Промежуточные взаимодействия во время сворачивания РНК: различия между версиями
Содержимое удалено Содержимое добавлено
SSJ (обсуждение | вклад) |
SSJ (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
||
Строка 22:
*** Модель Шахновича предполагает, что переходное состояние сворачивания белка зависит от формирования определенного подмножества нативной структуры, названной ядром сворачивания белка. Рост ядра необходимое условие для последующего быстрого сворачивания в нативное состояние. Поиск ядра сворачивания белка занимает большое количество времени, чтобы преодолеть главный свободный энергетический барьер.
*** Ядро сворачивания белка - ограниченный фундамент, образованный из 8 - 40 контактов рассеянных вдоль последовательности белка. Это показывает, контакты ядра оба дальнего действия, так же как малая дальность (Shakhnovich 1997). Модель Шахновича признает роль двух видов остатков: 1) критические остатки, которые устанавливают большинство контактов в переходное состояние, и 2) те, которые только формируют контакты при достижении нативного состояния. Мутации критических остатков могут затронуть стабильность переходного состояния. Именно поэтому предполагается критические остатки сохраняются эволюционно (Шахнович и др. 1996). В последующих исследованиях было показано, что переходное состояние содержит определенные взаимодействия, которые не найдены в стабильном состоянии. Эти неродные контакты замедляют процесс сворачивания, не затрагивая стабильность нативного состояния.
'''В 1994 было показано, что вторичные и третичные структуры формируются параллельно''' <ref>Otzen DE, Itzhaki LS, Elmasry NF, Jackson SE, Fersht AR: Structure of the transition state for the folding/unfolding of
the barley chymotrypsin inhibitor 2 and its implications for mechanisms of protein folding. Proc Nat/Acad Sci USA 1994, 91:10422-10425.</ref>.
== Управление сворачиванием ==
| |||