Материалы:NC 004061

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_004061             641454 bp    DNA     circular BCT 03-APR-2006
   DEFINITION  Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete genome.
   ACCESSION   NC_004061
   VERSION     NC_004061.1  GI:21672294
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
     ORGANISM  Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Buchnera.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 641454)
     AUTHORS   Tamas,I., Klasson,L., Canback,B., Naslund,A.K., Eriksson,A.S.,
               Wernegreen,J.J., Sandstrom,J.P., Moran,N.A. and Andersson,S.G.
     TITLE     50 million years of genomic stasis in endosymbiotic bacteria
     JOURNAL   Science 296 (5577), 2376-2379 (2002)
      PUBMED   12089438
   REFERENCE   2  (bases 1 to 641454)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 641454)
     AUTHORS   NCBI Microbial Genomes Annotation Project.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (24-AUG-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE013218.
               REFSEQ gene predictions performed by GeneMark 2.4/GeneMark.hmm 2.0
               with comparison to original submitter provided annotation. tRNA
               spans validated with tRNAscan-SE v.1.23.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
17956	18028	-	73	21672294	BUsg584	-	^{17 Phe tRNA}
48600	48672	-	73	21672294	BUsg585	-	^{12 Thr tRNA}
48697	48767	-	71	21672294	BUsg586	-	^{01 Gly tRNA}
48774	48855	-	82	21672294	BUsg587	-	^{18 Tyr tRNA}
48870	48942	-	73	21672294	BUsg588	-	^{12 Thr tRNA}
74766	74838	-	73	21672294	BUsg589	-	^{10 Lys tRNA}
74852	74924	-	73	21672294	BUsg590	-	^{13 Val tRNA}
76793	76864	+	72	21672294	BUsg591	-	^{02 Ala tRNA}
93336	93659	-	324	21672294	BUsg617	-	ribonuclease P RNA component
117388	117461	-	74	21672294	BUsg592	-	^{13 Val tRNA}
203361	203736	-	376	21672294	BUsg593	-	tmRNA
275522	277031	+	1510	21672294	BUsg618	-	16S ribosomal RNA
277128	277201	+	74	21672294	BUsg594	-	^{14 Ile tRNA}
277221	277293	+	73	21672294	BUsg595	-	^{02 Ala tRNA}
279396	279469	+	74	21672294	BUsg596	-	^{06 Asp tRNA}
366117	366201	-	85	21672294	BUsg597	-	^{15 Leu tRNA}
366219	366289	-	71	21672294	BUsg598	-	^{19 Cys tRNA}
366450	366534	+	85	21672294	BUsg599	-	^{08 Ser tRNA}
420585	420666	-	82	21672294	BUsg600	-	^{15 Leu tRNA}
443338	443427	+	90	21672294	BUsg601	-	^{08 Ser tRNA}
443463	443536	+	74	21672294	BUsg602	-	^{11 Arg tRNA}
449630	449701	-	72	21672294	BUsg603	-	^{05 Gln tRNA}
449742	449823	-	82	21672294	BUsg604	-	^{15 Leu tRNA}
449836	449909	-	74	21672294	BUsg605	-	^{16 Met tRNA}
505385	505458	-	74	21672294	BUsg606	-	^{16 Met tRNA}
536611	536684	-	74	21672294	BUsg607	-	^{11 Arg tRNA}
540138	540257	-	120	21672294	BUsg619	-	5S ribosomal RNA
540354	543274	-	2921	21672294	BUsg620	-	23S ribosomal RNA
543452	543523	-	72	21672294	BUsg608	-	^{04 Glu tRNA}
575257	575341	+	85	21672294	BUsg609	-	^{08 Ser tRNA}
592841	592913	-	73	21672294	BUsg610	-	^{07 Asn tRNA}
593047	593119	+	73	21672294	BUsg611	-	^{16 Met tRNA}
611053	611125	+	73	21672294	BUsg612	-	^{01 Gly tRNA}
626413	626486	-	74	21672294	BUsg613	-	^{03 Pro tRNA}
626520	626592	-	73	21672294	BUsg614	-	^{09 His tRNA}
626632	626706	-	75	21672294	BUsg615	-	^{11 Arg tRNA}
634355	634428	-	74	21672294	BUsg616	-	^{20 Trp tRNA}