Промежуточные взаимодействия во время сворачивания РНК: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) мНет описания правки |
SSJ (обсуждение | вклад) мНет описания правки |
||
Строка 5:
Потому нужно идеализировать этот процесс, разложив на последовательные шаги и найдя такие принципы, которые управляют стахостичностью во время сворачивания. Такие принципы, конечно связаны с гравитацией, а в частности с гидрофобностью. Но моделировать такие процессы статистически, как это часто делают ориентируясь на минимум энергии, бесперспективно. В лучшем случае тогда можно получить только очень грубые модели, и не понять причин процесса сворачивания.
Поэтому нужно ориентироваться на такие взаимодействия, которые определяют связи между конкретными атомами. Назовем их ''точечными взаимодействиями''. Примером таких взаимодействий могут служить водородные связи, которые возникают явным образом между двумя атомами, и сильно определяют стабильность третичной структуры. Для коротких фрагментов
Во-первых, в статье «[[Сравнение двух рибозимов]]» показано, что существуют такие водородные связи, которые удерживают две петли (L1 и L2) вместе, определяя их взаимное расположение.
| |||