Сворачивание многоспиральной цепи РНК частный случай задачи докинга: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) |
||
Строка 8:
{{Цитата|
Основная же проблема связана с конструированием водородной связи a44 - u20. Дело в том, что наличие связей a44 - u15, и главное, связей спиралей c14-g22, c13-g23, c40-g47, c39-g48, так сильно ограничивает возможность вращения нуклеотидов между нуклеотидами u20 и a44, что невозможно занять требуемые положения никакими возможными последовательными поворотами. (см. также [[Свобода колебаний в свернутой спирали РНК]]).
В реальности же рибозим имеет требуемую свободу вращения, даже при фиксировании описанных водородных связей. Поэтому проблема состоит в том, что используется упрощенное моделирование, аналогичное применяемому в работе [2] и в целом в программном обеспечении проекта rosseta@home.
| |||