О детерминированном моделировании РНК-петли: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) |
||
Строка 45:
=== Комбинация применения методов ===
Исследования показали, что самый первый поворот РНК имеет определяющие значение на ход сворачивания. Так если при повороте РНК изгибается пополам в результате нахождения корреляции двух нуклеотидов, то она попадает в такие пространственные условия, что дальнейшие повороты не могут исправить рядом имеющиеся положения нуклеотидов, и весь дальнейший ход сворачивания нарушается.
Поэтому как минимум, вначале нужно определить не попарную корреляцию нуклеотидов в центре цепи РНК, а хотя бы коррелированое состояние 3-х нуклеотидов. Для этого применяется метод ''быстрого охлаждения'', но с поворотами 3-х нуклеотидов, а не одного. Затем фиксируется полученные положения 3-х нуклеотидов в центре, а остальная цепь снова "разворачивается".
Затем применяется метод «попарной корреляции». Наиболее стабильный результат получается если применять метод к ''критическим точкам'' постепенно удаляясь от центра то в одну, то в другую сторону.
== Результаты ==
| |||