О незначимости энергетической оценки при моделировании РНК: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
||
Строка 18:
Рибозим разделяется на фрагменты в соответствии со вторичной структурой L1 (ggcaccugacgucgguguc), L2 (gauccaugacaggauc) и то что остается. Фрагменты L1 и L2 собираются поотдельности, вначале формируя петлю, а затем достраивая последующий водородные связи.
Вначале получаем грубую структуру РНК-петли используя метод „Быстрое охлаждение“. В методе используется придельно упрощенная энергетическая оценка, основанная только на расчете близости водородных связей и отсутствии ковалентных связей между атомами разных нуклеотидов (естественно, за исключением связей фосфора, образующих цепь РНК). Затем применяется метод [[RNAFoldingAI/X-тюнинг|„X-тюнинг“]].
== Результаты ==
|