Промежуточные взаимодействия во время сворачивания РНК: различия между версиями

Содержимое удалено Содержимое добавлено
Строка 21:
 
* ''Hierarchical model'' (или ''Sequential model''). Имеет два подвида: (1) '''Framework model''' (Anfinsen 1972, Ptitsyn et al. 1972) <ref>(Птицын О.Б. Стадийный механизм самоорганизации белковых молекул. // Докл. АН СССР, 1973. Т.210</ref> и (2) '''Modular assembly model''' (Ptitsyn and Rashin 1973).)
** Согласно ''Framework model'' вначале начинают формироваться элементы вторичной структуры в развернутой цепи. ''Modular assembly model'' предполагает что процесс сворачивания начинается с независимого сворачивания отдельных частей молекулы белка. Но в обеих моделях, у вторичным структурам отводят центральную роль в определении пути сворачивания. Вместе эти две модели предполагают, что квазинезависимые области или подобласти белка могут свернуться в разное время, но каждое сворачивание запускает формирование вторичных структур (Ptitsyn 1987). Согласно ''Framework model'' сворачивание белка происходит в три гипотетических шага: (1) формирование вторичных структур локальными взаимодействиями при колебании развернутой цепи, (2) коллапс вторичных структур в компактную структуру при взаимодействий дальних групп с окружением среды, (3) перестановка уже компактных структур в уникальную нативную структуру.
* '''Nuclear Condensation model'''
** Из начального состояния свернутые вторичные структуры формируются начиная с образования ядра до полного процесса сворачивания. Формирование вторичной структуры соединено с третичным формированием третичной структуры и нет никаких промежуточных звеньев на пути сворачивания.