Вы находитесь в Инкубаторе
Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Обработать/использовать материал

   LOCUS       NC_009800            4643538 bp    DNA     circular BCT 14-SEP-2007
   DEFINITION  Escherichia coli HS, complete genome.
   ACCESSION   NC_009800
   VERSION     NC_009800.1  GI:157159467
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Escherichia coli HS
     ORGANISM  Escherichia coli HS
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Escherichia.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4643538)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-SEP-2007) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4643538)
     AUTHORS   Rasko,D.A., Rosovitz,M., Kaper,J.B., Nataro,J.P., Myers,G.S.,
               Seshadri,R., Cer,R.Z. and Ravel,J.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-AUG-2007) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000802.
               Source DNA and bacteria available from Jacques Ravel
               (jravel@tigr.org).
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

править
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
187870 188005 + 136 157159467 EcHS_A4731 - t44 RNA
223160 224701 + 1542 157159467 EcHS_A4732 - 16S ribosomal RNA
224770 224846 + 77 157159467 EcHS_A4641 - 14 Ile tRNA
224888 224965 + 78 157159467 EcHS_A4642 - 02 Ala tRNA
225139 228041 + 2903 157159467 EcHS_A4733 - 23S ribosomal RNA
228136 228251 + 116 157159467 EcHS_A4734 - 5S ribosomal RNA
228305 228383 + 79 157159467 EcHS_A4643 - 06 Asp tRNA
236529 236607 + 79 157159467 EcHS_A4644 - 06 Asp tRNA
291741 291816 + 76 157159467 EcHS_A4645 - 12 Thr tRNA
411322 411402 + 81 157159467 EcHS_A4646 - Xaa tRNA
542520 542619 + 100 157159467 EcHS_A4735 - bacterial signal recognition particle RNA
573269 573352 + 84 157159467 EcHS_A4736 - sroB RNA
624260 624338 + 79 157159467 EcHS_A4647 - 11 Arg tRNA
714829 714991 - 163 157159467 EcHS_A4737 - sroC RNA
725439 725515 - 77 157159467 EcHS_A4648 - 05 Gln tRNA
725551 725627 - 77 157159467 EcHS_A4649 - 05 Gln tRNA
725673 725751 - 79 157159467 EcHS_A4650 - 16 Met tRNA
725765 725841 - 77 157159467 EcHS_A4651 - 05 Gln tRNA
725875 725949 - 75 157159467 EcHS_A4652 - 05 Gln tRNA
725972 726058 - 87 157159467 EcHS_A4653 - 15 Leu tRNA
726065 726143 - 79 157159467 EcHS_A4654 - 16 Met tRNA
807407 807484 + 78 157159467 EcHS_A4655 - 10 Lys tRNA
807618 807695 + 78 157159467 EcHS_A4656 - 13 Val tRNA
807697 807772 + 76 157159467 EcHS_A4657 - 10 Lys tRNA
807824 807899 + 76 157159467 EcHS_A4658 - 13 Val tRNA
807903 807978 + 76 157159467 EcHS_A4659 - 10 Lys tRNA
808124 808201 + 78 157159467 EcHS_A4660 - 10 Lys tRNA
808333 808408 + 76 157159467 EcHS_A4661 - 10 Lys tRNA
948276 948354 - 79 157159467 EcHS_A4738 - rybB RNA
986231 986320 - 90 157159467 EcHS_A4662 - 08 Ser tRNA
1093238 1093327 - 90 157159467 EcHS_A4663 - 08 Ser tRNA
1160460 1160549 - 90 157159467 EcHS_A4664 - 08 Ser tRNA
1210269 1210437 + 169 157159467 EcHS_A4740 - sraB RNA
1279068 1279146 + 79 157159467 EcHS_A4741 - C0299 RNA
1335326 1335412 - 87 157159467 EcHS_A4665 - 18 Tyr tRNA
1335795 1335881 - 87 157159467 EcHS_A4666 - 18 Tyr tRNA
1451882 1452061 + 180 157159467 EcHS_A4742 - IS061 RNA
1455615 1455689 + 75 157159467 EcHS_A4743 - C0343 RNA
1460310 1460432 + 123 157159467 EcHS_A4744 - IS063 RNA
1768458 1768536 + 79 157159467 EcHS_A4667 - 13 Val tRNA
