Условия образования водородной связи между атомами

Водородная связь (hydrogen bonds) образуется когда:

  1. расстояние |D-A| < dist = 3
  2. угол D-H-A < ang = 20°
Образование трех водородных связей в паре нуклеотидов GC
Образование двух водородных связей в паре нуклеотидов AT
Инозин образует неоднозначные пары с аденином, гуанином и цитозином
Эта статья — часть материалов: проекта RNAFoldingAI

Пары оснований Уотсона-Крика:

  • C-G
N-H — O
N — H-N
O — H-N
  • T(U)-A
O — H-N
N-H — N

Итого без учета угла:

  • H-O (O-H) 1.38-1.56
  • H-N (N-H) 1.44-1.56

Хугстиновские пары оснований:

  • G-U (A-C)
N-H — O
O — H-N


Почему связи типа водородных не образуют атомы других элементов?

править

Силы электростатического притяжения диполей полярных связей (О-Н, N-H и т.п.) слабы и действуют лишь на малых расстояниях. Водород, обладая наименьшим атомным радиусом, позволяет сблизиться таким диполям настолько, что силы притяжения становятся заметными. Никакой другой элемент с большим атомным радиусом не способен к образованию водородных связей.

См. также

править

Литература

править