Геном прокариот/Материалы:NC 007576

(перенаправлено с «Материалы:NC 007576»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_007576            1884661 bp    DNA     circular BCT 16-AUG-2007
   DEFINITION  Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K, complete genome.
   ACCESSION   NC_007576
   VERSION     NC_007576.1  GI:81427616
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K
     ORGANISM  Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Lactobacillaceae;
               Lactobacillus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1884661)
     AUTHORS   Chaillou,S., Champomier-Verges,M.C., Cornet,M., Crutz-Le Coq,A.M.,
               Dudez,A.M., Martin,V., Beaufils,S., Darbon-Rongere,E., Bossy,R.,
               Loux,V. and Zagorec,M.
     TITLE     The complete genome sequence of the meat-borne lactic acid
               bacterium Lactobacillus sakei 23K
     JOURNAL   Nat. Biotechnol. 23 (12), 1527-1533 (2005)
      PUBMED   16273110
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1884661)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-NOV-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CR936503.
               Clone requests: stephane.chaillou@jouy.inra.fr.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК править

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
72122 72197 - 76 81427616 LSAt01 - Anticodon: CTT
285387 285458 + 72 81427616 LSAt02 - Anticodon: TTG
306178 307748 + 1571 81427616 LSAr01 - 16S ribosomal RNA
307972 310890 + 2919 81427616 LSAr02 - 23S ribosomal RNA
310982 311098 + 117 81427616 LSAr03 - 5S ribosomal RNA
328601 328673 + 73 81427616 LSAt03 - Anticodon: GGT
445757 447106 + 1350 81427616 LSAr04 - 16S ribosomal RNA
447330 450248 + 2919 81427616 LSAr05 - 23S ribosomal RNA
450340 450456 + 117 81427616 LSAr06 - 5S ribosomal RNA
450467 450539 + 73 81427616 LSAt04 - Anticodon: TAC
450542 450614 + 73 81427616 LSAt05 - Anticodon: TTT
450637 450720 + 84 81427616 LSAt06 - Anticodon: TAG
450756 450828 + 73 81427616 LSAt07 - Anticodon: TGT
450836 450907 + 72 81427616 LSAt08 - Anticodon: GCC
450922 451010 + 89 81427616 LSAt09 - Anticodon: TAA
451022 451095 + 74 81427616 LSAt10 - Anticodon: ACG
451101 451174 + 74 81427616 LSAt11 - Anticodon: TGG
451212 451285 + 74 81427616 LSAt12 - Anticodon: CAT
451302 451375 + 74 81427616 LSAt13 - Anticodon: CAT
451421 451494 + 74 81427616 LSAt14 - Anticodon: CAT
451497 451570 + 74 81427616 LSAt15 - Anticodon: GTC
451580 451652 + 73 81427616 LSAt16 - Anticodon: GAA
451665 451735 + 71 81427616 LSAt17 - Anticodon: TCC
451742 451815 + 74 81427616 LSAt18 - Anticodon: GAT
451830 451917 + 88 81427616 LSAt19 - Anticodon: GCT
451926 451997 + 72 81427616 LSAt20 - Anticodon: TTC
452031 452114 + 84 81427616 LSAt21 - Anticodon: TGA
452128 452201 + 74 81427616 LSAt22 - Anticodon: CAT
452204 452277 + 74 81427616 LSAt23 - Anticodon: GTC
452287 452359 + 73 81427616 LSAt24 - Anticodon: GAA
