О незначимости энергетической оценки при моделировании РНК: различия между версиями

Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 7:
В статье «[[О детерминированном моделировании РНК-петли]]» было показано каким образом можно перейти от стохастического моделирования РНК к детерминированному. Так же там был упомянут метод [[RNAFoldingAI/X-тюнинг|„X-тюнинг“]], который целенаправленно конструирует конечное состояние (нативное) РНК. При этом он использует для получения грубой структуры РНК специальным образом видоизмененную по сравнению с работой <ref name="A"> [[Анализ статьи: Автоматизированное предсказание de novo третичной структуры РНК|Автоматизированное предсказание de novo третичной структуры РНК]]</ref> оценку энергии <ref>см. [[Анализ статьи: Целенаправленный поиск в задаче сворачивания третичной структуры РНК]]</ref>.
 
В данном исследовании была сделана попытка при конструировании РНК, основываться на такую энергетическую оценку, в которой учтено только отсутствие ковалентных связей и близость водородных связей. Для определения водородных связей должна быть известна вторичная структура РНК.
 
Был использован метод [[RNAFoldingAI/X-тюнинг|„X-тюнинг“]], чтобы получить модель третичной структуры РНК.
 
== Модельный организм ==