Материалы:NC 007606

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_007606            4369232 bp    DNA     circular BCT 02-MAR-2006
   DEFINITION  Shigella dysenteriae Sd197, complete genome.
   ACCESSION   NC_007606
   VERSION     NC_007606.1  GI:82775382
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Shigella dysenteriae Sd197
     ORGANISM  Shigella dysenteriae Sd197
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Shigella.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4369232)
     AUTHORS   Yang,F., Yang,J., Zhang,X., Chen,L., Jiang,Y., Yan,Y., Tang,X.,
               Wang,J., Xiong,Z., Dong,J., Xue,Y., Zhu,Y., Xu,X., Sun,L., Chen,S.,
               Nie,H., Peng,J., Xu,J., Wang,Y., Yuan,Z., Wen,Y., Yao,Z., Shen,Y.,
               Qiang,B., Hou,Y., Yu,J. and Jin,Q.
     TITLE     Genome dynamics and diversity of Shigella species, the etiologic
               agents of bacillary dysentery
     JOURNAL   Nucleic Acids Res. 33 (19), 6445-6458 (2005)
      PUBMED   16275786
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4369232)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (30-NOV-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4369232)
     AUTHORS   Jin,Q., Yang,F., Yang,J., Jiang,Y., Yan,Y., Chen,L., Zhang,X.,
               Peng,J., Tang,X., Xiong,Z., Nie,H., Dong,J., Xue,Y., Xu,X., Zhu,Y.,
               Shen,Y., Qiang,B. and Hou,Y.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (29-OCT-2004) State Key Laboratory for Moleclular
               Virology and Genetic Engineering, Microbial Genome Center of
               Chinese Ministry of Public Health, 6 Rongjing Eastern Street, BDA,
               Beijing 100176, P. R. China
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000034.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
224744	226285	+	1542	82775382	SDY_0220	-	16S ribosomal RNA
226354	226430	+	77	82775382	SDY_0221	-	^{14 Ile tRNA}
226473	226548	+	76	82775382	SDY_0222	-	^{02 Ala tRNA}
226723	229624	+	2902	82775382	SDY_0223	-	23S ribosomal RNA
229718	229836	+	119	82775382	SDY_0224	-	5S ribosomal RNA
229889	229965	+	77	82775382	SDY_0225	-	^{06 Asp tRNA}
238096	238172	+	77	82775382	SDY_0235	-	^{06 Asp tRNA}
254305	254381	+	77	82775382	SDY_0259	-	^{11 Arg tRNA}
460403	460478	-	76	82775382	SDY_0472	-	^{12 Thr tRNA}
552537	552610	-	74	82775382	SDY_0573	-	^{01 Gly tRNA}
552614	552689	-	76	82775382	SDY_0574	-	^{12 Thr tRNA}
552692	552768	-	77	82775382	SDY_0575	-	^{11 Arg tRNA}
552770	552846	-	77	82775382	SDY_0576	-	^{16 Met tRNA}
569916	569990	-	75	82775382	SDY_0600	-	^{05 Gln tRNA}
570039	570115	-	77	82775382	SDY_0602	-	^{16 Met tRNA}
