RNAInSpace/Общие описание корреляционно-иерархического поиска: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
SSJ (обсуждение | вклад) |
||
Строка 31:
Этот метод позволил найти локальный минимум в -10.91. Как видим он ближе к нашему глобальному, но тем не менее не достаточен.
Итак, в методе „Попарная корреляция“ мы можем учесть только попарные корреляции. Корреляции же всех, в данном случае 3 нуклеотидов перебрать технически не можем (слишком долго). Искать случайным образом (Монте-Карло) также бесперспективно, так как вероятность попасть именно в глобальный минимум сразу делая три поворота - крайне мала. А последовательно, что показали два выше описанных метода это сделать не возможно.
Строка 45:
Таким образом, будет перебор среди вариантов 100х100х1526, что осуществляется за несколько часов.
Такой подход, позволяет найти минимум в -12.99. Такой минимум уже очень близок к глобальному. При этом оказывается, что глобальный минимум в -13.87 менее биологически правдоподобен, чем -12.99. Это следствие того, что сама функция оценки энергии достаточно приблизительна и неточна.
| |||