452365 452445 + 81 81427616 LSAt25 - Anticodon: GTA
452453 452523 + 71 81427616 LSAt26 - Anticodon: CCA
452583 452655 + 73 81427616 LSAt27 - Anticodon: GTG
452665 452736 + 72 81427616 LSAt28 - Anticodon: TTG
452764 452834 + 71 81427616 LSAt29 - Anticodon: GCA
452872 452955 + 84 81427616 LSAt30 - Anticodon: CAA
478891 480461 + 1571 81427616 LSAr07 - 16S ribosomal RNA
480685 483603 + 2919 81427616 LSAr08 - 23S ribosomal RNA
483696 483774 + 79 81427616 LSAr09 - 5S ribosomal RNA
483816 483888 + 73 81427616 LSAt31 - Anticodon: GTT
483900 483989 + 90 81427616 LSAt32 - Anticodon: GGA
484007 484078 + 72 81427616 LSAt33 - Anticodon: TTC
484084 484156 + 73 81427616 LSAt34 - Anticodon: TAC
484169 484242 + 74 81427616 LSAt35 - Anticodon: GTC
605263 605334 - 72 81427616 LSAt36 - Anticodon: CCG
643528 643601 - 74 81427616 LSAt37 - Anticodon: TCT
723096 723183 + 88 81427616 LSAt38 - Anticodon: CGA
819576 819659 + 84 81427616 LSAt39 - Anticodon: TGA
1147448 1147520 - 73 81427616 LSAt40 - Anticodon: CTC
1147936 1148008 + 73 81427616 LSAt41 - Anticodon: CTG
1282894 1282969 + 76 81427616 LSAt42 - Anticodon: CGC
1393639 1393712 - 74 81427616 LSAt43 - Anticodon: CCC
1400546 1400632 - 87 81427616 LSAt44 - Anticodon: CAG
1500671 1500744 - 74 81427616 LSAt45 - Anticodon: CCT
1535684 1535768 - 85 81427616 LSAt46 - Anticodon: AAG
1569085 1569156 - 72 81427616 LSAt47 - Anticodon: TTG
1569163 1569243 - 81 81427616 LSAt48 - Anticodon: GTA
1571949 1572024 - 76 81427616 LSAt49 - Anticodon: CGT
1572032 1572103 - 72 81427616 LSAt50 - Anticodon: TTC
1572148 1572220 - 73 81427616 LSAt51 - Anticodon: GTT
1572226 1572342 - 117 81427616 LSAr10 - 5S ribosomal RNA
1572433 1575351 - 2919 81427616 LSAr11 - 23S ribosomal RNA
1575575 1577145 - 1571 81427616 LSAr12 - 16S ribosomal RNA
1758161 1758234 - 74 81427616 LSAt52 - Anticodon: CGG
1758268 1758339 - 72 81427616 LSAt53 - Anticodon: GCC
1758366 1758439 - 74 81427616 LSAt54 - Anticodon: TGG
1758445 1758518 - 74 81427616 LSAt55 - Anticodon: ACG
1758530 1758618 - 89 81427616 LSAt56 - Anticodon: TAA
1758633 1758704 - 72 81427616 LSAt57 - Anticodon: GCC
1758712 1758784 - 73 81427616 LSAt58 - Anticodon: TGT
1758820 1758903 - 84 81427616 LSAt59 - Anticodon: TAG
1758926 1758998 - 73 81427616 LSAt60 - Anticodon: TTT
1759001 1759073 - 73 81427616 LSAt61 - Anticodon: TAC
1759084 1759200 - 117 81427616 LSAr13 - 5S ribosomal RNA
1759292 1762210 - 2919 81427616 LSAr14 - 23S ribosomal RNA
1762383 1762455 - 73 81427616 LSAt62 - Anticodon: TGC
1762482 1762555 - 74 81427616 LSAt63 - Anticodon: GAT
1762644 1763993 - 1350 81427616 LSAr15 - 16S ribosomal RNA
1863713 1863829 - 117 81427616 LSAr16 - 5S ribosomal RNA
1863921 1866839 - 2919 81427616 LSAr17 - 23S ribosomal RNA
1867063 1868633 - 1571 81427616 LSAr18 - 16S ribosomal RNA
1869130 1869246 - 117 81427616 LSAr19 - 5S ribosomal RNA
1869337 1872255 - 2919 81427616 LSAr20 - 23S ribosomal RNA
1872479 1873828 - 1350 81427616 LSAr21 - 16S ribosomal RNA