Геном прокариот/Материалы:NC 007109

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_007109            1485148 bp    DNA     circular BCT 03-APR-2006
   DEFINITION  Rickettsia felis URRWXCal2, complete genome.
   ACCESSION   NC_007109
   VERSION     NC_007109.1  GI:67458392
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Rickettsia felis URRWXCal2
     ORGANISM  Rickettsia felis URRWXCal2
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rickettsiales;
               Rickettsiaceae; Rickettsieae; Rickettsia; spotted fever group.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1485148)
     AUTHORS   Ogata,H., Renesto,P., Audic,S., Robert,C., Blanc,G., Fournier,P.E.,
               Parinello,H., Claverie,J.M. and Raoult,D.
     TITLE     The genome sequence of Rickettsia felis identifies the first
               putative conjugative plasmid in an obligate intracellular parasite
     JOURNAL   PLoS Biol. 3 (8), E248 (2005)
      PUBMED   15984913
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1485148)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-JUN-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1485148)
     AUTHORS   Ogata,H., Renesto,P., Audic,S., Robert,C., Blanc,G.,
               Fournier,P.-E., Parinello,H., Claverie,J.-M. and Raoult,D.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (23-FEB-2005) Information Genomique et Structurale, Unite
               des Rickettsies, CNRS, Marseille, France
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000053.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК править

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
12718	12793	-	76	67458392	RF_RNA01	-	^{17 Phe tRNA}
26143	26217	+	75	67458392	RF_RNA02	-	^{04 Glu tRNA}
64702	64776	+	75	67458392	RF_RNA03	-	^{12 Thr tRNA}
89491	89567	+	77	67458392	RF_RNA04	-	^{16 Met tRNA}
188193	188284	-	92	67458392	RF_RNA05	-	^{08 Ser tRNA}
199037	199594	+	558	67458392	RF_RNA06	-	tmRNA precursor
239600	239676	-	77	67458392	RF_RNA07	-	^{09 His tRNA}
290780	290865	-	86	67458392	RF_RNA08	-	^{15 Leu tRNA}
303850	303935	+	86	67458392	RF_RNA09	-	^{18 Tyr tRNA}
304105	304178	+	74	67458392	RF_RNA10	-	^{01 Gly tRNA}
319592	319667	+	76	67458392	RF_RNA11	-	^{13 Val tRNA}
341684	344444	+	2761	67458392	RF_RNA12	-	23S ribosomal RNA
344706	344824	+	119	67458392	RF_RNA13	-	5S ribosomal RNA
456383	457890	+	1508	67458392	RF_RNA14	-	16S ribosomal RNA
607499	607573	+	75	67458392	RF_RNA15	-	^{19 Cys tRNA}
639914	639989	+	76	67458392	RF_RNA16	-	^{10 Lys tRNA}
640003	640079	+	77	67458392	RF_RNA17	-	^{14 Ile tRNA}
754349	754425	-	77	67458392	RF_RNA18	-	^{06 Asp tRNA}
799298	799751	+	454	67458392	RF_RNA19	-	RNA subunit (M1 RNA) of ribonuclease P
826650	826726	-	77	67458392	RF_RNA20	-	^{13 Val tRNA}
830721	830796	+	76	67458392	RF_RNA21	-	^{02 Ala tRNA}
848111	848198	-	88	67458392	RF_RNA22	-	^{08 Ser tRNA}
871194	871283	-	90	67458392	RF_RNA23	-	^{08 Ser tRNA}
887335	887411	+	77	67458392	RF_RNA24	-	^{11 Arg tRNA}
887568	887642	-	75	67458392	RF_RNA25	-	^{05 Gln tRNA}
985346	985422	-	77	67458392	RF_RNA26	-	^{11 Arg tRNA}
995750	995824	-	75	67458392	RF_RNA27	-	^{02 Ala tRNA}
1008673	1008759	+	87	67458392	RF_RNA28	-	^{15 Leu tRNA}
1015023	1015097	+	75	67458392	RF_RNA29	-	^{01 Gly tRNA}
1058009	1058085	+	77	67458392	RF_RNA30	-	^{16 Met tRNA}
1061324	1061398	-	75	67458392	RF_RNA31	-	^{07 Asn tRNA}
1190869	1190944	+	76	67458392	RF_RNA32	-	^{12 Thr tRNA}
1227257	1227332	-	76	67458392	RF_RNA33	-	^{20 Trp tRNA}
1298971	1299047	-	77	67458392	RF_RNA34	-	^{16 Met tRNA}
1377430	1377506	+	77	67458392	RF_RNA35	-	^{03 Pro tRNA}
1416652	1416728	-	77	67458392	RF_RNA36	-	^{11 Arg tRNA}
1454213	1454295	+	83	67458392	RF_RNA37	-	signal recognition particle RNA (4.5S RNA)
1463780	1463864	-	85	67458392	RF_RNA38	-	^{15 Leu tRNA}
1470882	1470956	-	75	67458392	RF_RNA39	-	^{12 Thr tRNA}