570131	570205	-	75	82775382	SDY_0603	-	^{05 Gln tRNA}
570240	570314	-	75	82775382	SDY_0605	-	^{05 Gln tRNA}
570338	570422	-	85	82775382	SDY_0606	-	^{15 Leu tRNA}
570431	570507	-	77	82775382	SDY_0607	-	^{16 Met tRNA}
653182	653257	+	76	82775382	SDY_0691	-	^{10 Lys tRNA}
653404	653479	+	76	82775382	SDY_0692	-	^{10 Lys tRNA}
653513	653588	+	76	82775382	SDY_0693	-	^{10 Lys tRNA}
838023	838099	-	77	82775382	SDY_0890	-	^{03 Pro tRNA}
894284	894371	-	88	82775382	SDY_0946	-	^{08 Ser tRNA}
952153	952240	+	88	82775382	SDY_1005	-	^{08 Ser tRNA}
1005132	1005221	-	90	82775382	SDY_1071	-	^{08 Ser tRNA}
1006213	1006288	+	76	82775382	SDY_1073	-	^{07 Asn tRNA}
1032986	1033061	+	76	82775382	SDY_1107	-	^{01 Gly tRNA}
1033116	1033189	+	74	82775382	SDY_1108	-	^{19 Cys tRNA}
1033202	1033288	+	87	82775382	SDY_1109	-	^{15 Leu tRNA}
1189324	1189408	-	85	82775382	SDY_1283	-	^{18 Tyr tRNA}
1324384	1324459	+	76	82775382	SDY_1437	-	^{16 Met tRNA}
1324558	1324634	+	77	82775382	SDY_1438	-	^{11 Arg tRNA}
1727495	1727571	+	77	82775382	SDY_1892	-	^{13 Val tRNA}
1727576	1727652	+	77	82775382	SDY_1893	-	^{13 Val tRNA}
1810224	1810300	+	77	82775382	SDY_1994	-	^{16 Met tRNA}
1810302	1810378	+	77	82775382	SDY_1995	-	^{11 Arg tRNA}
1810381	1810456	+	76	82775382	SDY_1996	-	^{12 Thr tRNA}
1810460	1810534	+	75	82775382	SDY_1997	-	^{01 Gly tRNA}
2045201	2045276	-	76	82775382	SDY_2244	-	^{07 Asn tRNA}
2047609	2047684	-	76	82775382	SDY_2247	-	^{07 Asn tRNA}
2049416	2049491	+	76	82775382	SDY_2250	-	^{07 Asn tRNA}
2180695	2180782	+	88	82775382	SDY_2378	-	^{08 Ser tRNA}
2348583	2348657	+	75	82775382	SDY_2552	-	^{11 Arg tRNA}
2393975	2394050	-	76	82775382	SDY_2595	-	^{02 Ala tRNA}
2398497	2398572	+	76	82775382	SDY_2601	-	^{13 Val tRNA}
2398616	2398691	+	76	82775382	SDY_2602	-	^{13 Val tRNA}
2398696	2398771	+	76	82775382	SDY_2603	-	^{10 Lys tRNA}
2621924	2622042	-	119	82775382	SDY_2831	-	5S ribosomal RNA
2622136	2625037	-	2902	82775382	SDY_2832	-	23S ribosomal RNA
2625222	2625297	-	76	82775382	SDY_2833	-	^{04 Glu tRNA}
2625384	2626925	-	1542	82775382	SDY_2834	-	16S ribosomal RNA
2671698	2671774	-	77	82775382	SDY_2888	-	^{11 Arg tRNA}
2671973	2672049	-	77	82775382	SDY_2889	-	^{11 Arg tRNA}
2672245	2672321	-	77	82775382	SDY_2890	-	^{11 Arg tRNA}
2672325	2672417	-	93	82775382	SDY_2891	-	^{08 Ser tRNA}
2804124	2804200	+	77	82775382	SDY_3032	-	^{16 Met tRNA}
2804235	2804311	+	77	82775382	SDY_3033	-	^{16 Met tRNA}
2878460	2878535	-	76	82775382	SDY_3103	-	^{17 Phe tRNA}
3015902	3015977	+	76	82775382	SDY_3253	-	^{16 Met tRNA}
3108924	3109000	-	77	82775382	SDY_3350	-	^{16 Met tRNA}
