О детерминированном моделировании РНК-петли: различия между версиями

Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 66:
# Методом "Быстрое охлаждение" было определено начальная позиция центра РНК-петли (4-5-6 позиции)
# Метод "Попарная корреляция" был применен к так называемому ''стволу дерева'' критических точек, т.е. следующая последовательность позиций нуклеотидов РНК-петли - 4-5, 5-6, 3-4, 6-7, 2-3, 7-8, 1-2, 8-9, 1-9 .
 
Контрольную водородную связь между 1 и 9 нуклеотидом получить не удалось, но атомы ее образующие установлены в достаточно близкие позиции. Водородная связь образуется если расстояние между донором и акцептором < 3 A, а водородный угол DHA < 20°. Нуклеотиды 1-C и 9-G образуют 3 водородные связи.
 
== Выводы и дальнейшие исследования ==