481060 3481134 + 75 56694928 SPO_tRNA-Val-4 - 13 Val tRNA
3701370 3701446 + 77 56694928 SPO_tRNA-Met-4 - 16 Met tRNA
3827177 3827252 + 76 56694928 SPO_tRNA-Ala-3 - 02 Ala tRNA
3871397 3871486 + 90 56694928 SPO_tRNA-Ser-5 - 08 Ser tRNA
3892522 3892598 - 77 56694928 SPO_tRNA-Arg-5 - 11 Arg tRNA
3985347 3985433 + 87 56694928 SPO_tRNA-Leu-6 - 15 Leu tRNA
4010290 4010366 - 77 56694928 SPO_tRNA-Met-5 - 16 Met tRNA
4010409 4010526 - 118 56694928 SPO_Sp5SF - 5S ribosomal RNA
4010730 4013624 - 2895 56694928 SPO_Sp23SC - 23S ribosomal RNA
4014074 4014149 - 76 56694928 SPO_tRNA-Ala-4 - 02 Ala tRNA
4014223 4014299 - 77 56694928 SPO_tRNA-Ile-3 - 14 Ile tRNA
4014515 4015969 - 1455 56694928 SPO_Sp16SC - 16S ribosomal RNA
Источник — https://ru.wikiversity.org/w/index.php?title=Геном_прокариот/Материалы:NC_003911&oldid=156286