1768539 1768617 + 79 157159467 EcHS_A4668 - 13 Val tRNA
1786737 1786804 + 68 157159467 EcHS_A4745 - rydB RNA
1792396 1792503 + 108 157159467 EcHS_A4746 - rprA RNA
1906219 1906304 - 86 157159467 EcHS_A4747 - sroD RNA
1942043 1942291 + 249 157159467 EcHS_A4748 - sraC/ryeA RNA
1942081 1942180 - 100 157159467 EcHS_A4749 - RyeB RNA
1991910 1991987 + 78 157159467 EcHS_A4750 - C0465 RNA
2011442 2011528 - 87 157159467 EcHS_A4669 - 15 Leu tRNA
2011541 2011614 - 74 157159467 EcHS_A4670 - 19 Cys tRNA
2011669 2011744 - 76 157159467 EcHS_A4671 - 01 Gly tRNA
2044967 2045053 - 87 157159467 EcHS_A4751 - DsrA RNA
2082069 2082160 - 92 157159467 EcHS_A4672 - 08 Ser tRNA
2083150 2083227 + 78 157159467 EcHS_A4673 - 07 Asn tRNA
2096629 2096706 - 78 157159467 EcHS_A4674 - 07 Asn tRNA
2098453 2098530 + 78 157159467 EcHS_A4675 - 07 Asn tRNA
2100861 2100938 + 78 157159467 EcHS_A4676 - 07 Asn tRNA
2197516 2197664 + 149 157159467 EcHS_A4752 - QUAD RNA
2197851 2197993 + 143 157159467 EcHS_A4753 - QUAD RNA
2211353 2211438 + 86 157159467 EcHS_A4754 - RyeE RNA
2328388 2328466 + 79 157159467 EcHS_A4677 - 03 Pro tRNA
2354067 2354160 + 94 157159467 EcHS_A4756 - micF RNA
2507928 2508004 + 77 157159467 EcHS_A4678 - 11 Arg tRNA
2549442 2549519 - 78 157159467 EcHS_A4679 - 02 Ala tRNA
2549558 2549633 - 76 157159467 EcHS_A4680 - 02 Ala tRNA
2552333 2552408 + 76 157159467 EcHS_A4681 - 13 Val tRNA
2552452 2552529 + 78 157159467 EcHS_A4682 - 13 Val tRNA
2552574 2552651 + 78 157159467 EcHS_A4683 - 13 Val tRNA
2552655 2552730 + 76 157159467 EcHS_A4684 - 10 Lys tRNA
2678234 2678325 - 92 157159467 EcHS_A4757 - sroE RNA
2691154 2691362 + 209 157159467 EcHS_A4758 - IS128 RNA
2691494 2691797 + 304 157159467 EcHS_A4759 - ryfA RNA
2729526 2729674 + 149 157159467 EcHS_A4760 - tke1 RNA
2765684 2765799 - 116 157159467 EcHS_A4761 - 5S ribosomal RNA
2765894 2768797 - 2904 157159467 EcHS_A4762 - 23S ribosomal RNA
2768981 2769058 - 78 157159467 EcHS_A4686 - 04 Glu tRNA
2769229 2770770 - 1542 157159467 EcHS_A4763 - 16S ribosomal RNA
2795869 2796231 + 363 157159467 EcHS_A4764 - tmRNA
2803207 2803282 - 76 157159467 EcHS_A4687 - 16 Met tRNA
2832351 2832425 + 75 157159467 EcHS_A4766 - sraD RNA
2835200 2835278 - 79 157159467 EcHS_A4688 - 11 Arg tRNA
2835475 2835553 - 79 157159467 EcHS_A4689 - 11 Arg tRNA
2835614 2835692 - 79 157159467 EcHS_A4690 - 11 Arg tRNA
2835889 2835967 - 79 157159467 EcHS_A4691 - 11 Arg tRNA
2835969 2836063 - 95 157159467 EcHS_A4692 - 08 Ser tRNA
2942365 2942724 - 360 157159467 EcHS_A4767 - CsrB/RsmB RNA family
2960905 2961017 + 113 157159467 EcHS_A4768 - gcvB RNA
2965596 2965672 + 77 157159467 EcHS_A4693 - 16 Met tRNA
2965706 2965782 + 77 157159467 EcHS_A4694 - 16 Met tRNA
2965816 2965892 + 77 157159467 EcHS_A4695 - 16 Met tRNA
2965926 2966002 + 77 157159467 EcHS_A4696 - 16 Met tRNA
2994422 2994509 - 88 157159467 EcHS_A4769 - sraE/rygA/rygB family RNA
2994625 2994706 - 82 157159467 EcHS_A4770 - sraE/rygA/rygB family RNA
3026497 3026572 - 76 157159467 EcHS_A4697 - 01 Gly tRNA
3083494 3083676 + 183 157159467 EcHS_A4771 - 6S / SsrS RNA
3084326 3084476 + 151 157159467 EcHS_A4772 - QUAD RNA
3139284 3139361 + 78 157159467 EcHS_A4698 - 17 Phe tRNA
3158992 3159213 + 222 157159467 EcHS_A4773 - C0719 RNA
3238140 3238289 - 150 157159467 EcHS_A4775 - QUAD RNA
3238515 3238664 - 150 157159467 EcHS_A4776 - QUAD RNA
3259042 3259119 + 78 157159467 EcHS_A4699 - 16 Met tRNA
