Геном прокариот/Материалы:NC 007705

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_007705            4940217 bp    DNA     circular BCT 30-MAR-2006
   DEFINITION  Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018, complete genome.
   ACCESSION   NC_007705
   VERSION     NC_007705.1  GI:84621657
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018
     ORGANISM  Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xanthomonas.
   REFERENCE   1
     AUTHORS   Ochiai,H., Inoue,Y., Takeya,M., Sasaki,A. and Kaku,H.
     TITLE     Genome sequence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae suggests
               contribution of large numbers of effector genes and insertion
               sequences to its race diversity
     JOURNAL   JARQ 39, 275-287 (2005)
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4940217)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (09-JAN-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4940217)
     AUTHORS   Ochiai,H., Inoue,Y., Takeya,M., Sasaki,A. and Kaku,H.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (16-NOV-2004) Hirokazu Ochiai, National Institute of
               Agrobiological Sciences, Genetic Diversity; 2-1-2 Kannondai,
               Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan (E-mail:ochiaih@nias.affrc.go.jp,
               Tel:81-29-838-7452, Fax:81-29-838-7451)
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AP008229.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
293626	295175	+	1550	84621657	XOO_r01	-	16S ribosomal RNA
295269	295344	+	76	84621657	XOO_r02	-	^{02 Ala tRNA}
295364	295440	+	77	84621657	XOO_r03	-	^{14 Ile tRNA}
295668	298590	+	2923	84621657	XOO_r04	-	23S ribosomal RNA
298722	298840	+	119	84621657	XOO_r05	-	5S ribosomal RNA
426679	426754	+	76	84621657	XOO_r06	-	^{12 Thr tRNA}
448446	448522	-	77	84621657	XOO_r07	-	^{11 Arg tRNA}
520867	522416	+	1550	84621657	XOO_r08	-	16S ribosomal RNA
522510	522585	+	76	84621657	XOO_r09	-	^{02 Ala tRNA}
522605	522681	+	77	84621657	XOO_r10	-	^{14 Ile tRNA}
522909	525831	+	2923	84621657	XOO_r11	-	23S ribosomal RNA
525963	526081	+	119	84621657	XOO_r12	-	5S ribosomal RNA
613808	613883	+	76	84621657	XOO_r13	-	^{16 Met tRNA}
881935	882009	+	75	84621657	XOO_r14	-	^{13 Val tRNA}
1012227	1012303	+	77	84621657	XOO_r15	-	^{03 Pro tRNA}
1012346	1012422	+	77	84621657	XOO_r16	-	^{11 Arg tRNA}
1012455	1012531	+	77	84621657	XOO_r17	-	^{09 His tRNA}
1012625	1012700	+	76	84621657	XOO_r18	-	^{10 Lys tRNA}
1015106	1015190	+	85	84621657	XOO_r19	-	^{15 Leu tRNA}
1021927	1022001	+	75	84621657	XOO_r20	-	^{13 Val tRNA}
1022030	1022106	+	77	84621657	XOO_r21	-	^{06 Asp tRNA}
1022201	1022277	+	77	84621657	XOO_r22	-	^{06 Asp tRNA}
1030594	1030684	+	91	84621657	XOO_r23	-	^{08 Ser tRNA}
1053135	1053227	-	93	84621657	XOO_r24	-	^{08 Ser tRNA}
1659582	1659657	+	76	84621657	XOO_r25	-	^{12 Thr tRNA}
1723607	1723682	+	76	84621657	XOO_r26	-	^{10 Lys tRNA}
2165034	2165120	-	87	84621657	XOO_r27	-	^{15 Leu tRNA}
2200156	2200245	+	90	84621657	XOO_r28	-	^{08 Ser tRNA}
2329636	2329712	+	77	84621657	XOO_r29	-	^{11 Arg tRNA}
2405677	2405752	-	76	84621657	XOO_r30	-	^{01 Gly tRNA}
2405835	2405908	-	74	84621657	XOO_r31	-	^{19 Cys tRNA}
2405977	2406052	-	76	84621657	XOO_r32	-	^{01 Gly tRNA}
2438204	2438290	-	87	84621657	XOO_r33	-	^{15 Leu tRNA}
2474149	2474235	+	87	84621657	XOO_r34	-	^{15 Leu tRNA}
2491288	2491362	+	75	84621657	XOO_r35	-	^{04 Glu tRNA}
2788174	2788249	+	76	84621657	XOO_r36	-	^{02 Ala tRNA}
2788297	2788372	+	76	84621657	XOO_r37	-	^{04 Glu tRNA}
2789132	2789207	+	76	84621657	XOO_r38	-	^{02 Ala tRNA}
2789255	2789330	+	76	84621657	XOO_r39	-	^{04 Glu tRNA}
2800698	2800774	+	77	84621657	XOO_r40	-	^{03 Pro tRNA}
2887016	2887091	+	76	84621657	XOO_r41	-	^{02 Ala tRNA}
3131220	3131296	+	77	84621657	XOO_r42	-	^{11 Arg tRNA}
3131390	3131466	+	77	84621657	XOO_r43	-	^{11 Arg tRNA}
3138863	3138955	-	93	84621657	XOO_r44	-	^{08 Ser tRNA}
3320071	3320154	+	84	84621657	XOO_r45	-	^{15 Leu tRNA}
3402661	3402736	-	76	84621657	XOO_r46	-	^{17 Phe tRNA}
3423554	3423630	-	77	84621657	XOO_r47	-	^{03 Pro tRNA}
3433519	3433593	-	75	84621657	XOO_r48	-	^{13 Val tRNA}
3436441	3436517	-	77	84621657	XOO_r49	-	^{07 Asn tRNA}
3465440	3465516	-	77	84621657	XOO_r50	-	^{16 Met tRNA}
3480643	3480727	-	85	84621657	XOO_r51	-	^{15 Leu tRNA}
3594191	3594264	-	74	84621657	XOO_r52	-	^{01 Gly tRNA}
3861178	3861253	-	76	84621657	XOO_r53	-	^{20 Trp tRNA}
3862596	3862671	-	76	84621657	XOO_r54	-	^{12 Thr tRNA}
3862706	3862779	-	74	84621657	XOO_r55	-	^{01 Gly tRNA}
3862809	3862894	-	86	84621657	XOO_r56	-	^{18 Tyr tRNA}
3866682	3866758	-	77	84621657	XOO_r57	-	^{05 Gln tRNA}
4428036	4428112	+	77	84621657	XOO_r58	-	^{16 Met tRNA}
4428165	4428238	+	74	84621657	XOO_r59	-	^{05 Gln tRNA}