Геном прокариот/Материалы:NC 006347

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_006347            5277274 bp    DNA     circular BCT 03-DEC-2005
   DEFINITION  Bacteroides fragilis YCH46, complete genome.
   ACCESSION   NC_006347
   VERSION     NC_006347.1  GI:53711291
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Bacteroides fragilis YCH46
     ORGANISM  Bacteroides fragilis YCH46
               Bacteria; Bacteroidetes; Bacteroidetes (class); Bacteroidales;
               Bacteroidaceae; Bacteroides.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 5277274)
     AUTHORS   Kuwahara,T., Yamashita,A., Hirakawa,H., Nakayama,H., Toh,H.,
               Okada,N., Kuhara,S., Hattori,M., Hayashi,T. and Ohnishi,Y.
     TITLE     Genomic analysis of Bacteroides fragilis reveals extensive DNA
               inversions regulating cell surface adaptation
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (41), 14919-14924 (2004)
      PUBMED   15466707
   REFERENCE   2  (bases 1 to 5277274)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (01-OCT-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 5277274)
     AUTHORS   Hattori,M., Yamashita,A., Toh,H., Oshima,K. and Shiba,T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (20-APR-2004) Kitasato Institute for Life Sciences,
               1-15-1, Kitasato, Sagamihara, Kanagawa 228-8555, Japan
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AP006841.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК править

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
74043	74113	+	71	53711291	BFtRNA01	-	^{05 Gln tRNA}
331622	331696	-	75	53711291	BFtRNA02	-	^{04 Glu tRNA}
473414	473498	-	85	53711291	BFtRNA03	-	^{15 Leu tRNA}
589029	589101	+	73	53711291	BFtRNA04	-	^{01 Gly tRNA}
589116	589199	+	84	53711291	BFtRNA05	-	^{15 Leu tRNA}
614061	614133	-	73	53711291	BFtRNA06	-	^{03 Pro tRNA}
614146	614218	-	73	53711291	BFtRNA07	-	^{17 Phe tRNA}
695538	695614	-	77	53711291	BFtRNA08	-	^{16 Met tRNA}
770190	770262	-	73	53711291	BFtRNA09	-	^{10 Lys tRNA}
879289	879366	-	78	53711291	BFtRNA10	-	^{03 Pro tRNA}
923978	924051	+	74	53711291	BFtRNA11	-	^{05 Gln tRNA}
1157377	1157452	-	76	53711291	BFtRNA12	-	^{01 Gly tRNA}
1157458	1157543	-	86	53711291	BFtRNA13	-	^{18 Tyr tRNA}
1422325	1422401	+	77	53711291	BFtRNA14	-	^{12 Thr tRNA}
1506263	1506350	+	88	53711291	BFtRNA15	-	^{08 Ser tRNA}
1584834	1584918	+	85	53711291	BFtRNA16	-	^{08 Ser tRNA}
1662518	1662589	+	72	53711291	BFtRNA17	-	^{19 Cys tRNA}
1690948	1691024	-	77	53711291	BFtRNA18	-	^{12 Thr tRNA}
1970118	1970190	-	73	53711291	BFtRNA19	-	^{12 Thr tRNA}
2136557	2136643	+	87	53711291	BFtRNA20	-	^{08 Ser tRNA}
2136722	2136796	+	75	53711291	BFtRNA21	-	^{04 Glu tRNA}
2330044	2330116	-	73	53711291	BFtRNA22	-	^{10 Lys tRNA}
2410290	2410366	+	77	53711291	BFtRNA23	-	^{06 Asp tRNA}
2609966	2610042	+	77	53711291	BFtRNA24	-	^{11 Arg tRNA}
2660087	2660162	-	76	53711291	BFtRNA25	-	^{10 Lys tRNA}
2663447	2663522	-	76	53711291	BFtRNA26	-	^{10 Lys tRNA}
2726254	2726331	-	78	53711291	BFtRNA27	-	^{03 Pro tRNA}
2726365	2726442	-	78	53711291	BFtRNA28	-	^{03 Pro tRNA}
2780183	2780259	-	77	53711291	BFtRNA29	-	^{11 Arg tRNA}
2780282	2780355	-	74	53711291	BFtRNA30	-	^{11 Arg tRNA}
2780374	2780447	-	74	53711291	BFtRNA31	-	^{11 Arg tRNA}
2858417	2858492	-	76	53711291	BFtRNA32	-	^{01 Gly tRNA}
2904202	2904274	-	73	53711291	BFtRNA33	-	^{01 Gly tRNA}
