RNAInSpace/Общие описание корреляционно-иерархического поиска: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) |
||
Строка 4:
Чтобы пояснить проблематику/сложность нахождения глобального энергетического минимума, создающей цепочкой РНК рассмотрим один вырожденный пример. Возьмем последовательность из трех нуклеотидов '''gaa'''. Для каждого нуклеотида возможны 1526 различных поворотов. Поэтому уже для такой короткой цепочки, чтобы полностью перебрать все варианты требуется порядка 2 недель 6-процессорной машины. Полный перебор не был сделан, но частичный (были отобраны 316, 196, 116 вариантов поворотов для соответствующего нуклеотида) позволил найти энергетический минимум -13.87 (1 - №496; 2 - №939; 3 - №50).
Были разработаны два достаточно простых метода, для предварительной оценки энергетического минимума.
=== Метод „Быстрое охлаждение“ ===
=== Метод ''Попарная корреляция'' ===
[[Категория:RNAFoldingAI]]
| |||