3113477	3113563	-	87	82775382	SDY_3355	-	^{15 Leu tRNA}
3205862	3205978	-	117	82775382	SDY_3449	-	5S ribosomal RNA
3206019	3206094	-	76	82775382	SDY_3450	-	^{12 Thr tRNA}
3206107	3206225	-	119	82775382	SDY_3451	-	5S ribosomal RNA
3206319	3209220	-	2902	82775382	SDY_3452	-	23S ribosomal RNA
3209395	3209470	-	76	82775382	SDY_3453	-	^{02 Ala tRNA}
3209513	3209589	-	77	82775382	SDY_3454	-	^{14 Ile tRNA}
3209658	3211199	-	1542	82775382	SDY_3455	-	16S ribosomal RNA
3444784	3444902	-	119	82775382	SDY_3716	-	5S ribosomal RNA
3444996	3447897	-	2902	82775382	SDY_3717	-	23S ribosomal RNA
3448082	3448157	-	76	82775382	SDY_3718	-	^{04 Glu tRNA}
3448244	3449785	-	1542	82775382	SDY_3719	-	16S ribosomal RNA
3482839	3482914	-	76	82775382	SDY_3749	-	^{12 Thr tRNA}
3482921	3482995	-	75	82775382	SDY_3750	-	^{01 Gly tRNA}
3483112	3483196	-	85	82775382	SDY_3751	-	^{18 Tyr tRNA}
3483205	3483280	-	76	82775382	SDY_3752	-	^{12 Thr tRNA}
3486746	3486864	-	119	82775382	SDY_3757	-	5S ribosomal RNA
3486958	3489859	-	2902	82775382	SDY_3758	-	23S ribosomal RNA
3490044	3490119	-	76	82775382	SDY_3759	-	^{04 Glu tRNA}
3490206	3491747	-	1542	82775382	SDY_3760	-	16S ribosomal RNA
3619839	3619957	-	119	82775382	SDY_3890	-	5S ribosomal RNA
3620051	3622952	-	2902	82775382	SDY_3891	-	23S ribosomal RNA
3623127	3623202	-	76	82775382	SDY_3892	-	^{02 Ala tRNA}
3623245	3623321	-	77	82775382	SDY_3893	-	^{14 Ile tRNA}
3623390	3624931	-	1542	82775382	SDY_3894	-	16S ribosomal RNA
3680433	3680509	-	77	82775382	SDY_3948	-	^{03 Pro tRNA}
3680552	3680638	-	87	82775382	SDY_3949	-	^{15 Leu tRNA}
3680659	3680734	-	76	82775382	SDY_3950	-	^{09 His tRNA}
3680793	3680869	-	77	82775382	SDY_3951	-	^{11 Arg tRNA}
3718795	3718870	-	76	82775382	SDY_3986	-	^{20 Trp tRNA}
3718879	3718955	-	77	82775382	SDY_3987	-	^{06 Asp tRNA}
3719008	3719126	-	119	82775382	SDY_3988	-	5S ribosomal RNA
3719220	3722121	-	2902	82775382	SDY_3989	-	23S ribosomal RNA
3722306	3722381	-	76	82775382	SDY_3990	-	^{04 Glu tRNA}
3722468	3724009	-	1542	82775382	SDY_3991	-	16S ribosomal RNA
4019704	4019788	+	85	82775382	SDY_4289	-	^{15 Leu tRNA}
4142716	4142791	-	76	82775382	SDY_4427	-	^{01 Gly tRNA}
4142827	4142902	-	76	82775382	SDY_4428	-	^{01 Gly tRNA}
4142939	4143014	-	76	82775382	SDY_4429	-	^{01 Gly tRNA}
4153366	4153441	-	76	82775382	SDY_4439	-	^{17 Phe tRNA}
4186256	4186326	+	71	82775382	SDY_4471	-	^{15 Leu tRNA}
4284566	4284642	-	77	82775382	SDY_4568	-	^{03 Pro tRNA}
4293303	4293397	+	95	82775382	SDY_4579	-	Sec tRNA
4333508	4333594	-	87	82775382	SDY_4627	-	^{15 Leu tRNA}
4333629	4333716	-	88	82775382	SDY_4628	-	^{15 Leu tRNA}
4333745	4333831	-	87	82775382	SDY_4629	-	^{15 Leu tRNA}