2904279	2904363	-	85	53711291	BFtRNA34	-	^{15 Leu tRNA}
2904426	2904501	-	76	53711291	BFtRNA35	-	^{01 Gly tRNA}
2904524	2904607	-	84	53711291	BFtRNA36	-	^{15 Leu tRNA}
2904642	2904726	-	85	53711291	BFtRNA37	-	^{15 Leu tRNA}
2904752	2904824	-	73	53711291	BFtRNA38	-	^{01 Gly tRNA}
3140678	3140786	-	109	53711291	BF5SrRNA01	-	5S ribosomal RNA
3140885	3143762	-	2878	53711291	BF23SrRNA01	-	23S ribosomal RNA
3143917	3143990	-	74	53711291	BFtRNA39	-	^{02 Ala tRNA}
3144019	3144095	-	77	53711291	BFtRNA40	-	^{14 Ile tRNA}
3144323	3145859	-	1537	53711291	BF16SrRNA01	-	16S ribosomal RNA
3453440	3453513	+	74	53711291	BFtRNA41	-	^{06 Asp tRNA}
3453544	3453620	+	77	53711291	BFtRNA42	-	^{06 Asp tRNA}
3655080	3655155	+	76	53711291	BFtRNA43	-	^{09 His tRNA}
3713658	3713731	+	74	53711291	BFtRNA44	-	^{02 Ala tRNA}
3944277	3944385	-	109	53711291	BF5SrRNA02	-	5S ribosomal RNA
3944484	3947362	-	2879	53711291	BF23SrRNA02	-	23S ribosomal RNA
3947513	3947586	-	74	53711291	BFtRNA45	-	^{02 Ala tRNA}
3947615	3947691	-	77	53711291	BFtRNA46	-	^{14 Ile tRNA}
3947850	3949386	-	1537	53711291	BF16SrRNA02	-	16S ribosomal RNA
3956374	3956446	+	73	53711291	BFtRNA47	-	^{17 Phe tRNA}
3972876	3972949	+	74	53711291	BFtRNA48	-
4095270	4095342	+	73	53711291	BFtRNA49	-	^{20 Trp tRNA}
4249141	4249228	-	88	53711291	BFtRNA50	-	^{08 Ser tRNA}
4350360	4350434	-	75	53711291	BFtRNA51	-	^{11 Arg tRNA}
4523401	4523509	-	109	53711291	BF5SrRNA03	-	5S ribosomal RNA
4523608	4526486	-	2879	53711291	BF23SrRNA03	-	23S ribosomal RNA
4526637	4526710	-	74	53711291	BFtRNA52	-	^{02 Ala tRNA}
4526739	4526815	-	77	53711291	BFtRNA53	-	^{14 Ile tRNA}
4527043	4528579	-	1537	53711291	BF16SrRNA03	-	16S ribosomal RNA
4590511	4590585	-	75	53711291	BFtRNA54	-	^{13 Val tRNA}
4590637	4590711	-	75	53711291	BFtRNA55	-	^{13 Val tRNA}
4590738	4590815	-	78	53711291	BFtRNA56	-	^{13 Val tRNA}
4672821	4672929	-	109	53711291	BF5SrRNA04	-	5S ribosomal RNA
4673028	4675905	-	2878	53711291	BF23SrRNA04	-	23S ribosomal RNA
4676056	4676129	-	74	53711291	BFtRNA57	-	^{02 Ala tRNA}
4676158	4676234	-	77	53711291	BFtRNA58	-	^{14 Ile tRNA}
4676388	4677924	-	1537	53711291	BF16SrRNA04	-	16S ribosomal RNA
4717266	4717341	+	76	53711291	BFtRNA59	-	^{16 Met tRNA}
4732179	4732287	-	109	53711291	BF5SrRNA05	-	5S ribosomal RNA
4732386	4735263	-	2878	53711291	BF23SrRNA05	-	23S ribosomal RNA
4735413	4735486	-	74	53711291	BFtRNA60	-	^{02 Ala tRNA}
4735515	4735591	-	77	53711291	BFtRNA61	-	^{14 Ile tRNA}
4735744	4737280	-	1537	53711291	BF16SrRNA05	-	16S ribosomal RNA
4793735	4793810	-	76	53711291	BFtRNA62	-	^{20 Trp tRNA}
4795099	4795170	-	72	53711291	BFtRNA63	-	^{12 Thr tRNA}
4795181	4795253	-	73	53711291	BFtRNA64	-	^{01 Gly tRNA}
4795282	4795367	-	86	53711291	BFtRNA65	-	^{18 Tyr tRNA}
4795439	4795515	-	77	53711291	BFtRNA66	-	^{12 Thr tRNA}
4810635	4810722	+	88	53711291	BFtRNA67	-
4919402	4919485	-	84	53711291	BFtRNA68	-	^{15 Leu tRNA}
4989982	4990055	+	74	53711291	BFtRNA69	-	^{07 Asn tRNA}
4990085	4990161	+	77	53711291	BFtRNA70	-	^{07 Asn tRNA}
5081003	5081077	-	75	53711291	BFtRNA71	-	^{11 Arg tRNA}
5184390	5184463	+	74	53711291	BFtRNA72	-	^{16 Met tRNA}
5191939	5192047	-	109	53711291	BF5SrRNA06	-	5S ribosomal RNA
5192146	5195023	-	2878	53711291	BF23SrRNA06	-	23S ribosomal RNA
5195173	5195246	-	74	53711291	BFtRNA73	-	^{02 Ala tRNA}
5195275	5195351	-	77	53711291	BFtRNA74	-	^{14 Ile tRNA}
5195504	5197040	-	1537	53711291	BF16SrRNA06	-	16S ribosomal RNA