О детерминированном моделировании РНК-петли: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) |
||
Строка 67:
# Метод "Попарная корреляция" был применен к так называемому ''стволу дерева'' критических точек, т.е. следующая последовательность позиций нуклеотидов РНК-петли - 4-5, 5-6, 3-4, 6-7, 2-3, 7-8, 1-2, 8-9, 1-9 .
Контрольную водородную связь между 1 и 9 нуклеотидом получить не удалось, но атомы ее образующие установлены в достаточно близкие позиции. Водородная связь образуется если расстояние между донором и акцептором < 3 A, а водородный угол DHA < 20°. Нуклеотиды 1-C и 9-G образуют 3 водородные связи. Полученная в моделировании структура между 1 и 9 нуклеотидами удовлетворяет расстояниям между донором и акцептором (2.4-3.0 А < 3 A), но не удовлетворяет по углам (58°-76° < 20°). Но для получения грубой структуры это не принципиально, так как впоследствии был разработан метод
== Выводы и дальнейшие исследования ==
| |||