Геном прокариот/Материалы:NC 006834

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_006834            4941439 bp    DNA     circular BCT 26-APR-2007
   DEFINITION  Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331, complete genome.
   ACCESSION   NC_006834
   VERSION     NC_006834.1  GI:58579623
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331
     ORGANISM  Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC10331
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xanthomonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4941439)
     AUTHORS   Lee,B.M., Park,Y.J., Park,D.S., Kang,H.W., Kim,J.G., Song,E.S.,
               Park,I.C., Yoon,U.H., Hahn,J.H., Koo,B.S., Lee,G.B., Kim,H.,
               Park,H.S., Yoon,K.O., Kim,J.H., Jung,C.H., Koh,N.H., Seo,J.S. and
               Go,S.J.
     TITLE     The genome sequence of Xanthomonas oryzae pathovar oryzae
               KACC10331, the bacterial blight pathogen of rice
     JOURNAL   Nucleic Acids Res. 33 (2), 577-586 (2005)
      PUBMED   15673718
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4941439)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (04-FEB-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4941439)
     AUTHORS   Park,D.S., Kang,H.W., Park,Y.J., Kim,J.G., Go,S.J., Hahn,J.H.,
               Lee,G.B., Kim,H., Park,H.S., Yoon,K.O., Kim,J.H., Jung,C.,
               Koh,N.H., Seo,J.S. and Lee,B.M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (23-SEP-2004) National Institute of Agricultural
               Biotechnology, Rural Development Administration, 225 Seodundong,
               Suwon 441-707, Republic of Korea
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE013598.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК править

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
305729	307275	+	1547	58579623	XOO4695	-	16S ribosomal RNA
307369	307444	+	76	58579623	XOO4658	-	^{02 Ala tRNA}
307464	307540	+	77	58579623	XOO4659	-	^{14 Ile tRNA}
307768	310650	+	2883	58579623	XOO4696	-	23S ribosomal RNA
310822	310938	+	117	58579623	XOO4697	-	5S ribosomal RNA
438757	438832	+	76	58579623	XOO4660	-	^{12 Thr tRNA}
460526	460602	-	77	58579623	XOO4657	-	^{11 Arg tRNA}
533015	534561	+	1547	58579623	XOO4692	-	16S ribosomal RNA
534655	534730	+	76	58579623	XOO4661	-	^{02 Ala tRNA}
534750	534826	+	77	58579623	XOO4662	-	^{14 Ile tRNA}
535054	537936	+	2883	58579623	XOO4693	-	23S ribosomal RNA
538108	538224	+	117	58579623	XOO4694	-	5S ribosomal RNA
625944	626020	+	77	58579623	XOO4663	-	^{16 Met tRNA}
637016	637082	+	67	58579623	XOO4664	-	^{16 Met tRNA}
913305	913379	+	75	58579623	XOO4665	-	^{13 Val tRNA}
1044914	1044990	+	77	58579623	XOO4666	-	^{03 Pro tRNA}
1045033	1045109	+	77	58579623	XOO4667	-	^{11 Arg tRNA}
1045142	1045218	+	77	58579623	XOO4668	-	^{09 His tRNA}
1045312	1045387	+	76	58579623	XOO4669	-	^{10 Lys tRNA}
1047796	1047880	+	85	58579623	XOO4670	-	^{15 Leu tRNA}
1054618	1054692	+	75	58579623	XOO4671	-	^{13 Val tRNA}
1054721	1054797	+	77	58579623	XOO4672	-	^{06 Asp tRNA}
1054892	1054968	+	77	58579623	XOO4673	-	^{06 Asp tRNA}
1064108	1064198	+	91	58579623	XOO4674	-	^{08 Ser tRNA}
1086660	1086752	-	93	58579623	XOO4656	-	^{08 Ser tRNA}
1676562	1676637	+	76	58579623	XOO4675	-	^{12 Thr tRNA}
1741306	1741381	+	76	58579623	XOO4676	-	^{10 Lys tRNA}
2184937	2185023	-	87	58579623	XOO4655	-	^{15 Leu tRNA}
2221174	2221263	+	90	58579623	XOO4677	-	^{08 Ser tRNA}
2354786	2354862	+	77	58579623	XOO4678	-	^{11 Arg tRNA}
2425749	2425824	-	76	58579623	XOO4654	-	^{01 Gly tRNA}
2425907	2425980	-	74	58579623	XOO4653	-	^{19 Cys tRNA}
2426049	2426124	-	76	58579623	XOO4652	-	^{01 Gly tRNA}
2458274	2458360	-	87	58579623	XOO4651	-	^{15 Leu tRNA}
2494456	2494542	+	87	58579623	XOO4679	-	^{15 Leu tRNA}
2511595	2511669	+	75	58579623	XOO4680	-	^{04 Glu tRNA}
2810540	2810615	+	76	58579623	XOO4681	-	^{02 Ala tRNA}
2810663	2810738	+	76	58579623	XOO4682	-	^{04 Glu tRNA}
2811498	2811573	+	76	58579623	XOO4683	-	^{02 Ala tRNA}
2811621	2811696	+	76	58579623	XOO4684	-	^{04 Glu tRNA}
2823520	2823596	+	77	58579623	XOO4685	-	^{03 Pro tRNA}
2908876	2908951	+	76	58579623	XOO4686	-	^{02 Ala tRNA}
3138528	3138604	+	77	58579623	XOO4687	-	^{11 Arg tRNA}
3138698	3138774	+	77	58579623	XOO4688	-	^{11 Arg tRNA}
3146171	3146263	-	93	58579623	XOO4650	-	^{08 Ser tRNA}
3315064	3315147	+	84	58579623	XOO4689	-	^{15 Leu tRNA}
3395034	3395109	-	76	58579623	XOO4649	-	^{17 Phe tRNA}
3417046	3417122	-	77	58579623	XOO4648	-	^{03 Pro tRNA}
3427012	3427086	-	75	58579623	XOO4647	-	^{13 Val tRNA}
3429934	3430010	-	77	58579623	XOO4646	-	^{07 Asn tRNA}
3461173	3461249	-	77	58579623	XOO4645	-	^{16 Met tRNA}
3476376	3476460	-	85	58579623	XOO4644	-	^{15 Leu tRNA}
3591612	3591685	-	74	58579623	XOO4643	-	^{01 Gly tRNA}
3861851	3861926	-	76	58579623	XOO4642	-	^{20 Trp tRNA}
3863269	3863344	-	76	58579623	XOO4641	-	^{12 Thr tRNA}
3863379	3863453	-	75	58579623	XOO4640	-	^{01 Gly tRNA}
3863483	3863568	-	86	58579623	XOO4639	-	^{18 Tyr tRNA}
3867356	3867432	-	77	58579623	XOO4638	-	^{05 Gln tRNA}
4430541	4430617	+	77	58579623	XOO4690	-	^{16 Met tRNA}
4430670	4430743	+	74	58579623	XOO4691	-	^{05 Gln tRNA}