О детерминированном моделировании РНК-петли: различия между версиями

Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 4:
[[Файл:RNA_NC_003540.png|200px|right|thumb| Фрагмент рибозима [[wikia:ru.vlab:NC_003540|NC_003540]]. Его первичная структура GGGAGACCUGAAGUGGGUUUCCC. Имеет следующие водородные связи 1-23; 2-22; 3-21; 4-20; 5-19; 6-18; 7-17; 8-16]]
 
В научно-популярном очерке <ref>[[Геномика бросает вызов искусственному интеллекту]]</ref> была поставлена биоинформационная задача.: Найтинайти трехмерную структуру РНК по первичной структуре. И сделать это нужно in silico – то есть, используя компьютерное моделирование эксперимента. В качестве тестового примера взят вироидный рибозим [[wikia:ru.vlab:NC_003540|NC_003540]] с классической структурой типа “головки молотка” (Hamerhead ribozyme).
 
Наиболее близким по целям и способу моделирования является подход описанный в работе <ref name="A" />. Но качество программного обеспечения нас не устраивало, поэтому был проведен полноценный реинжиниринг [[ПО Rosetta]] в части сворачивания РНК, в результате чего было создано независимое ПО '''RNAFoldingAI''' на языке С# <ref>[[Программная разработка RNAFoldingAI]]</ref>.