RNAInSpace/Общие описание корреляционно-иерархического поиска: различия между версиями

Были разработаны два достаточно простых метода, для предварительной оценки энергетического минимума.

 

 

# Для каждого нуклеотида проверяем какой из поворотов дает наибольшее понижение энергии

Это положение соответствует энергии -9.41. Как видим, оно далеко до полученного ранее энергетического минимум (-13.87). Причина этого состоит в том, что данный метод не учитывает возможные корреляции положений двух или более нуклеотидов, попав в которые только одновременно происходит понижение энергии.

 

 

В отличии от метода „Быстрого охлаждения“, данный метод пытается учесть корреляции положений. Но так как уже для трех положений это требует значительных вычислительных затрат, данный метод перебирает только положения для 2 нуклеотидов (1526*1526 ≈ 2.3 млн.).