О детерминированном моделировании РНК-петли: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) |
||
Строка 70:
== Выводы и дальнейшие исследования ==
Получение петли-РНК позволяет далее применить метод „''РНК-тюнинг''“, в результате чего можно получить отдельную РНК-спираль. В отличии от стохастических методов, которые сейчас преобладают в биоинформатике, данный метод целенаправленно конструирует конечное состояние (нативное) РНК. С одной стороны, нужно понимать, что это не моделирование траектории сворачивания, но это первый шаг к этому. С другой стороны, мы получаем конечное состояние РНК, что уже само по себе, без знания траектории, позволяет исследовать ряд других областей.
Математически наши методы аналогичны задачи нелинейного программирования с ограничениями. При этом энергетическая функция является функцией минимум которой нужно найти, а водородные связи являются ограничениями. Но мы свободны не решать эту задачу математическими методами, достаточно организовать выше описанный алгоритмический поиск.
== Примечания ==
| |||