Условия образования водородной связи между атомами

Водородная связь (hydrogen bonds) образуется когда:

расстояние |D-A| < dist = 3
угол D-H-A < ang = 20°

Инозин образует неоднозначные пары с аденином, гуанином и цитозином

Эта статья — часть материалов: проекта RNAFoldingAI

Пары оснований Уотсона-Крика:

C-G

N-H — O

N — H-N

O — H-N

T(U)-A

O — H-N

N-H — N

Итого без учета угла:

H-O (O-H) 1.38-1.56
H-N (N-H) 1.44-1.56

Хугстиновские пары оснований:

G-U (A-C)

N-H — O

O — H-N

Почему связи типа водородных не образуют атомы других элементов?

Силы электростатического притяжения диполей полярных связей (О-Н, N-H и т.п.) слабы и действуют лишь на малых расстояниях. Водород, обладая наименьшим атомным радиусом, позволяет сблизиться таким диполям настолько, что силы притяжения становятся заметными. Никакой другой элемент с большим атомным радиусом не способен к образованию водородных связей.

См. также

Литература