3281710 3281897 + 188 157159467 EcHS_A4777 - SraF RNA
3318852 3319152 - 301 157159467 EcHS_A4778 - RNase P, class A
3362151 3362324 + 174 157159467 EcHS_A4779 - SraG RNA
3362554 3362668 - 115 157159467 EcHS_A4780 - Ribosomal S15 leader
3369139 3369215 - 77 157159467 EcHS_A4700 - 16 Met tRNA
3372997 3373085 - 89 157159467 EcHS_A4701 - 15 Leu tRNA
3401504 3401611 + 108 157159467 EcHS_A4781 - SraH RNA
3467768 3467883 - 116 157159467 EcHS_A4782 - 5S ribosomal RNA
3467922 3467999 - 78 157159467 EcHS_A4702 - 12 Thr tRNA
3468013 3468128 - 116 157159467 EcHS_A4783 - 5S ribosomal RNA
3468223 3471126 - 2904 157159467 EcHS_A4784 - 23S ribosomal RNA
3471300 3471377 - 78 157159467 EcHS_A4703 - 02 Ala tRNA
3471419 3471495 - 77 157159467 EcHS_A4704 - 14 Ile tRNA
3471564 3473105 - 1542 157159467 EcHS_A4785 - 16S ribosomal RNA
3627962 3628051 - 90 157159467 EcHS_A4787 - RyhB RNA
3706172 3706285 + 114 157159467 EcHS_A4788 - IS183 RNA
3737918 3737996 - 79 157159467 EcHS_A4705 - 03 Pro tRNA
3865805 3865899 + 95 157159467 EcHS_A4706 - Sec tRNA
3970219 3971760 + 1542 157159467 EcHS_A4789 - 16S ribosomal RNA
3971845 3971922 + 78 157159467 EcHS_A4707 - 04 Glu tRNA
3972115 3975018 + 2904 157159467 EcHS_A4790 - 23S ribosomal RNA
3975113 3975228 + 116 157159467 EcHS_A4791 - 5S ribosomal RNA
3975282 3975360 + 79 157159467 EcHS_A4708 - 06 Asp tRNA
3975367 3975444 + 78 157159467 EcHS_A4709 - 20 Trp tRNA
4010788 4010864 + 77 157159467 EcHS_A4710 - 11 Arg tRNA
4010922 4010999 + 78 157159467 EcHS_A4711 - 09 His tRNA
4011018 4011106 + 89 157159467 EcHS_A4712 - 15 Leu tRNA
4011147 4011225 + 79 157159467 EcHS_A4713 - 03 Pro tRNA
4013276 4013447 + 172 157159467 EcHS_A4792 - SraJ RNA
4065789 4067330 + 1542 157159467 EcHS_A4793 - 16S ribosomal RNA
4067399 4067475 + 77 157159467 EcHS_A4714 - 14 Ile tRNA
4067517 4067594 + 78 157159467 EcHS_A4715 - 02 Ala tRNA
4067777 4070680 + 2904 157159467 EcHS_A4794 - 23S ribosomal RNA
4070869 4070984 + 116 157159467 EcHS_A4795 - 5S ribosomal RNA
4080070 4080188 + 119 157159467 EcHS_A4796 - Spot 42 RNA
4081217 4081470 + 254 157159467 EcHS_A4797 - CsrC RNA family
4187951 4188060 - 110 157159467 EcHS_A4798 - oxyS RNA
4196325 4197867 + 1543 157159467 EcHS_A4800 - 16S ribosomal RNA
4197952 4198029 + 78 157159467 EcHS_A4716 - 04 Glu tRNA
4198222 4201125 + 2904 157159467 EcHS_A4801 - 23S ribosomal RNA
4201221 4201336 + 116 157159467 EcHS_A4802 - 5S ribosomal RNA
4204969 4205046 + 78 157159467 EcHS_A4717 - 12 Thr tRNA
4205054 4205138 + 85 157159467 EcHS_A4718 - 18 Tyr tRNA
4205255 4205329 + 75 157159467 EcHS_A4719 - 01 Gly tRNA
4205335 4205412 + 78 157159467 EcHS_A4720 - 12 Thr tRNA
4219909 4220069 - 161 157159467 EcHS_A4803 - sroH RNA
4237708 4239249 + 1542 157159467 EcHS_A4805 - 16S ribosomal RNA
4239334 4239411 + 78 157159467 EcHS_A4721 - 04 Glu tRNA
4239604 4242507 + 2904 157159467 EcHS_A4806 - 23S ribosomal RNA
4242603 4242718 + 116 157159467 EcHS_A4807 - 5S ribosomal RNA
4386573 4386650 - 78 157159467 EcHS_A4722 - 17 Phe tRNA
4417101 4417176 + 76 157159467 EcHS_A4723 - 01 Gly tRNA
4417212 4417289 + 78 157159467 EcHS_A4724 - 01 Gly tRNA
4417323 4417400 + 78 157159467 EcHS_A4725 - 01 Gly tRNA
4532533 4532619 + 87 157159467 EcHS_A4726 - 15 Leu tRNA
4609393 4609481 - 89 157159467 EcHS_A4727 - 15 Leu tRNA
4609515 4609601 - 87 157159467 EcHS_A4728 - 15 Leu tRNA
4609629 4609717 - 89 157159467 EcHS_A4729 - 15 Leu tRNA